Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 725,650 | G→T | 5.0% | P204P (CCG→CCT) | rhsC → | Rhs family putative polymorphic toxin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 725,650 | 0 | G | T | 5.0% | 855.0 / 20.3 | 258 | P204P (CCG→CCT) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
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Only 100 of 271 total aligned reads displayed.
CTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCACGCAGGCGCA > CP009273/725501‑725799 | cTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTgccg < 1:1217120/150‑1 (MQ=32) tGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTgccgc > 2:571648/1‑150 (MQ=32) ggCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTgccgcc < 2:2950687/150‑1 (MQ=32) 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aGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGc > 1:1390101/1‑150 (MQ=32) ggTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCt < 1:123608/150‑1 (MQ=32) tgctgcCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTgg > 2:3919976/1‑150 (MQ=32) ctgcctgcGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTa > 1:2605109/1‑150 (MQ=32) gcctgcGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACt < 2:226546/150‑1 (MQ=32) gcctgcGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACt > 2:2435743/1‑150 (MQ=32) cctgcGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTg < 1:3053524/150‑1 (MQ=32) tgcGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGAc < 2:3444794/150‑1 (MQ=32) gcgcCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGAcc < 2:162464/150‑1 (MQ=32) cgccgcTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCa > 1:1332115/1‑150 (MQ=32) cTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCACGCAg > 2:439685/1‑150 (MQ=32) tGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCACGCAgg > 2:2984729/1‑150 (MQ=32) | CTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGCCGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGAATTCAGCGGCGAAATCACCGGCGTGACGGATGGTGCCGGGCGTCACTTCCGGCTGGTACTGACCACGCAGGCGCA > CP009273/725501‑725799 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |