| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,429,517 | G→T | 14.5% | I120I (ATC→ATA) | uspF ← | stress‑induced protein, ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,429,517 | 0 | G | T | 14.5% | 1004.3 / 96.9 | 300 | I120I (ATC→ATA) | uspF | stress‑induced protein, ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (105/151); new base T (13/31); total (118/182) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 314 total aligned reads displayed.
GGATTAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTG > CP009273/1429369‑1429666 | ggATTAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGa < 1:2845006/150‑1 (MQ=255) gATTAGAGGGGAAATTGTCTGCACATTTGCGAATTGAATCAAAAAGCACGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGat < 2:1541907/150‑1 (MQ=255) gATTAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGat < 1:530064/150‑1 (MQ=255) aTTAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGata > 1:1307023/1‑150 (MQ=255) ttAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGatat > 1:3322607/1‑150 (MQ=255) agagGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATcc < 1:919812/150‑1 (MQ=255) agagGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATcc < 2:1317276/150‑1 (MQ=255) agagGGGAAAACGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATcc < 1:3260848/150‑1 (MQ=255) gagGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCg < 1:4209028/150‑1 (MQ=255) agGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCgg > 1:1206765/1‑150 (MQ=255) ggggAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGt > 2:436162/1‑150 (MQ=255) gggAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTc < 1:4506745/150‑1 (MQ=255) gggAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTc < 2:1052392/150‑1 (MQ=255) aaaTGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATg < 2:1243722/150‑1 (MQ=255) aaTGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATgg < 2:1738241/150‑1 (MQ=255) tGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGa < 1:608820/150‑1 (MQ=255) gTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGaa > 1:4157134/1‑150 (MQ=255) cacaTTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAat > 2:641266/1‑150 (MQ=255) caTTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAatga < 2:2301559/150‑1 (MQ=255) aTTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAatgat > 2:764367/1‑150 (MQ=255) tttGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAatgatg > 2:653631/1‑150 (MQ=255) tttGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAatgatg < 1:789564/150‑1 (MQ=255) tGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATgatgat < 2:3705161/150‑1 (MQ=255) gCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATc < 2:1520297/150‑1 (MQ=255) gCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATc > 1:4400625/1‑150 (MQ=255) gCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATc > 1:2075332/1‑150 (MQ=255) cGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCa < 2:1264182/150‑1 (MQ=255) tCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCgg < 2:2824420/150‑1 (MQ=255) cAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCggg > 1:3847678/1‑150 (MQ=255) cAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCggg < 2:1364567/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCgggg < 1:3107201/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCgggg > 2:2369892/1‑150 (MQ=255) aaaaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTCGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCgggg > 1:3572840/1‑150 (MQ=255) aaaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGa < 1:318882/150‑1 (MQ=255) aaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCTGATAAGTGGTGATATCCGGTCGAGGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAt > 2:3581474/1‑150 (MQ=255) aaaGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAt < 1:241123/150‑1 (MQ=255) gCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAtctt > 1:3363291/1‑150 (MQ=255) gCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAtctt < 2:540199/150‑1 (MQ=255) cccGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAtcttc < 2:3308359/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGAtcttct < 1:3910121/150‑1 (MQ=255) cGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATcttctt > 2:4591186/1‑150 (MQ=255) gcagcaATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCttcttc > 2:2087870/1‑150 (MQ=255) aTGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAAt > 1:2027482/1‑150 (MQ=255) gtgCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTc < 2:3564068/150‑1 (MQ=255) gCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCa < 1:760574/150‑1 (MQ=255) gCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAAt < 1:2794073/150‑1 (MQ=255) cGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATg < 2:2484966/150‑1 (MQ=255) cGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATg > 2:2775487/1‑150 (MQ=255) cGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATg < 2:2155336/150‑1 (MQ=255) gTTTGTGTCAGCGCACAACCAGCTCGGAGCACTATGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGTGCAGATAAGTGTTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGTATCTTCTTCGCCAATTCCAGAAttc < 2:622724/150‑3 (MQ=255) gTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATgt > 2:2223171/1‑149 (MQ=255) gTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGc < 1:1261405/150‑1 (MQ=255) gtgtCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTc < 2:2892639/150‑1 (MQ=255) tCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCttt < 1:2665998/150‑1 (MQ=255) tCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCttt < 2:4544693/150‑1 (MQ=255) tCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCttt < 2:1836863/150‑1 (MQ=255) aGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTgg > 2:3196223/1‑150 (MQ=255) cACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTc < 1:1609175/150‑1 (MQ=255) cACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTc < 1:2179357/150‑1 (MQ=255) cACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTc > 1:4051550/1‑150 (MQ=255) aGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACAt < 1:1767297/150‑1 (MQ=255) gCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATg < 2:1921261/150‑1 (MQ=255) gCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATg > 2:313955/1‑150 (MQ=255) aCTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGa < 2:3482619/150‑1 (MQ=255) ctctGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGAc < 1:4494331/150‑1 (MQ=255) tGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATg < 1:1722614/150‑1 (MQ=255) tGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCAct < 2:658306/150‑1 (MQ=255) tGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCAct > 2:829742/1‑150 (MQ=255) aCTACAGCTGCGGTGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCg > 2:1390890/1‑150 (MQ=255) aCTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCg < 2:3863244/150‑1 (MQ=255) aCTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCg > 2:4356392/1‑150 (MQ=255) aGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTgg > 1:2968934/1‑150 (MQ=255) aGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTgg < 1:1001810/150‑1 (MQ=255) gcggcgTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGt > 1:1980492/1‑150 (MQ=255) cggcgTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGtt < 1:1456171/150‑1 (MQ=255) ggcgTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCGTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGttt < 1:3670986/150‑1 (MQ=255) cgTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaa > 2:1571308/1‑150 (MQ=255) gTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaaa < 2:4261075/150‑1 (MQ=255) gTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaaa < 2:865898/150‑1 (MQ=255) gTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaaa > 1:4011549/1‑150 (MQ=255) ttGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAt > 2:2665964/1‑150 (MQ=255) ttGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAt < 2:1627464/150‑1 (MQ=255) tGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAtt > 2:1137307/1‑150 (MQ=255) gAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAtttt > 1:953625/1‑150 (MQ=255) aaCCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAttttt < 1:2284711/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTaa > 2:3179240/1‑150 (MQ=255) gCAGATAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGa < 2:2978906/150‑1 (MQ=255) gCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGa < 2:2103696/150‑1 (MQ=255) aGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtc > 1:2486287/1‑150 (MQ=255) aGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtc > 1:3780600/1‑150 (MQ=255) aGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtc < 2:4480918/150‑1 (MQ=255) tAAGTGGTTATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATctct < 2:3329307/150‑1 (MQ=255) acgtggtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATATTCTTCGCCAATTACAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCtt > 1:10073/3‑150 (MQ=255) aaGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCtt < 2:4613164/150‑1 (MQ=255) aGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTc > 2:4040966/1‑150 (MQ=255) aGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTc > 1:2558918/1‑150 (MQ=255) aGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTc < 1:1141099/150‑1 (MQ=255) gtggttATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTcc < 2:3937098/150‑1 (MQ=255) gtggtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTcc < 2:3365967/150‑1 (MQ=255) tgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGtt < 2:3058333/150‑1 (MQ=255) | GGATTAGAGGGGAAAATGTCAGCACATTTGCGAAATGAATCAAAAAGCCCGCAGCAATGTGCGGGCGTTAGTGTCAGCGCACAACCAGCACGGAGCACTCTGCGTGACGCACTACAGCTGCGGCGTTGGAACCGAGCAGATAAGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTG > CP009273/1429369‑1429666 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |