| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 102,736 | C→A | 6.4% | I315I (ATC→ATA) | ftsZ → | GTP‑binding tubulin‑like cell division protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 102,736 | 0 | C | A | 6.4% | 1052.2 / 29.5 | 274 | I315I (ATC→ATA) | ftsZ | GTP‑binding tubulin‑like cell division protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (160/96); new base A (10/8); total (170/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
GCGGGCTTCGACCTGCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAAC > CP009273/102587‑102885 | gcggGCTTCGACCTGCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATc < 2:770492/150‑1 (MQ=255) gggCTTCGACCTGCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCgg > 2:2482212/1‑150 (MQ=255) tCGACCTGCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATgg < 1:2465059/150‑1 (MQ=255) 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gTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTc > 2:323294/1‑150 (MQ=255) gTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTc > 2:1804950/1‑150 (MQ=255) aaCCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGt > 1:169546/1‑150 (MQ=255) aaCCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGt > 1:3454384/1‑150 (MQ=255) aaCCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGt < 1:3290941/150‑1 (MQ=255) aaCCGTTGTTGCGACAGGTATAGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTTACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGt < 2:2937756/150‑1 (MQ=255) aCCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTg > 1:1085922/1‑150 (MQ=255) ccGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGa < 2:1373455/150‑1 (MQ=255) gttgttGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAAt < 1:3442408/150‑1 (MQ=255) tgttgCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCTCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGATCAGAAGCCGGATGCTAAAGTCGTGAATGa > 2:892826/1‑150 (MQ=255) tgttgCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGa < 1:4259454/150‑1 (MQ=255) tgCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACaa > 2:605694/1‑150 (MQ=255) cGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATg > 2:2303954/1‑150 (MQ=255) cGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATg > 1:2172325/1‑150 (MQ=255) cGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATg < 2:3328898/150‑1 (MQ=255) tATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCa > 2:471685/1‑150 (MQ=255) cGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAAc < 2:2099027/150‑1 (MQ=255) | GCGGGCTTCGACCTGCGTCTGGATGAGTTCGAAACGGTAGGTAACACCATCCGTGCATTTGCTTCCGACAACGCGACTGTGGTTATCGGTACTTCTCTTGACCCGGATATGAATGACGAGCTGCGCGTAACCGTTGTTGCGACAGGTATCGGCATGGACAAACGTCCTGAAATCACTCTGGTGACCAATAAGCAGGTTCAGCAGCCAGTGATGGATCGCTACCAGCAGCATGGGATGGCTCCGCTGACCCAGGAGCAGAAGCCGGTTGCTAAAGTCGTGAATGACAATGCGCCGCAAAC > CP009273/102587‑102885 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |