Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 54,887 | G→T | 7.8% | N741K (AAC→AAA) | lptD ← | LPS assembly OM complex LptDE, beta‑barrel component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 54,887 | 0 | G | T | 7.8% | 863.9 / 31.4 | 230 | N741K (AAC→AAA) | lptD | LPS assembly OM complex LptDE, beta‑barrel component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (119/93); new base T (10/8); total (129/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
GTGGTAAATCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACGATCGGCAATTG > CP009273/54739‑55035 | gTGGTAAATCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGt > 2:3679314/1‑150 (MQ=255) tGGTAAATCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGtt < 2:1047737/150‑1 (MQ=255) tGGTAAATCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGtt > 2:1828266/1‑150 (MQ=255) ggTAAATCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTa > 2:1734926/1‑150 (MQ=255) gTAAATCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCTTTAt > 2:4550494/1‑150 (MQ=255) gTAAATCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTAt > 1:4588746/1‑150 (MQ=255) aaaTCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTCTcc > 2:3901896/1‑150 (MQ=255) aaaTCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATcc < 1:871704/150‑1 (MQ=255) aaTCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATccc > 1:378287/1‑150 (MQ=255) aaTCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATccc > 2:814894/1‑150 (MQ=255) aaTCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATccc > 2:2892032/1‑150 (MQ=255) aTCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCTTTATCCCa > 2:3937824/1‑150 (MQ=255) tCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCaa > 1:1081679/1‑150 (MQ=255) tCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCaa > 1:749236/1‑150 (MQ=255) caaATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGt > 1:3287442/1‑150 (MQ=255) aaaTCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGtt > 1:3559247/1‑150 (MQ=255) cacaAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGc < 2:518757/150‑1 (MQ=255) cacaAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGc > 2:3363568/1‑150 (MQ=255) acaAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGNACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCt > 1:4280101/1‑150 (MQ=255) acaAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCt < 2:229583/150‑1 (MQ=255) aaaGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTc > 1:2793050/1‑150 (MQ=255) aaGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTcc > 1:577462/1‑150 (MQ=255) aaGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTcc < 2:2350510/150‑1 (MQ=255) tgtTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCt < 1:3360245/150‑1 (MQ=255) gtTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTc < 1:637518/150‑1 (MQ=255) gATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAAc > 1:4040619/1‑150 (MQ=255) cGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGAc < 1:2668613/150‑1 (MQ=255) gAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGaa > 2:2555217/1‑150 (MQ=255) aaTGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAAt > 1:127449/1‑150 (MQ=255) tGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTg < 1:1250940/150‑1 (MQ=255) tCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCAt < 2:57803/150‑1 (MQ=255) gAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATag > 2:1776400/1‑150 (MQ=255) gAACGCAGCATCTCTAGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCAAATACCGCATGTTGATTATCGTTATCACACCCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGAAGCGACTTGCAAag > 2:1424044/1‑150 (MQ=255) aCGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATagca > 2:1118938/1‑150 (MQ=255) aCGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATagca > 2:3468479/1‑150 (MQ=255) cagcaTCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAgcagca > 1:4620027/1‑150 (MQ=255) agcaTCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGcagcag > 1:3420509/1‑150 (MQ=255) gcaTCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAgg > 1:1022012/1‑150 (MQ=255) gcaTCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAgg < 2:1943481/150‑1 (MQ=255) ctctTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCt > 1:4148455/1‑150 (MQ=255) ctTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGt < 2:4210611/150‑1 (MQ=255) tGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTAt > 2:2753799/1‑150 (MQ=255) tGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTAt > 1:2302454/1‑150 (MQ=255) cGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAATGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTg > 2:1520978/1‑150 (MQ=255) cGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTg < 1:3368013/150‑1 (MQ=255) cGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTg > 2:1906261/1‑150 (MQ=255) gTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGc > 2:2148551/1‑150 (MQ=255) gTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGc < 2:72335/150‑1 (MQ=255) tACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGca > 2:714625/1‑150 (MQ=255) tACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGca > 2:714888/1‑150 (MQ=255) aCCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGcac > 1:127083/1‑150 (MQ=255) ccAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCTTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCacac > 1:1413474/1‑150 (MQ=255) cGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACa > 1:2401824/1‑150 (MQ=255) tAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTCACATa > 2:2468592/1‑150 (MQ=255) tAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATa > 2:1562294/1‑150 (MQ=255) gTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCTTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATaga < 2:1271591/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCgg < 2:360663/150‑1 (MQ=255) tCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGgctt > 2:818369/1‑150 (MQ=255) ggCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGgcttgct < 1:3926835/150‑1 (MQ=255) cgAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTa < 1:4544614/150‑1 (MQ=255) cgAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTa > 1:3500500/1‑150 (MQ=255) cgAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACAGTTCAGCTTCCTCTCGTAACCGACTCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTa < 2:2229251/150‑1 (MQ=255) gAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAg > 2:2155775/1‑150 (MQ=255) gTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCAt < 2:1497896/150‑1 (MQ=255) ttCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCAtt < 2:2532554/150‑1 (MQ=255) tCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTg < 1:3243302/150‑1 (MQ=255) cGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTgg < 1:2118441/150‑1 (MQ=255) gATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGgt < 1:1179864/150‑1 (MQ=255) gATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGgt > 2:425521/1‑150 (MQ=255) gATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGgt > 2:4188081/1‑150 (MQ=255) tGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGgtgt < 2:2994809/150‑1 (MQ=255) gTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTc < 1:1611758/150‑1 (MQ=255) tAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCTTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCgt > 1:483497/1‑150 (MQ=255) aaaGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCgta > 2:3146054/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCgtag < 2:1434484/150‑1 (MQ=255) aaGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCgtag < 1:1828266/150‑1 (MQ=255) cGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCgtagtagt > 2:4571690/1‑150 (MQ=255) cGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCgtagtagt > 2:3036161/1‑150 (MQ=255) ttGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAgg > 2:2661829/1‑150 (MQ=255) tGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGc < 1:3870861/150‑1 (MQ=255) tGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCcaa < 2:3887994/150‑1 (MQ=255) atatACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAAt > 1:25044/1‑150 (MQ=255) tataCCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATg > 1:1698265/1‑150 (MQ=255) tataCCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATg < 1:3133214/150‑1 (MQ=255) ataCCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATgg > 2:2725919/1‑150 (MQ=255) taCCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGa < 1:2929754/150‑1 (MQ=255) aCCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGAc > 2:2814726/1‑150 (MQ=255) aCCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGAc > 2:2814703/1‑150 (MQ=255) ccGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGAcc < 2:2703436/150‑1 (MQ=255) ccGCATGTTGTTTATAGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTATCATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAAGGGAcc < 2:1622485/150‑1 (MQ=255) cATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAAc < 1:2488504/150‑1 (MQ=255) aTGTTGTTTATCTTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACg < 2:1016402/150‑1 (MQ=255) aTGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACg < 1:1880888/150‑1 (MQ=255) gttgttTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACGAt < 2:1191300/150‑1 (MQ=255) ttgttTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACGATc < 1:1881719/150‑1 (MQ=255) gttTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACGATCgg > 1:3684573/1‑150 (MQ=255) aTCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACGATCGGCAAt < 2:1197785/150‑1 (MQ=255) aTCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACGATCGGCAAt < 1:3056026/150‑1 (MQ=255) tCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACGATCGGCAAtt > 2:1659280/1‑150 (MQ=255) tCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACGATCGGCAAtt < 2:89231/150‑1 (MQ=255) | GTGGTAAATCAACAAATCACAAAGTGTTTTGATACGGCAGAATGTTCGAACGCAGCATCTCTTGCGTACCCAGACCGTAGTTGGAGCTCAGGCCGCGAAGTTCGATGTTAAAGCCGATTGCGTTGTCATATACCGCATGTTGTTTATCGTTATCCCAACCGTTCAGCTTCCGCTCGTAACCGACGCGAATTGCATAGCAGCAGGAGCTGTATTGCACACCTAACATAGAGTCGGCTTGCTTGTTAGCATTGGTGTCGTAGTAGTAGGCCCCAACAATGGACCAACGATCGGCAATTG > CP009273/54739‑55035 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |