Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,508,681 | C→A | 12.3% | F198L (TTC→TTA) | ydcU → | putative spermidine/putrescine transporter subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,508,681 | 0 | C | A | 12.3% | 913.1 / 69.9 | 260 | F198L (TTC→TTA) | ydcU | putative spermidine/putrescine transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (115/113); new base A (13/19); total (128/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 |
Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
AAAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTAC > CP009273/1508532‑1508830 | aGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCAt > 2:534164/1‑150 (MQ=255) aGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCAt > 2:3593363/1‑150 (MQ=255) gCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATcc < 1:1953297/150‑1 (MQ=255) gTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTg > 1:17460/1‑150 (MQ=255) gTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTg < 1:4469969/150‑1 (MQ=255) gTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTg < 1:3668139/150‑1 (MQ=255) ggCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGcc < 1:4113982/150‑1 (MQ=255) tCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGt > 1:3256988/1‑150 (MQ=255) cAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGtt < 2:4246986/150‑1 (MQ=255) tttACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAggcggc > 2:3086844/1‑150 (MQ=255) tttACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAggcggc < 1:262031/150‑1 (MQ=255) ttACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGgcggcg < 1:3448389/150‑1 (MQ=255) caTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAg > 1:3588295/1‑150 (MQ=255) caTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAg < 1:2576499/150‑1 (MQ=255) aTCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGc > 2:1604596/1‑150 (MQ=255) tCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCg < 1:4164837/150‑1 (MQ=255) cTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGt > 1:3078728/1‑150 (MQ=255) ttGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGtt < 2:2806781/150‑1 (MQ=255) cTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTgccg > 1:1344127/1‑150 (MQ=255) tGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTgccgc > 2:3233081/1‑150 (MQ=255) ggAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTgccgcc > 2:4165689/1‑150 (MQ=255) aCCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTc > 1:1523308/1‑150 (MQ=255) ccACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCa < 1:1605932/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATATGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGAGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCAtt > 2:397249/1‑150 (MQ=255) gctgACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCAttgtt < 2:2535291/150‑1 (MQ=255) aCTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAg > 2:1024555/1‑150 (MQ=255) tGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGc < 2:664721/150‑1 (MQ=255) gCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCg < 2:3446808/150‑1 (MQ=255) cGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGt < 1:2429710/150‑1 (MQ=255) gTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTc > 2:2418379/1‑150 (MQ=255) gTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTc > 2:1290239/1‑150 (MQ=255) ttCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCg < 2:3767843/150‑1 (MQ=255) tCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCgg < 2:4568713/150‑1 (MQ=255) tCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCgg > 1:1732688/1‑150 (MQ=255) cTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCt > 1:1436909/1‑150 (MQ=255) ttACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTg < 2:2049166/150‑1 (MQ=255) cATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGAtc > 1:4128704/1‑150 (MQ=255) ttACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGAtctc < 1:3010353/150‑1 (MQ=255) tACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCg > 2:79631/1‑150 (MQ=255) tACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCg > 2:428104/1‑150 (MQ=255) tACCTGCAGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCg > 1:1132298/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGgc < 1:2718208/150‑1 (MQ=255) cTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGGTGCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCTTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCTgcg > 1:3286365/1‑150 (MQ=255) ggTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTGCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACg > 2:4401368/1‑150 (MQ=255) gggCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTcc < 2:3827987/150‑1 (MQ=255) ggAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGa > 1:1348362/1‑150 (MQ=255) aaaTACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACa > 1:4177950/1‑150 (MQ=255) aaaTACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACa > 2:1527900/1‑150 (MQ=255) aaaTACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGGCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACa > 2:3844382/1‑150 (MQ=255) aaTACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACaa > 2:751877/1‑150 (MQ=255) tACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAAc < 1:1011195/150‑1 (MQ=255) tACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAAc < 2:3719895/150‑1 (MQ=255) cTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCttt > 2:1222670/1‑150 (MQ=255) gTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTTTTTCTCAATATCAGGTTGCCGTTCATTAACCAGCCCCTTCAGGCGCCGCTATAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTTCAGTCGTCGGCTGATATAGGCGCACCTCCACGACAAAACTTTCg > 1:3250787/1‑150 (MQ=255) gTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCg < 1:779997/150‑1 (MQ=255) cAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCt < 1:2077906/150‑1 (MQ=255) aaCTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTa > 2:3338841/1‑150 (MQ=255) aaCTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTa < 2:1847588/150‑1 (MQ=255) aCTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTAt < 1:2237976/150‑1 (MQ=255) aCTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTAt < 1:1906272/150‑1 (MQ=255) tCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTAtgtg < 2:3154408/150‑1 (MQ=255) tCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTAtgtg < 2:2626825/150‑1 (MQ=255) tCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTAtgtg < 2:1141805/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgc > 2:1460849/1‑150 (MQ=255) ggCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgc > 2:2257291/1‑150 (MQ=255) ggCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCATTCGCTATGTGGtgc > 2:3342917/1‑150 (MQ=255) gCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgct < 1:165726/150‑1 (MQ=255) gCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgct < 1:920124/150‑1 (MQ=255) tGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGtgctgc > 2:1484610/1‑150 (MQ=255) gggCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCg < 1:4332169/150‑1 (MQ=255) cgcTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTg < 2:3256988/150‑1 (MQ=255) tCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAAt > 1:1508237/1‑150 (MQ=255) ggTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATccc < 1:2963222/150‑1 (MQ=255) ggTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATccc > 1:2637102/1‑150 (MQ=255) gtgtTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCg < 1:858364/150‑1 (MQ=255) ttCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCACTCCCGGGTa > 2:3538041/1‑150 (MQ=255) ttCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTa > 1:492763/1‑150 (MQ=255) tctcTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTAt < 2:694386/150‑1 (MQ=255) tataTCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGcc < 2:1301926/150‑1 (MQ=255) atatCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCg > 2:2252580/1‑150 (MQ=255) atatCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCg > 1:359555/1‑150 (MQ=255) atatCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCg > 2:2956681/1‑150 (MQ=255) tatCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGc < 1:4054318/150‑1 (MQ=255) tatCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGc > 1:1179014/1‑150 (MQ=255) atCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCt < 1:2617059/150‑1 (MQ=255) atCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCt < 1:740754/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTg < 2:1586330/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTg > 1:4530231/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTgg > 2:2915756/1‑150 (MQ=255) tGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGc < 1:4352821/150‑1 (MQ=255) tGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGc < 1:2025680/150‑1 (MQ=255) tGGTTGCCGTTAATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGc < 1:3339635/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACCAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGctc > 1:3912456/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGctc > 2:2164866/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGctc > 2:235271/1‑150 (MQ=255) ttGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTTGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGctct < 2:3067292/150‑1 (MQ=255) ccGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATc < 2:171713/150‑1 (MQ=255) cGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGGTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCt < 1:2356908/150‑1 (MQ=255) gTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCACTCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATcgt > 1:1658029/1‑148 (MQ=255) cATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTAc < 1:4401258/150‑1 (MQ=255) | AAAGATGGCGTGGCTCAGTGGTTTTTACAACATCTTGGGCTGGAACCACTGCTGACTGCGTTCCTTACATTACCTGCGGTGGGCGGAAATACGCTGTCAACTTCCGGGCTGGGGCGCTTTCTGGTGTTTCTCTATATCTGGTTGCCGTTCATGATCCTGCCCGTTCAGGCGGCGCTTGAGCGTTTGCCGCCGTCATTGTTGCAGGCGTCGGCTGATCTCGGCGCACGTCCACGACAAACCTTTCGCTATGTGGTGCTGCCGCTGGCAATCCCGGGTATTGCCGCTGGCTCTATCTTTAC > CP009273/1508532‑1508830 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |