Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,055,617 | 0 | A | T | 8.3% | 898.3 / 56.0 | 277 | A302A (GCA→GCT) | torA | trimethylamine N‑oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit |
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Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
CAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGCGGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCGAAAGATGCCGCATGGGCTGAAAAACTGACCGGCATTGATGC > CP009273/1055468‑1055766 | cTAAAAGCGACAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGCGGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACAt < 1:1566952/150‑1 (MQ=255) tAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGCGGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATa > 2:2334763/1‑150 (MQ=255) aaaaGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGCGGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATAc < 1:635714/150‑1 (MQ=255) 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cTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCGAAAGATGCCGCATGGGCTGAAAAACTGAcc < 2:596049/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGGTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGACAGACGGTCAGCCGAAAGATGCCGCATGGGCTGAAAAACTGAcc < 2:1640243/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCGAAAGATGCCGCATGGGCTGAAAAACTGACCg < 1:1311350/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCGAAAGATGCCGCATGGGCTGAAAAACTGACCg < 2:2396908/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCGAAAGATGCCGCATGGGCTGAAAAACTGACCgg < 1:2296521/150‑1 (MQ=255) 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cacaTACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCGAAAGATGCCGCATGGGCTGAAAAACTGACCGGCATTGATg > 1:3115145/1‑150 (MQ=255) acaTACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCGAAAGATGCCGCATGGGCTGAAAAAATGACCGGCATGTATGc > 2:1706147/1‑150 (MQ=255) | CAGCTAAAAGCGAAAGTCGCCGCCGGTGAAATTGAGGTCATCAGCATCGATCCGGTTGTCACATCCACCCATGAGTATCTGGGGCGCGAGCATGTGAAGCACATTGCGGTTAACCCGCAAACTGACGTGCCGCTGCAACTGGCGCTGGCACATACGCTGTACAGTGAAAACCTGTACGACAAAAACTTCCTTGCTAACTACTGTGTGGGTTTTGAGCAGTTCCTGCCGTATCTGCTGGGTGAGAAAGACGGTCAGCCGAAAGATGCCGCATGGGCTGAAAAACTGACCGGCATTGATGC > CP009273/1055468‑1055766 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |