Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,586,074 | G→T | 5.1% | V90F (GTT→TTT) | yjjN → | L‑galactonate oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,586,074 | 0 | G | T | 5.1% | 1178.8 / 21.2 | 307 | V90F (GTT→TTT) | yjjN | L‑galactonate oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (155/134); new base T (7/10); total (163/144) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.31e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
CGGTACCGATATTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTATTGACCCG > CP009273/4585926‑4586223 | cGGTACCGATATTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGt < 2:1377516/150‑1 (MQ=255) gTACCGATATTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTg < 1:3934654/150‑1 (MQ=255) ccGATATTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATTTTGCCt > 1:3859446/1‑150 (MQ=255) gATATTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGTTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGt > 1:4267997/1‑150 (MQ=255) gATATTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGt > 1:117338/1‑150 (MQ=255) gATATTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGt > 1:1296969/1‑150 (MQ=255) tatTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCa < 1:4160863/150‑1 (MQ=255) atTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAg > 2:4540960/1‑150 (MQ=255) tCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCa < 2:1508151/150‑1 (MQ=255) tCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCa < 1:3557434/150‑1 (MQ=255) tCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCa < 2:216077/150‑1 (MQ=255) cATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCaa < 1:2107960/150‑1 (MQ=255) aTGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAAt < 1:4445255/150‑1 (MQ=255) tGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATg > 2:4016260/1‑150 (MQ=255) tGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATg < 1:2723810/150‑1 (MQ=255) tGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATg > 2:444612/1‑150 (MQ=255) ccTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGcc < 1:3586731/150‑1 (MQ=255) ccTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGcc < 1:54697/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCg > 1:2262809/1‑150 (MQ=255) gggTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGc > 1:4413936/1‑150 (MQ=255) gggTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGc < 1:1905112/150‑1 (MQ=255) ggTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTAAGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCg > 2:3820427/1‑150 (MQ=255) tGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATTTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCgtg < 1:215933/150‑1 (MQ=255) ggAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCgtgt > 2:3602624/1‑150 (MQ=255) aaTCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATTTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTaaa > 2:652690/1‑150 (MQ=255) tCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAg > 1:2464058/1‑150 (MQ=255) cAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGACATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGc > 2:190113/1‑150 (MQ=255) cAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGc > 2:2297507/1‑150 (MQ=255) ccATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCggg < 2:2372107/150‑1 (MQ=255) cATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGc < 1:762428/150‑1 (MQ=255) cATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGc > 1:3456559/1‑150 (MQ=255) cATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGc > 1:102499/1‑150 (MQ=255) aTTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCg > 1:3522210/1‑150 (MQ=255) ttttttATTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGt < 2:3871967/150‑1 (MQ=255) tttAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTAcc > 1:4115927/1‑150 (MQ=255) tttAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTAcc < 2:243012/150‑1 (MQ=255) ttATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCGGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTg < 1:2186103/150‑1 (MQ=255) aTCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCt > 1:405847/1‑150 (MQ=255) aTCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCt < 2:3735671/150‑1 (MQ=255) tgatttAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGaaaa < 2:1404688/147‑1 (MQ=255) ttAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAAtt < 2:1009054/150‑1 (MQ=255) tAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAAttt > 2:3204361/1‑150 (MQ=255) tAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAAttt > 2:4357582/1‑150 (MQ=255) aGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTc > 1:1266915/1‑150 (MQ=255) gCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAg < 2:3484222/150‑1 (MQ=255) tGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATTTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCAt < 2:3925651/150‑1 (MQ=255) atatGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGc < 2:3120846/150‑1 (MQ=255) atatGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGc > 2:4207658/1‑150 (MQ=255) gtgGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGc > 2:2219229/1‑150 (MQ=255) tgGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCa < 1:1362797/150‑1 (MQ=255) gggAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATc > 1:4472966/1‑150 (MQ=255) agaTTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAgg < 2:244813/150‑1 (MQ=255) aTTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGAt > 2:155814/1‑150 (MQ=255) ttgttgGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAAGTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATg < 2:2933741/150‑1 (MQ=255) gttgGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGc > 1:4324035/1‑150 (MQ=255) tgGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCgg > 2:2727642/1‑150 (MQ=255) gCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGttt < 2:927365/150‑1 (MQ=255) cTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGtttt < 2:2676579/150‑1 (MQ=255) cTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGtttt < 2:1339674/150‑1 (MQ=255) tGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTa < 1:364654/150‑1 (MQ=255) gggTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATTTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAg < 2:1734125/150‑1 (MQ=255) ggTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGt < 1:3170227/150‑1 (MQ=255) gTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTg > 1:1391305/1‑150 (MQ=255) aaaaTATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGt > 2:3041749/1‑150 (MQ=255) aaaaTATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGt > 1:2050968/1‑150 (MQ=255) aaaTATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTa < 1:906825/150‑1 (MQ=255) tatTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTAttt < 1:518345/150‑1 (MQ=255) tatTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTAttt < 1:3012326/150‑1 (MQ=255) ttGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGa < 2:1920764/150‑1 (MQ=255) cTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCg > 1:4014184/1‑150 (MQ=255) tGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGt > 2:2867649/1‑150 (MQ=255) tGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTGTTAGTGAGTATTTGAGCGt > 2:1452424/1‑150 (MQ=255) gATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTg > 1:2809705/1‑150 (MQ=255) aTCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGc < 2:1198194/150‑1 (MQ=255) cTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATTTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCg > 2:1969799/1‑150 (MQ=255) cTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCg < 1:1826081/150‑1 (MQ=255) tAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGt > 2:2019655/1‑150 (MQ=255) tGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGaa > 1:2627853/1‑150 (MQ=255) gTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACa > 2:3077614/1‑150 (MQ=255) gTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACa > 2:850356/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACAtt < 1:2557879/150‑1 (MQ=255) cAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGAGGGTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAAAAtt > 2:1983791/1‑150 (MQ=255) aGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACAttt > 2:317797/1‑150 (MQ=255) aGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACAttt > 1:172950/1‑150 (MQ=255) gCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACAtttt < 2:781804/150‑1 (MQ=255) ttGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGACCATTTTGCCCg > 2:2311034/1‑150 (MQ=255) ttGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCg < 2:867217/150‑1 (MQ=255) tGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGc > 1:1301454/1‑150 (MQ=255) gCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCa > 2:541282/1‑150 (MQ=255) tgtgATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGa > 1:2092036/1‑150 (MQ=255) gtgATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGAc < 2:209531/150‑1 (MQ=255) tgATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACg < 1:3792969/150‑1 (MQ=255) tgATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACg > 2:1232742/1‑150 (MQ=255) tCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTa > 1:2909391/1‑150 (MQ=255) cccTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTAt < 1:689096/150‑1 (MQ=255) ccTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTAtt > 2:2600229/1‑150 (MQ=255) ccTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTAATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTAtt < 2:2066543/150‑1 (MQ=255) ttATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTATTGa < 2:1674697/150‑1 (MQ=255) ttATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTATTGa > 2:1108726/1‑150 (MQ=255) ttATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTATTGa < 2:1391906/150‑1 (MQ=255) | CGGTACCGATATTCATGCCTGGGGTGGAAATCAACCATTTTTTAGTTATCCACGTGTTTTAGGCCATGAAATATGTGGGGAGATTGTTGGGCTGGGTAAAAATATTGCTGATCTTAAAAATGGTCAGCAAGTTGCTGTGATCCCTTATGTTGCCTGTCAGCAATGCCCGGCGTGTAAAAGCGGGCGTACCAATTGCTGTGAAAAAATTTCAGTCATTGGCGTGCATCAGGATGGCGGTTTTAGTGAGTATTTGAGCGTGCCGGTGGCGAACATTTTGCCCGCAGACGGTATTGACCCG > CP009273/4585926‑4586223 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |