Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,551,406 | 0 | T | A | 5.9% | 885.2 / 32.6 | 264 | E297V (GAG→GTG) | ddpF | D,D‑dipeptide permease system, ATP‑binding component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (132/116); new base A (8/8); total (140/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
CCGGTCTCTCAGGTACTGAAAGCGGAAATTACGCTGGATTACCAGTTGAAATCGTAAAGCATTGCCGGATGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCACCGGAGCTCACGTCCGTCCTCCCTTATTGCTAATGATTGCCGGACTTCACATCCGTGGGTTGCCAGCGGGCAACGTTCGTAGAAAAAACAGCCTTGCGGCAACGTGCGGTTTCCCGGCAGATCCGTTTTACGTAATGCCCATTCTTCCTCCAGCGGTTTATCAATGGCG > CP009273/1551257‑1551555 | ccGGTCTCTCAGGTACTGAAAGCGGAAATTACGCTGGATTACCAGTTGAAATCGTAAAGCATTGCCGGATGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCACCGGAGCTCACGTCCGtcct < 1:3309971/150‑1 (MQ=255) cGGTCTCTCAGGTACTGAAAGCGGAAATTACGCTGGATTACCAGTTGAAATCGTAAAGCATTGCCGGATGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCACCGGAGCTCACGTCCGtcctc < 2:2145953/150‑1 (MQ=255) cGGTCTCTCAGGTACTGAAAGCGGAAATTACGCTGGATTACCAGTTGAAATCGTAAAGCATTGCCGGATGACGCGTCAGGCGCGTGAATGCCTGATGCGTTGTTAGCATCTCTACAGCGCCCGCCAGCACCGGAGCTCACGTCCGtcctc < 1:1571236/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |