| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 466,184 | G→T | 6.1% | M31I (ATG→ATT) | mdlB → | putative multidrug transporter subunit of ABC superfamily, ATP‑binding component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 466,184 | 0 | G | T | 6.1% | 1191.1 / 28.1 | 311 | M31I (ATG→ATT) | mdlB | putative multidrug transporter subunit of ABC superfamily, ATP‑binding component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (131/159); new base T (13/8); total (144/167) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 327 total aligned reads displayed.
ATCAACAACTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTGCCGCCGG > CP009273/466035‑466330 | aacaacTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGatgatg > 1:1840540/1‑150 (MQ=255) acTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTggg < 2:1260013/150‑1 (MQ=255) tGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGtt < 2:3611866/150‑1 (MQ=255) tGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGtt < 2:2866666/150‑1 (MQ=255) tGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGtt > 2:2536969/1‑150 (MQ=255) tGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGtt < 1:2103511/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTg < 1:800509/150‑1 (MQ=255) cggcgCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAATCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTgcggcg > 1:3451352/1‑150 (MQ=255) cggcgCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTgcggcg < 1:4358375/150‑1 (MQ=255) cggcgCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTgcggcg > 1:3043985/1‑150 (MQ=255) ggcgCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTgcggcgg > 2:1751437/1‑150 (MQ=255) cgcTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTgcggcggcg < 2:3365887/150‑1 (MQ=255) cTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCggcggcggc > 1:1323309/1‑150 (MQ=255) cTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCggcggcggc < 1:2033702/150‑1 (MQ=255) cgacgaCGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAg < 2:3919190/150‑1 (MQ=255) gacgCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTATCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGt > 2:659801/1‑150 (MQ=255) gacgCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGt > 1:4111160/1‑150 (MQ=255) gCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAg < 1:416449/150‑1 (MQ=255) gCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAg > 2:1064524/1‑150 (MQ=255) gCTACGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGAGGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAg > 2:1027654/1‑150 (MQ=255) tCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTg < 2:2671810/150‑1 (MQ=255) tCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTg < 2:4520626/150‑1 (MQ=255) tCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTg > 2:162508/1‑150 (MQ=255) gAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGcc < 1:2684044/150‑1 (MQ=255) aaaTCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCgc < 1:2187728/150‑1 (MQ=255) aaTCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCgct > 2:132097/1‑150 (MQ=255) aTCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCgctg < 1:3119696/150‑1 (MQ=255) tCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCgctgc > 1:2627963/1‑150 (MQ=255) cgcgAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCgctgct > 2:1528353/1‑150 (MQ=255) gcgAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCtt < 1:4607380/150‑1 (MQ=255) cgAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTa < 1:3258861/150‑1 (MQ=255) gaggagGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTAt > 1:4248753/1‑150 (MQ=255) aggaggCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATc > 2:2980314/1‑150 (MQ=255) aggaggCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTT‑‑‑GCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGc < 1:821397/150‑1 (MQ=255) ggaggCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGTGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCa < 2:200200/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTa < 2:4073400/150‑1 (MQ=255) aTGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATc < 1:912704/150‑1 (MQ=255) aTGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATc > 1:3630522/1‑150 (MQ=255) cGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGAc < 1:1428808/150‑1 (MQ=255) gTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACa < 1:1717366/150‑1 (MQ=255) gTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACa < 2:4421957/150‑1 (MQ=255) tAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACaa > 2:4095900/1‑150 (MQ=255) aGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAat > 2:2244954/1‑150 (MQ=255) gTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAata < 1:714306/150‑1 (MQ=255) ttAGCCATCTGTGTGCGAATCTCATTCGCCTTTTTGCGTTTGGTTCGCCGTGGCGTTAACCGCTTTGGATTTAGGTCCTGATTATGTGGGTTGCTGCGTCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTGATCGACAATATgg < 2:2733/150‑1 (MQ=255) ttAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATgg < 2:305881/150‑1 (MQ=255) ttAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATgg < 1:2996068/150‑1 (MQ=255) ttAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATgg > 1:569912/1‑150 (MQ=255) aGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTa < 2:3293823/150‑1 (MQ=255) aGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTa > 1:1464797/1‑150 (MQ=255) gCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAg < 2:2296372/150‑1 (MQ=255) gCCAACGGTGGCCGACTCTCAAGCGACTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAg < 2:1723254/150‑1 (MQ=255) aaCTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGa > 1:1681216/1‑150 (MQ=255) 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ctcAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCg < 2:2392308/150‑1 (MQ=255) aaGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTg > 2:2620185/1‑150 (MQ=255) aaGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACATGCCGtgg > 1:3735620/1‑148 (MQ=255) aGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGa < 1:4498681/150‑1 (MQ=255) ccTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGt > 2:2808659/1‑150 (MQ=255) ttAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGtt < 2:3584896/150‑1 (MQ=255) ttAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGtt < 1:289915/150‑1 (MQ=255) tAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTg < 2:304936/150‑1 (MQ=255) gCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCa < 2:2222704/150‑1 (MQ=255) gTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAgg < 2:573344/150‑1 (MQ=255) 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ccGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTgcg < 2:2022979/150‑1 (MQ=255) cGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTgcgg > 2:3291520/1‑150 (MQ=255) cGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTgcgg > 2:1003984/1‑150 (MQ=255) gTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTgcggc < 1:3952316/150‑1 (MQ=255) tGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTCGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTgcggcg > 1:1272130/1‑150 (MQ=255) 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aaCCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTg < 1:3903968/150‑1 (MQ=255) cGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGc > 1:3866424/1‑150 (MQ=255) gCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCt < 2:3609367/150‑1 (MQ=255) tGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGc > 2:3528644/1‑150 (MQ=255) tGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGtt > 1:1060721/1‑150 (MQ=255) ggTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTgc > 1:2370967/1‑150 (MQ=255) cccTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTgccg < 2:3196767/149‑1 (MQ=255) ccTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTgccgc > 2:1455323/1‑150 (MQ=255) cTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTgccgcc > 1:1516944/1‑150 (MQ=255) tgatgaTGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTGccgccg < 1:3036616/150‑1 (MQ=255) tgatgaTGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTGccgccg < 1:2759762/150‑1 (MQ=255) gatgatGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTGCCGCCgg < 1:379067/150‑1 (MQ=255) | ATCAACAACTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTGCCGCCGG > CP009273/466035‑466330 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |