| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 566,710 | G→T | 46.9% | G121V (GGC→GTC) | ybcL → | inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; secreted protein, UPF0098 family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 566,710 | 0 | G | T | 46.9% | 177.3 / inf | 266 | G121V (GGC→GTC) | ybcL | inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; secreted protein, UPF0098 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (65/76); new base T (71/54); total (136/130) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.68e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
ATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAA > CP009273/566561‑566859 | atatGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATGTTgg > 2:2383622/1‑150 (MQ=255) gATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTAt < 1:363979/150‑1 (MQ=255) aTCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGGCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATg < 1:3247173/150‑1 (MQ=255) aTCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCTAGGCCGAAATGATTTTGGCTATg < 2:564842/150‑1 (MQ=255) aTCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATg > 2:725049/1‑150 (MQ=255) aTCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATg > 2:724910/1‑150 (MQ=255) aTCCAGATGCACCTACAGGCAGGGGTTGGTGGCATTGGACTGGTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATg > 1:327316/1‑150 (MQ=255) ccAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCt < 1:259824/150‑1 (MQ=255) tGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGtt > 2:1897245/1‑150 (MQ=255) ggCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCa < 2:3753714/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCAt < 2:1468064/150‑1 (MQ=255) aGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGt < 1:1279153/150‑1 (MQ=255) aGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGt < 1:2823650/150‑1 (MQ=255) tggttggtGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtcc < 2:3023297/150‑1 (MQ=255) ggttggtGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtcct > 1:1134843/1‑150 (MQ=255) ttggtGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtcctcc < 2:2103215/150‑1 (MQ=255) ttggtGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtcctcc < 1:686536/150‑1 (MQ=255) tggtggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTcctcct < 2:1310554/150‑1 (MQ=255) tggtggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTcctcct > 2:640415/1‑150 (MQ=255) tggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTaaa > 1:2447142/1‑150 (MQ=255) tggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTaaa < 1:4481084/150‑1 (MQ=255) gCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAgg < 2:3894354/150‑1 (MQ=255) cATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGga < 2:1436053/150‑1 (MQ=255) aaatGGACTGATGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTAGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACAGCCGAATGGTGATGATCAAGGCCGAAATAATATTGTCTATGCTGTGTTTGGTGGCGCAGGTCCTCCTAAAGga > 2:4624814/4‑150 (MQ=255) ggACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATa < 2:2321556/150‑1 (MQ=255) gACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATaa < 2:4594906/150‑1 (MQ=255) gttgttAATTTTCCAGCTACAGTTACATTTTGGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGTTGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAATTGATTTTTGCTATGGTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAATGGAGATAAACca < 1:4101043/150‑1 (MQ=255) gttgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACca > 1:1614441/1‑150 (MQ=255) ttgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACcac > 2:3186145/1‑150 (MQ=255) gttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcat < 1:3776268/150‑1 (MQ=255) ttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatc < 2:3478469/150‑1 (MQ=255) ttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatc < 1:1322608/150‑1 (MQ=255) tAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatca > 2:3110071/1‑150 (MQ=255) tatTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTa < 1:930822/150‑1 (MQ=255) atTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAc < 2:3571850/150‑1 (MQ=255) atTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAc > 2:871328/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAcc < 2:1551421/150‑1 (MQ=255) tCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCa > 2:4167761/1‑150 (MQ=255) cAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGt > 2:3392146/1‑150 (MQ=255) aGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGtt > 2:1320413/1‑150 (MQ=255) gCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGttt < 2:1084767/150‑1 (MQ=255) cAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTa > 2:2946200/1‑150 (MQ=255) cAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTa > 2:1653497/1‑150 (MQ=255) aaCAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTaa > 1:457738/1‑150 (MQ=255) cAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAg > 1:2053584/1‑150 (MQ=255) aGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGt > 1:2194354/1‑150 (MQ=255) aGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGt > 1:1220721/1‑150 (MQ=255) aaCATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATg > 2:1065410/1‑150 (MQ=255) cATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATggg < 2:4301340/150‑1 (MQ=255) atatTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGc < 1:1853202/150‑1 (MQ=255) tatTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGct > 1:135271/1‑150 (MQ=255) tatTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGct > 2:3788724/1‑150 (MQ=255) atTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGctc < 2:2762271/150‑1 (MQ=255) tttGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGctct < 2:3464373/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTa > 2:4328742/1‑150 (MQ=255) gCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAATTATGGGCTCTaaa > 2:2469279/1‑150 (MQ=255) gCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTaaa > 1:3482438/1‑150 (MQ=255) cGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAAc > 1:3354369/1‑150 (MQ=255) tGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGa > 1:3582325/1‑150 (MQ=255) gCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAg < 2:3660771/150‑1 (MQ=255) gCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAg < 2:3660702/150‑1 (MQ=255) aGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAt > 2:2435736/1‑150 (MQ=255) gggAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAtt > 2:2667313/1‑150 (MQ=255) gggAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAtt < 1:1203064/150‑1 (MQ=255) ggAGACGTGATGGAACAAAACTGCCTACTGGTGCAGTTCAAGGCCGAAATGATTTTCGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAACAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTc > 1:811839/1‑150 (MQ=255) gagaCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTcc < 1:3863715/150‑1 (MQ=255) gagaCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTcc < 1:1025196/150‑1 (MQ=255) agaCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCt > 2:2909248/1‑150 (MQ=255) aCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGt > 1:1594897/1‑150 (MQ=255) aCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGt > 2:800168/1‑150 (MQ=255) gTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAg > 1:2514909/1‑150 (MQ=255) tGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTc > 1:2992432/1‑150 (MQ=255) aaCAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTaa < 1:3573858/150‑1 (MQ=255) aaCAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTaa > 1:464075/1‑150 (MQ=255) cAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACt < 1:1449820/150‑1 (MQ=255) aaaaCTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTc > 2:2382736/1‑150 (MQ=255) aCTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAg < 1:4213119/150‑1 (MQ=255) cTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGc > 2:2728830/1‑150 (MQ=255) gACTGGTGCTGTTCCAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGc < 2:4031253/150‑1 (MQ=255) aCTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCg < 1:335931/150‑1 (MQ=255) aCTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCg > 2:4391242/1‑150 (MQ=255) tGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGtt > 2:1203147/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTa > 1:449541/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTg < 1:3389962/150‑1 (MQ=255) gTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGt > 2:4185618/1‑150 (MQ=255) ttCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGtt > 1:3557440/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAATCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTta > 1:371142/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTtat < 2:3645445/150‑1 (MQ=255) aaGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTtata > 1:30295/1‑150 (MQ=255) aGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTatat < 2:3315897/150‑1 (MQ=255) ccGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCt < 2:2542155/150‑1 (MQ=255) gAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTa > 2:1099898/1‑150 (MQ=255) aaaTGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTaa < 2:2072249/150‑1 (MQ=255) aaaTGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTaa < 2:1174122/150‑1 (MQ=255) aTGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATg > 2:4478474/1‑150 (MQ=255) aTGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATg > 2:2152180/1‑150 (MQ=255) tGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGc < 1:2882221/150‑1 (MQ=255) gATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCt < 2:1523373/150‑1 (MQ=255) ttGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCtaata < 2:2169491/150‑1 (MQ=255) gCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATaaaa < 1:703516/150‑1 (MQ=255) | ATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAA > CP009273/566561‑566859 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |