Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | CP009273 | 1,689,180 | T→G | 100% | E383D (GAA→GAC) | uidA ← | beta‑D‑glucuronidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,689,180 | 0 | T | G | 95.5% | 961.6 / 15.6 | 246 | E383D (GAA→GAC) | uidA | beta‑D‑glucuronidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (5/6); new base G (110/125); total (115/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
CGTTGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTC > CP009273/1689033‑1689326 | cgTTGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTc < 2:4225836/150‑1 (MQ=255) ttGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTccc < 2:2668052/150‑1 (MQ=255) tGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTcccc > 1:4470551/1‑150 (MQ=255) tGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTcccc < 2:2793264/150‑1 (MQ=255) tGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTcccc < 2:1213655/150‑1 (MQ=255) tGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTcccc > 1:1969563/1‑150 (MQ=255) gCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCg > 2:3759684/1‑150 (MQ=255) cTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGt < 1:107809/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGtt < 1:924594/150‑1 (MQ=255) tCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTg < 2:2771031/150‑1 (MQ=255) tCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTg < 1:4629527/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGa < 1:1829618/150‑1 (MQ=255) ccAGTGGCGCGAAATATTCCAGTGCACCTTGCGTACGGGTATCAGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGAGCTATCAGCTCTTTAATCGCATGTATGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGAATg < 1:2974920/150‑1 (MQ=255) aGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGcc > 2:1439916/1‑150 (MQ=255) aGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGcc > 1:2528247/1‑150 (MQ=255) tGGCGCGAAATAGTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCctc < 2:1992424/150‑1 (MQ=255) ggCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCctct < 1:577384/150‑1 (MQ=255) gcgcGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCtt < 2:2252675/150‑1 (MQ=255) cgcgAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTc > 1:548036/1‑150 (MQ=255) cgAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGACTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGc > 1:4257042/1‑150 (MQ=255) gAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCt > 2:3512189/1‑150 (MQ=255) gAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCt > 2:1943513/1‑150 (MQ=255) aaaTATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTg > 1:3414411/1‑150 (MQ=255) aaTATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGt > 1:2669900/1‑150 (MQ=255) ttCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAg > 1:4480819/1‑150 (MQ=255) cccGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGtt < 2:1570220/150‑1 (MQ=255) cGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCt > 1:4595725/1‑150 (MQ=255) cGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGG‑TTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCtt < 2:2596968/150‑1 (MQ=255) tGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCttt > 1:2557484/1‑150 (MQ=255) tGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCttt < 1:160423/150‑1 (MQ=255) gCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTc < 2:4463287/150‑1 (MQ=255) gCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTc > 1:2432400/1‑150 (MQ=255) gCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTc > 2:599863/1‑150 (MQ=255) cACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTTCGCTTGCTGAGTGTCCCCGGTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCg > 2:1687336/1‑150 (MQ=255) cACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCg < 1:3325655/150‑1 (MQ=255) cACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCg < 2:2157678/150‑1 (MQ=255) cACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCg < 2:327762/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCgg < 2:2443386/150‑1 (MQ=255) cTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCt < 1:714517/150‑1 (MQ=255) cTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCt > 1:1668020/1‑150 (MQ=255) cTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCt > 1:3957207/1‑150 (MQ=255) cGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgtt < 2:942550/150‑1 (MQ=255) ggACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTGGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTATTTAATCGCCTGAAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCttgttg > 2:3419980/1‑150 (MQ=255) 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ggTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGaaa > 1:2878312/1‑150 (MQ=255) gTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCGTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAAc > 2:3318169/1‑150 (MQ=255) ttCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAAcc > 2:1539982/1‑150 (MQ=255) tCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCa < 1:4191546/150‑1 (MQ=255) cGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCaa > 2:1243664/1‑150 (MQ=255) 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tCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAagaga < 2:759113/150‑1 (MQ=255) tCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAagaga < 2:1486758/150‑1 (MQ=255) caTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGtt < 1:1768923/150‑1 (MQ=255) aTCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTa < 1:881904/150‑1 (MQ=255) accacGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAg > 1:2556925/1‑150 (MQ=255) 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cACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCatcaa < 1:4288334/150‑1 (MQ=255) cTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTCAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTCAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATcacca > 2:2179141/1‑150 (MQ=255) cTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATcacca > 1:3740386/1‑150 (MQ=255) tATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATcaccac > 2:4549968/1‑150 (MQ=255) tATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATcaccac < 2:2916638/150‑1 (MQ=255) aTCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACg > 1:2039006/1‑150 (MQ=255) ctctTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGcc < 1:672768/150‑1 (MQ=255) tctTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCa > 1:1629566/1‑150 (MQ=255) tttAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATg > 1:123785/1‑150 (MQ=255) ttAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGt < 1:227003/150‑1 (MQ=255) tAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGtt < 1:1694235/150‑1 (MQ=255) tAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGtt < 1:2837071/150‑1 (MQ=255) cGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATc < 2:951173/150‑1 (MQ=255) cGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATc > 2:307850/1‑150 (MQ=255) tGTAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGcc > 1:3268549/1‑150 (MQ=255) tAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCa < 2:3578975/150‑1 (MQ=255) tAAGTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCa > 1:3421007/1‑150 (MQ=255) gTGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTc > 2:4590067/1‑150 (MQ=255) tGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCg < 2:521027/150‑1 (MQ=255) tGCGCTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCg < 2:3066087/150‑1 (MQ=255) gcgcTTGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGa < 2:655592/150‑1 (MQ=255) cgcTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAg < 2:2865852/150‑1 (MQ=255) cTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCa < 2:3986077/150‑1 (MQ=255) tGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCAtc < 1:4171222/150‑1 (MQ=255) tGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCAtc < 1:990230/150‑1 (MQ=255) tGCTGAGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCAtc > 1:3042940/1‑150 (MQ=255) aGTGTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTc > 1:1481195/1‑150 (MQ=255) | CGTTGCTTCCGCCAGTGGCGCGAAATATTCCCGTGCACCTTGCGGACGGGTATCCGGTTCGTTGGCAATACTCCACATCACCACGCTTGGGTGGTTTTTGTCACGCGCTATCAGCTCTTTAATCGCCTGTAAGTGCGCTTGCTGAGTTTCCCCGTTGACTGCCTCTTCGCTGTACAGTTCTTTCGGCTTGTTGCCCGCTTCGAAACCAATGCCTAAAGAGAGGTTAAAGCCGACAGCAGCAGTTTCATCAATCACCACGATGCCATGTTCATCTGCCCAGTCGAGCATCTCTTC > CP009273/1689033‑1689326 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |