| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 1,172,212 | C→A | 13.5% | S46S (TCC→TCA) | lolD → | outer membrane‑specific lipoprotein transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 1,172,212 | 0 | C | A | 13.5% | 738.3 / 64.4 | 220 | S46S (TCC→TCA) | lolD | outer membrane‑specific lipoprotein transporter subunit |
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Only 100 of 221 total aligned reads displayed.
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tCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGAACTGCGCAACCAGAAGCTGGGCTTTATTTATCAGttt < 2:4253964/150‑1 (MQ=255) tCCGGTAAAAGTACCTGGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGAGACGCCACCCTCCGGCGATGTGATTTTTACTGGTCCGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGAACTGCGCAACCAGAAGCTGGGCTTTATTTATCAGttt < 2:3888807/150‑1 (MQ=255) | GGCTTTACGTTATGAATAAGATCCTGTTGCAATGCGACAACCTGTGCAAACGCTATCAGGAAGGCAGTGTGCAAACCGATGTGCTGCACAATGTCAGTTTCAGCGTCGGCGAAGGTGAAATGATGGCGATCGTCGGTAGCTCTGGTTCCGGTAAAAGTACCTTGCTGCACCTGCTGGGCGGGCTGGATACGCCAACCTCCGGCGATGTGATTTTTAATGGTCAGCCAATGAGCAAACTGTCGTCGGCAGCGAAAGCTGAACTGCGCAACCAGAAGCTGGGCTTTATTTATCAGTTTC > CP009273/1172064‑1172360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |