Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,458,254 | T→A | 100% | V271V (GTT→GTA) | mgtA → | magnesium transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,458,254 | 0 | T | A | 97.1% | 1086.2 / 14.1 | 317 | V271V (GTT→GTA) | mgtA | magnesium transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/9); new base A (155/152); total (156/161) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.97e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 317 total aligned reads displayed.
CGCTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTGTT > CP009273/4458107‑4458400 | cGCTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACACGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAg < 2:1870851/150‑1 (MQ=255) gCTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGt > 1:1603705/1‑150 (MQ=255) cTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACTCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTg > 1:100942/1‑150 (MQ=255) tACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGa < 1:79649/150‑1 (MQ=255) tACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGa < 1:4451004/150‑1 (MQ=255) cACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCa > 2:3803630/1‑150 (MQ=255) cACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCa > 2:4556596/1‑150 (MQ=255) aCTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAg > 1:3968733/1‑150 (MQ=255) aCTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAg < 1:3620435/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGaa < 2:2871578/150‑1 (MQ=255) ccAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAg > 1:3838122/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAg < 1:4487285/150‑1 (MQ=255) ccAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAg > 2:2294953/1‑150 (MQ=255) cAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGc < 1:882400/150‑1 (MQ=255) cAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGc > 2:346714/1‑150 (MQ=255) cAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGc > 2:346688/1‑150 (MQ=255) aGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCg < 1:191304/150‑1 (MQ=255) aGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCg < 2:3039715/150‑1 (MQ=255) gCCGGAGCACAGCACTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGa < 1:1389639/150‑1 (MQ=255) gCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGa < 1:2332058/150‑1 (MQ=255) cGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGc > 2:2697639/1‑150 (MQ=255) ggAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGcc > 2:602389/1‑150 (MQ=255) gAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCg > 2:3876684/1‑150 (MQ=255) cacaGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAAt < 1:2207803/150‑1 (MQ=255) cacaGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCAGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAAt < 1:3143239/150‑1 (MQ=255) gCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCACCTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGACAGCGAGCCGAATGCCt > 2:2549607/1‑150 (MQ=255) aaTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGTCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGACttt > 1:3744942/1‑150 (MQ=255) aTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTc < 1:4448193/150‑1 (MQ=255) aTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTc < 1:3243379/150‑1 (MQ=255) aTCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTc > 2:402606/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAg > 2:2664009/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCa < 2:2812965/150‑1 (MQ=255) tGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAg > 1:95048/1‑150 (MQ=255) ggAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAgg < 2:1424359/150‑1 (MQ=255) aGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGa > 2:2594938/1‑150 (MQ=255) gTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGAt > 2:3588695/1‑150 (MQ=255) tGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATc > 1:3576310/1‑150 (MQ=255) gCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCa < 1:1411902/150‑1 (MQ=255) cGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAg > 2:4073793/1‑150 (MQ=255) cacGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCcg < 2:1828936/150‑1 (MQ=255) gCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGt > 1:1228198/1‑150 (MQ=255) gCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGt < 1:1576459/150‑1 (MQ=255) cTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTc < 1:4208271/150‑1 (MQ=255) gtTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTa < 1:4337147/150‑1 (MQ=255) ttttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAt > 1:2734932/1‑150 (MQ=255) ttttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAt < 1:1694090/150‑1 (MQ=255) ttttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAt < 1:1306713/150‑1 (MQ=255) ttttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAt < 1:3626802/150‑1 (MQ=255) ttATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgc > 2:1585001/1‑150 (MQ=255) tATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgct > 1:3756253/1‑150 (MQ=255) tATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgct < 1:2838156/150‑1 (MQ=255) aTGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGTCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGATCAGGAAAGCGAGCCGCATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgctg < 2:813043/150‑1 (MQ=255) aTGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTAtgctg > 1:2772710/1‑150 (MQ=255) gggCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATgctgct < 1:17523/150‑1 (MQ=255) gCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGa < 2:2923339/150‑1 (MQ=255) accaccGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTATCAACAAGGGATCAGCCGCGACAGTATGCTGCTGAtt > 1:4593585/1‑150 (MQ=255) gtggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCttt > 2:3216776/1‑150 (MQ=255) gtggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCttt < 2:2422532/150‑1 (MQ=255) tggtgAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTa < 1:678159/150‑1 (MQ=255) gAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCt < 2:65102/150‑1 (MQ=255) gcacggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGACTGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGa < 1:2707236/150‑1 (MQ=255) cacggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGAt < 2:1815790/150‑1 (MQ=255) cggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATgg > 2:4365550/1‑150 (MQ=255) ggcacAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGc < 1:4077322/150‑1 (MQ=255) caAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCg > 2:2241116/1‑150 (MQ=255) caAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCg < 2:247006/150‑1 (MQ=255) aGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggt < 1:4390841/150‑1 (MQ=255) cAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggtgg < 2:3690477/150‑1 (MQ=255) aaTGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggtggt > 1:3816061/1‑150 (MQ=255) aaTGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCggtggt > 1:950793/1‑150 (MQ=255) tGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGc > 2:938398/1‑150 (MQ=255) aTTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTa > 1:2114566/1‑150 (MQ=255) aTTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTa > 1:906253/1‑150 (MQ=255) tGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAAt > 2:1393636/1‑150 (MQ=255) aCAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAAt < 2:2401947/150‑1 (MQ=255) aCAGGTGCCAAGACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAAt < 2:283091/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATg > 1:1266756/1‑150 (MQ=255) aGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGTAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATgg > 2:4592534/1‑150 (MQ=255) aGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGTAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATgg > 2:4086025/1‑150 (MQ=255) gTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGtt < 2:4275653/150‑1 (MQ=255) gCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGTGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTac < 2:4443672/150‑1 (MQ=255) ccAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTaca > 2:4497873/1‑150 (MQ=255) cAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTacac < 2:4075953/150‑1 (MQ=255) aaTACCTGGTTTGGTCAACTTGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACAcc < 1:967081/150‑1 (MQ=255) aaTACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACAcc < 1:1133701/150‑1 (MQ=255) aTACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCa < 1:2928278/150‑1 (MQ=255) aTACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCa > 2:1729186/1‑150 (MQ=255) gTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGa < 2:1187724/150‑1 (MQ=255) tttGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGAc > 1:2216586/1‑150 (MQ=255) tttGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGAc > 2:3341270/1‑150 (MQ=255) tGGTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtg > 1:607707/1‑150 (MQ=255) ggTCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtgg > 1:2000891/1‑150 (MQ=255) tCAACTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACtggtg > 1:3409866/1‑150 (MQ=255) aaCTGGCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTggg > 2:3109675/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGa < 1:125174/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAgc < 1:3433695/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAgc < 1:4630134/150‑1 (MQ=255) gCGGGGAGTGTAAGTGAGAAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGATGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATTGTTACACCAAAGGCGACTTGTGGGAAgcg < 1:2501702/150‑1 (MQ=255) ggggCGTGTAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAgcggc > 2:4220622/1‑150 (MQ=255) tgtAAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTGtt > 2:2016147/1‑150 (MQ=255) | CGCTACCACTCGCCAGCCGGAGCACAGCAATCCGCTGGAGTGCGACACGCTGTGTTTTATGGGCACCACCGTGGTGAGCGGCACGGCACAAGCAATGGTGATTGCTACAGGTGCCAATACCTGGTTTGGTCAACTGGCGGGGCGTGTTAGTGAGCAGGAAAGCGAGCCGAATGCCTTTCAGCAAGGGATCAGCCGCGTCAGTATGCTGCTGATTCGCTTTATGCTGGTGATGGCACCGGTGGTGCTGTTAATCAATGGTTACACCAAAGGCGACTGGTGGGAAGCGGCGCTGTT > CP009273/4458107‑4458400 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |