Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,576,844 | 0 | G | A | 54.1% | 51.6 / inf | 270 | intergenic (‑63/+339) | ydeN/ydeO | putative Ser‑type periplasmic non‑aryl sulfatase/UV‑inducible global regulator, EvgA‑, GadE‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (61/63); new base A (77/69); total (138/132) | |||||||||||
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Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
CGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCA > CP009273/1576695‑1576992 | cGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATg < 1:4227272/150‑1 (MQ=255) aTGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATATaa < 2:2941603/150‑1 (MQ=255) tGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATATAAg > 1:3734021/1‑150 (MQ=255) 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tAAGTGGATATAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGAAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTACATAAAGCGTTGACATTACGTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATaaa > 1:247542/1‑150 (MQ=255) aGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAatt > 1:2816366/1‑150 (MQ=255) | CGCATGAGCAGCAAATGCAGCCATACCAGATGCCAGTATCAAAGATATCGAGGTACTTACGACACTTTTCTTTAATGCAGACTTCATAAATGTTCCTCTTCTTATTGTACTTAATTCCAAAGTAATTTTACGAAGAGAAATAAGTGGATGTAAGTGAAGTTAGTCACATAAAGAGATAGCAGATTTAGCTAAAAAAAGGGAAAAAACAGTCCATAAAGCGTTGACATTACTTTCTGTTCTATTAAGTAATTTCTCGCCGATAAACAACTAATTTATTGATATTTAATAAATTATTGCA > CP009273/1576695‑1576992 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |