| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 69,367 | 0 | C | A | 23.8% | 659.9 / 156.7 | 259 | M16I (ATG→ATT) | thiQ | thiamine, thiamine pyrophosphate ABC transporter ATPase; ThiBPQ thiamine, thiamine pyrophosphate importer |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (99/98); new base A (33/29); total (132/127) | |||||||||||
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Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
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gTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTcc > 1:629990/1‑150 (MQ=255) gTTCCACCGTTAAGCTAAAACGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTcc > 2:270488/1‑150 (MQ=255) cACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGc < 2:2295528/150‑1 (MQ=255) aCCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCt < 1:2403570/150‑1 (MQ=255) aGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAg < 2:3373326/150‑1 (MQ=255) aaaCGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGcc > 1:78074/1‑150 (MQ=255) aaaCGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGcc > 1:695649/1‑150 (MQ=255) aaCGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGCCa > 2:2763370/1‑150 (MQ=255) aaCGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGCCa > 2:2491881/1‑150 (MQ=255) aaCGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCGGGCTGCGATAGGAGCCa < 2:3610319/150‑1 (MQ=255) aaCGAATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGccc > 1:1019541/1‑149 (MQ=255) aCGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGCCaa < 1:1140079/150‑1 (MQ=255) | ATAGTTGTGTGATCTACGCCATCGATAGTCAGCGAACCGCTGGCTGGCGTCAGAAAACCGGCGATCAAATTCAGCAGGGTACTTTTACCCGCGCCGCTTGGCCCGAGGATCGCCACCTGCTCGCCGCGTTCCACCGTTAAGCTAAAACGCATCGGCAAATGGTGGTAAAGCCAGGTGATATCAGTCAGTTTTAACATTTCGCCCCGGTAGTTTTTCAATCACGGTAAACAGCAGAAAACAGAGCAGCAGCAGAATTAACGCGGTGACCGCACCGTCCTGGCTGCGATAGGAGCCAA > CP009273/69218‑69513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |