| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 4,468,165 | A→G | 94.9% | intergenic (‑37/‑125) | argI ← / → rraB | ornithine carbamoyltransferase 1/protein inhibitor of RNase E |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 4,468,165 | 0 | A | G | 94.9% | 854.0 / 20.7 | 234 | intergenic (‑37/‑125) | argI/rraB | ornithine carbamoyltransferase 1/protein inhibitor of RNase E |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (7/5); new base G (106/116); total (113/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 | |||||||||||
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
ACCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTGG > CP009273/4468018‑4468311 | cGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCa > 1:1762453/1‑150 (MQ=255) gCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCaa < 2:1749665/150‑1 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt < 2:372075/150‑1 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt > 2:1546276/1‑150 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt < 2:1993601/150‑1 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt < 1:195969/150‑1 (MQ=255) cTTTTCTTATCGGCTTTCAGCGTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAt < 2:4473745/150‑1 (MQ=255) tttCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAAttt > 2:366241/1‑150 (MQ=255) cTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTtata < 2:3813753/150‑1 (MQ=255) tATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATg < 1:3756060/150‑1 (MQ=255) aTCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATgg < 2:1957326/150‑1 (MQ=255) aTCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATgg > 1:1210680/1‑150 (MQ=255) aTCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAAGTAAAGTTCAATTTATATgg > 1:369010/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgat < 1:3517965/150‑1 (MQ=255) ggCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatg < 1:1710676/150‑1 (MQ=255) ggCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatg < 1:2052550/150‑1 (MQ=255) ggCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatg > 1:4467245/1‑150 (MQ=255) cTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGgatgat < 2:2428076/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGattatt < 2:1267781/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGattatt < 2:2436978/150‑1 (MQ=255) aGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTc > 1:3135688/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAtt < 2:3514789/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCAttt < 2:755158/150‑1 (MQ=255) cgcgGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTg < 2:2678806/150‑1 (MQ=255) cgcgGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTg < 2:3059857/150‑1 (MQ=255) cgcgGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTg > 1:1005704/1‑150 (MQ=255) ggCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCaa > 2:3795100/1‑150 (MQ=255) ggCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCaa < 2:3964399/150‑1 (MQ=255) cTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGt < 1:857653/150‑1 (MQ=255) tAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTc > 1:521292/1‑150 (MQ=255) aaCTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCt > 2:3816192/1‑150 (MQ=255) agcagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCa < 2:2491942/150‑1 (MQ=255) gcagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCAt < 1:4362732/150‑1 (MQ=255) cagGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAAATTCATGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTACAATTTATATGTATGATTATTCAGTTGAAAGTCTAAAGAATa > 2:422795/1‑150 (MQ=255) agGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATaa > 2:2704381/1‑150 (MQ=255) cTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATc > 1:3094697/1‑150 (MQ=255) gTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCtt < 1:3484749/150‑1 (MQ=255) tGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTg < 2:1778671/150‑1 (MQ=255) aGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACAGAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTc < 1:428454/150‑1 (MQ=255) ttCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTcac < 1:4041527/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGt < 1:1046966/150‑1 (MQ=255) gTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAg > 1:3683030/1‑150 (MQ=255) gAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGc < 1:723450/150‑1 (MQ=255) aaTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCaa > 2:2483479/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAAt < 2:319181/150‑1 (MQ=255) aTCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAAt < 2:3617439/150‑1 (MQ=255) cGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGt > 2:1134476/1‑150 (MQ=255) gTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAg < 2:3464553/150‑1 (MQ=255) tAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgt < 1:1818317/150‑1 (MQ=255) aaTTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGNACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAgtg > 1:4278028/1‑150 (MQ=255) cAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGgtgtg < 2:1429766/150‑1 (MQ=255) ggAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGtgtgtg > 1:1037835/1‑150 (MQ=255) gAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGa > 2:3243194/1‑150 (MQ=255) gAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGa > 2:773147/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACa > 1:2609393/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACa < 2:414096/150‑1 (MQ=255) aTGCTTATGATAAAACCCGGACAAAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACaa < 2:4561140/150‑1 (MQ=255) tGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAAt < 2:1528399/150‑1 (MQ=255) cTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATaa > 2:4527103/1‑150 (MQ=255) cTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATaa > 2:1851168/1‑150 (MQ=255) ttATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAag > 2:1287105/1‑150 (MQ=255) aTGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAagag > 1:1347928/1‑150 (MQ=255) aTGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTACAATTTATATGGATGATTATTAATTTGAAAGTCTAAAGCATAAATCTTTTTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAagag > 1:2173649/1‑150 (MQ=255) tGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTTTGACAATAAGAGt > 2:1017320/1‑150 (MQ=255) gATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTa < 1:2434024/150‑1 (MQ=255) aaaCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCgg > 1:992700/1‑150 (MQ=255) aCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCa < 2:51187/150‑1 (MQ=255) aCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCa > 1:3592893/1‑150 (MQ=255) aCCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCa < 1:2774277/150‑1 (MQ=255) ccGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAgg < 2:3582170/150‑1 (MQ=255) ggACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGAc > 1:1306497/1‑150 (MQ=255) gACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACa < 1:2869013/150‑1 (MQ=255) aCATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAt < 1:2012725/150‑1 (MQ=255) aCATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAt < 1:3963374/150‑1 (MQ=255) aTAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTa > 1:796731/1‑150 (MQ=255) aGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAag > 2:2859155/1‑150 (MQ=255) gATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAaga < 2:892082/150‑1 (MQ=255) gATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAaga < 1:420028/150‑1 (MQ=255) cctcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGaa < 2:830293/150‑1 (MQ=255) ctcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACCTTAAGAGGAAt > 2:1737470/1‑150 (MQ=255) ctcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAAt > 1:3602531/1‑150 (MQ=255) ctcctGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAAt < 1:2593344/150‑1 (MQ=255) tgtgGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGACTGAGc > 1:1389828/1‑150 (MQ=255) tgtgGCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTCTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGc < 1:1840795/150‑1 (MQ=255) gCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATg < 1:2931634/150‑1 (MQ=255) gCTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACAGTAAGAGGACTGAGCCATg > 2:2921466/1‑150 (MQ=255) cTAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATgg < 2:2150903/150‑1 (MQ=255) tAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGc > 2:3739917/1‑150 (MQ=255) tAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGc > 1:2315599/1‑150 (MQ=255) tAACGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGc < 1:4092764/150‑1 (MQ=255) cGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCaaa > 1:3336859/1‑150 (MQ=255) cGCCTCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCaaa < 2:632148/150‑1 (MQ=255) tCAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCg > 2:3488006/1‑150 (MQ=255) cAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCTAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCgg > 1:4128503/1‑150 (MQ=255) cAATGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCgg > 1:1448508/1‑150 (MQ=255) aaTGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACACAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGa < 2:666755/150‑1 (MQ=255) tGAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaac > 1:1258021/1‑150 (MQ=255) gAATTAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGaaca > 2:219318/1‑150 (MQ=255) ttAAAGTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACt < 1:1882018/150‑1 (MQ=255) aaagTTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTgg < 1:3626571/150‑1 (MQ=255) | ACCGCTTTTCTTATCGGCTTTCAGCTTCGCGGCTAACTGCAGCAGGCTGTTGAGTTCAGCTGGCGTGAAATCGAGTAATTTCAGGAAATGCTTATGATAAAACCCGGACATAGATCCCTCCTGTGGCTAACGCCTCAATGAATTAAAATTCAATTTATATGGATGATTATTCATTTGCAAGTCTAAAGCATAAATCTTTGTCACAAAGGTGGAGGCAATGTCAGTGGTGTGTGACAATAAGAGTATCGGCAGGACATTAAGAGGAATGAGCCATGGCAAACCCGGAACAACTGG > CP009273/4468018‑4468311 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |