Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 4,294,402 | 0 | C | T | 14.7% | 706.3 / 87.9 | 245 | intergenic (‑182/+27) | ytcA/yjcS | putative inner membrane DUF1656 family protein; efflux pump associated/metallo‑beta‑lactamase superfamily protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (106/103); new base T (26/10); total (132/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.88e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
TGTAGTGAATATCAATATCCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCTTCAGCGCCCCCAAAAGCGAGTGACATTAATTTGGGGTTACGATATTCACCCACAAATCGAAATTATCCAGACAGGCGATAATTTCTTCCAGTTTCGCGCCATTGCCAATAATTTTGGCTTTCTTCGCTTTTACCAGATCCGCCATTTT > CP009273/4294254‑4294551 | tGTAGTGAATATCAATATCCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCt < 2:3207498/150‑1 (MQ=255) gTAGTGAATATCAATATCCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGCtt > 1:4353102/1‑150 (MQ=255) tAGTGAATATCAATATCCATTGAAGGCGTCAGTATGGCTATTTTCTTGATGAATAAAAATAGCTTTATTCAGCCACCGCATTCATAACTTATATATTTTATTTATTAATTGGCTGTATATATTTTTAAAATAAATACTTTTGGGGGTTTc < 1:1729830/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |