Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,593,900 | G→T | 41.7% | N189K (AAC→AAA) | lsrK ← | autoinducer‑2 (AI‑2) kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,593,900 | 0 | G | T | 41.7% | 328.5 / inf | 289 | N189K (AAC→AAA) | lsrK | autoinducer‑2 (AI‑2) kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (98/70); new base T (64/57); total (162/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 295 total aligned reads displayed.
CAGAGTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTGTCC > CP009273/1593751‑1594049 | gagTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCttt > 2:3120060/1‑150 (MQ=255) gagTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCttt > 2:1163811/1‑150 (MQ=255) agTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTa > 2:2830223/1‑150 (MQ=255) agTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTa < 1:780901/150‑1 (MQ=255) gTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTag < 2:4133954/150‑1 (MQ=255) gTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTCTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTag > 1:459681/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTaga < 1:1809188/150‑1 (MQ=255) gccgcTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGa < 2:1845858/150‑1 (MQ=255) ttGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCAc < 1:4549839/150‑1 (MQ=255) aCTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAg < 1:1451201/150‑1 (MQ=255) cTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGACGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGt > 2:2489515/1‑150 (MQ=255) ttACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGtt > 1:3063275/1‑150 (MQ=255) tACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTc > 2:4419989/1‑150 (MQ=255) tACCACGCCCAGCAAGGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTc < 1:1074859/150‑1 (MQ=255) aGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGc < 1:1053581/150‑1 (MQ=255) cAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCat > 1:3393529/1‑150 (MQ=255) aTGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCatat < 1:861584/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgcc < 1:2951413/150‑1 (MQ=255) cGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgcca < 2:832661/150‑1 (MQ=255) gTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccagc > 2:645397/1‑150 (MQ=255) ttCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccagcca < 2:1923052/150‑1 (MQ=255) ttCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGgccagcca > 2:4182152/1‑150 (MQ=255) tttGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTc > 2:161577/1‑150 (MQ=255) ttGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCg > 1:1922215/1‑150 (MQ=255) gACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCt < 2:1009845/150‑1 (MQ=255) aCAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTg < 2:316869/150‑1 (MQ=255) aCAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTg > 2:1661120/1‑150 (MQ=255) cAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGa > 1:4408330/1‑150 (MQ=255) aGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGAt > 2:1472834/1‑150 (MQ=255) aGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGAt > 2:2648017/1‑150 (MQ=255) agaaagaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCAt < 1:3089243/150‑1 (MQ=255) agaaagaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCAt < 2:3781423/150‑1 (MQ=255) gaaagaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATg > 2:184932/1‑150 (MQ=255) agaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTg > 1:4214494/1‑150 (MQ=255) gaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGa < 2:1726488/150‑1 (MQ=255) gaaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGa < 1:2032916/150‑1 (MQ=255) aaTATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGAt > 2:2562309/1‑150 (MQ=255) atatCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATg > 1:1859895/1‑150 (MQ=255) atatCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATg < 1:2311517/150‑1 (MQ=255) atCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGt > 2:2171890/1‑150 (MQ=255) tCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGtt > 2:872154/1‑150 (MQ=255) cGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTg < 2:3905774/150‑1 (MQ=255) ggCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGa < 2:4287091/150‑1 (MQ=255) ggCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGa > 2:4320354/1‑150 (MQ=255) ggCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGa > 1:915738/1‑150 (MQ=255) cACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATg > 2:2926934/1‑150 (MQ=255) cACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATg > 2:49774/1‑150 (MQ=255) cACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATg < 2:4246905/150‑1 (MQ=255) ccagccaTATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACgg < 2:930484/150‑1 (MQ=255) ccagccaTATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACgg > 1:3996291/1‑150 (MQ=255) cagccaTATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGt < 2:753729/150‑1 (MQ=255) cagccaTATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGt > 1:1694341/1‑150 (MQ=255) agccaTATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTa < 1:2881779/150‑1 (MQ=255) atatCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAata > 1:1823426/1‑150 (MQ=255) atatCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAata > 1:4122092/1‑150 (MQ=255) tatCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAatat > 1:1227316/1‑150 (MQ=255) atCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATc > 2:1971905/1‑150 (MQ=255) ccAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCgg > 1:3158441/1‑150 (MQ=255) cAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGa < 2:2061473/150‑1 (MQ=255) gCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAAc < 2:329294/150‑1 (MQ=255) gCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAAc < 1:1762632/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGAt > 1:205596/1‑150 (MQ=255) aTGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGAt > 2:24101/1‑150 (MQ=255) aTGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGAt < 1:4322590/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGAt < 2:3041905/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGAt < 1:3688003/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATg > 1:455943/1‑150 (MQ=255) cAGGTTTCCAGTCTCGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGt < 1:357087/150‑1 (MQ=255) cAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGt < 2:3617734/150‑1 (MQ=255) cAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGt < 1:4348201/150‑1 (MQ=255) ggTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTgc < 1:677896/150‑1 (MQ=255) ttCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCgcc > 1:4063933/1‑150 (MQ=255) tCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCgcca < 1:3434952/150‑1 (MQ=255) tCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCgcca > 2:1773497/1‑150 (MQ=255) cAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCgccagc > 2:4351446/1‑150 (MQ=255) gggTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTa < 1:3917661/150‑1 (MQ=255) ttAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTgg < 1:1623017/150‑1 (MQ=255) atAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATAGCGGAATGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCAgg > 2:914031/2‑150 (MQ=255) gATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGa < 1:3354548/150‑1 (MQ=255) tCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATg < 1:4239479/150‑1 (MQ=255) tCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATg < 2:4035944/150‑1 (MQ=255) cAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATgg > 1:1132499/1‑150 (MQ=255) cAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATgg > 1:2718545/1‑150 (MQ=255) aagaagTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGc > 1:2476745/1‑150 (MQ=255) aagaagTCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGc > 1:166761/1‑150 (MQ=255) aagTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACt > 2:2444328/1‑150 (MQ=255) gTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTa > 2:1079562/1‑150 (MQ=255) tCCCGTGGTGCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTaa > 1:1837848/1‑150 (MQ=255) ccGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAg > 2:3227977/1‑150 (MQ=255) cGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGc > 2:4224303/1‑150 (MQ=255) cGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGc > 2:4433409/1‑150 (MQ=255) tggtgCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCa < 1:603617/150‑1 (MQ=255) ggtgCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAg > 1:2582787/1‑150 (MQ=255) tgCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAAAATCGGAACGATGGATCGCCAGCCCAAGTAATCTTGGGATGGCACTTAAAGCCAgtg > 1:2145230/1‑150 (MQ=255) gCCAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAgtgt > 1:2244496/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAgtgt > 1:2285637/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGtt > 2:3426827/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGttt > 2:376895/1‑150 (MQ=255) cAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGttt < 1:3612738/150‑1 (MQ=255) aGCTTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATAGAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTg < 1:2489515/150‑1 (MQ=255) | CAGAGTTCCGCCGCTTGTGAACTTACCACGCCCAGCAATGTGCCGGTTTCTTTGACAGGAGAAAGAATATCGGCACGTAGGCCAGCCATATCCAGCAATGCAGGTTTCCAGTCACGGGTGGTTAGATCAAGAAGTCCCGTGGTGCCAGCGTTAGAGGGATCCACCGCCAGTTCGCCGCTGAGCATATAGGCCAGCCAGTCGCTGATCATGGTGATGGTTGATGCCTGACGGTAAATATCGGAACGATGGTGCGCCAGCCAAAGTAATCTGGGGATGGCACTTAAAGCCAGTGTTTGTCC > CP009273/1593751‑1594049 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |