| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 745,420 | C→A | 14.9% | G736C (GGT→TGT) | ybgQ ← | putative outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 745,420 | 0 | C | A | 14.9% | 1000.0 / 105.0 | 307 | G736C (GGT→TGT) | ybgQ | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (111/150); new base A (31/15); total (142/165) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.18e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
CAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCG > CP009273/745271‑745569 | cAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTAcc > 1:2198562/1‑150 (MQ=255) aGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCg < 1:1224557/150‑1 (MQ=255) aGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCg < 2:2931174/150‑1 (MQ=255) ttGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACAGGa > 1:847469/1‑150 (MQ=255) tGATTTTCAGCGACACCGCTTTACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGaa < 2:1816533/150‑1 (MQ=255) tGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGaa < 1:1496929/150‑1 (MQ=255) tGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTACCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGaa > 2:1581406/1‑150 (MQ=255) aTTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACg > 1:3546937/1‑150 (MQ=255) aTTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACg > 2:4058430/1‑150 (MQ=255) aTTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACg < 2:3332689/150‑1 (MQ=255) tCAGCGACACCGGTTAAACAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTATTGCCGCTGTCATCCTGTCGTTTATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGaa < 1:2285366/150‑1 (MQ=255) tCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGaa > 1:1091518/1‑150 (MQ=255) cAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAg < 2:2907169/150‑1 (MQ=255) acCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGa > 1:3209582/1‑150 (MQ=255) cGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGAtt < 2:2583411/150‑1 (MQ=255) gCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGAttt < 2:645589/150‑1 (MQ=255) gCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGAttt < 2:3108077/150‑1 (MQ=255) tAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTa > 2:3867362/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAAc > 2:1737603/1‑150 (MQ=255) cAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCt < 2:4346476/150‑1 (MQ=255) cAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCt < 2:1119112/150‑1 (MQ=255) cAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCt < 2:2447577/150‑1 (MQ=255) aGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTa > 2:1363841/1‑150 (MQ=255) aGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTa < 1:1384739/150‑1 (MQ=255) aGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTa > 2:2407534/1‑150 (MQ=255) ggCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTAt > 1:2426041/1‑150 (MQ=255) gCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATc < 1:1842671/150‑1 (MQ=255) tGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACAGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATcgcg > 2:3129904/1‑150 (MQ=255) gTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCgcgc > 2:34772/1‑150 (MQ=255) tccttcctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACTGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGcc < 1:2377301/150‑1 (MQ=255) ccttcctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCt < 2:529710/150‑1 (MQ=255) ccttcatCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGTGAGGGAACTGACCGCTGTCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTAACCTGAACGGGAAGCCAGTGATTAGTAACCTATCGCGcca > 1:2659258/1‑149 (MQ=255) ttcctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTc < 2:165149/150‑1 (MQ=255) ttcctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTc < 2:212535/150‑1 (MQ=255) ttcctCGCCAACCAGACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTc < 2:2052665/150‑1 (MQ=255) tcctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACAGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCa > 2:318068/1‑150 (MQ=255) cctCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCaa < 1:3650213/150‑1 (MQ=255) gCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCa < 2:2218322/150‑1 (MQ=255) ccAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACAGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCAt < 2:2464552/150‑1 (MQ=255) cAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATg > 1:332069/1‑150 (MQ=255) aaCCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGt < 1:516565/150‑1 (MQ=255) aaCCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGt < 1:338661/150‑1 (MQ=255) ccATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGttt < 2:2215413/150‑1 (MQ=255) ccATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGttt > 2:808523/1‑150 (MQ=255) aTACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTcc > 2:1267518/1‑150 (MQ=255) tACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCt > 1:2157864/1‑150 (MQ=255) aCCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCtt < 2:3224255/150‑1 (MQ=255) cACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTtgat < 1:1951486/150‑1 (MQ=255) cACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTtgat < 2:1456802/150‑1 (MQ=255) aCGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTtgatg < 2:600302/150‑1 (MQ=255) cTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACg > 1:952719/1‑150 (MQ=255) cTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACg < 2:3768983/150‑1 (MQ=255) tAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGt > 2:231000/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGtttt > 1:799375/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTc < 1:1292417/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTc < 2:1020270/150‑1 (MQ=255) ccGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCt < 2:2773633/150‑1 (MQ=255) cGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTg < 2:224580/150‑1 (MQ=255) tCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACt > 2:2359466/1‑150 (MQ=255) tCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACt < 2:1967085/150‑1 (MQ=255) tCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACAGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACt > 1:854532/1‑150 (MQ=255) tCATCCTGGCGGAGATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACt < 1:2887992/150‑1 (MQ=255) cATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTg > 1:4012889/1‑150 (MQ=255) cATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTg > 2:4133154/1‑150 (MQ=255) aTCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGt < 1:4503466/150‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGTAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGtt < 1:4200671/150‑1 (MQ=255) tCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGtt < 1:3255275/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTAc < 2:373512/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTAc < 2:3922676/150‑1 (MQ=255) tGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACAGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACg > 1:3702134/1‑150 (MQ=255) ggCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGc > 1:3131431/1‑150 (MQ=255) cGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACAGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCg > 1:3583533/1‑150 (MQ=255) gttttacGCTCCGATGGGAGTGAACTGACCGCTTGCTTTGCGTTTGATGTCGTTAACTTCTTTTCCGGTACGGGAAGGCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCGTTCAATCCTTGTTTCCTTGTTGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTc < 1:480705/144‑1 (MQ=255) atCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCggg > 1:4470159/1‑150 (MQ=255) ccGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTa < 2:4210530/150‑1 (MQ=255) cGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGtcat > 1:2784144/1‑150 (MQ=255) gaggggagggAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGtcatt > 1:1569222/1‑150 (MQ=255) aggggagggAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGtcattc < 2:2445721/150‑1 (MQ=255) gggagggaACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGtcattcat > 2:3946559/1‑150 (MQ=255) gagggaACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGt > 1:4300455/1‑150 (MQ=255) gagggaACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGt > 1:670386/1‑150 (MQ=255) gaACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCAc < 1:772219/150‑1 (MQ=255) tGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGcc > 1:2611722/1‑150 (MQ=255) aCCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACAGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCAc < 2:4477203/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGt > 1:2969669/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGt > 2:729979/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGt < 1:1594770/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTg < 2:1934360/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTgg > 1:3907820/1‑150 (MQ=255) gTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGt < 2:4543536/150‑1 (MQ=255) gTATGAGGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTACCCTCTCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGt < 2:273546/150‑1 (MQ=255) atgatgACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTaa < 2:117690/150‑1 (MQ=255) tgatgaCGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAAc < 1:1986800/150‑1 (MQ=255) cGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGaaa > 1:3592566/1‑150 (MQ=255) cGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGaaa < 1:3852581/150‑1 (MQ=255) gTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAAt < 2:3091628/150‑1 (MQ=255) gTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAAt > 2:3393591/1‑150 (MQ=255) ttAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATc > 1:3758992/1‑150 (MQ=255) aaCGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCaa < 2:2644916/150‑1 (MQ=255) aaCGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCaa > 1:2544121/1‑150 (MQ=255) | CAGTTGATTTTCAGCGACACCGCTTAACCAGGCATGTCCTTCCTCGCCAACCATACCCACGCTAATGCCGCTGTCATCCTGGCGGATATCCGCACCGAGGGGAGGGAACTGACCGCTGGCGTTGCGTATGATGACGTTAACGTCTTTACCGGAACGGGAAGCCAGTGATTTGTAACCTATCGCGCCTTCAATCCATGTTTCCTTGATGACGTTTTCTGCAACTGTTACGCCGTCGGGTAAGTCATTCATGTTCACCGCCACGGTGGAAGGCTGGTAACTGGAAATCAACGGCACCACCG > CP009273/745271‑745569 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |