Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 1,732,758 | G→T | 47.4% | D220Y (GAC→TAC) | purR → | transcriptional repressor, hypoxanthine‑binding |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 1,732,758 | 0 | G | T | 47.4% | 172.4 / inf | 257 | D220Y (GAC→TAC) | purR | transcriptional repressor, hypoxanthine‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (62/73); new base T (54/67); total (117/140) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
GGCGTTATCTGATTGAACGCGGTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGATGTT > CP009273/1732609‑1732907 | ttATCTGATTGAACGCGGTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACtt < 2:847149/150‑1 (MQ=255) tATCTGATTGAACGCGGTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGTCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACttt > 2:3763771/1‑150 (MQ=255) tATCTGATTGAACGCGGTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACttt < 2:384636/150‑1 (MQ=255) tCTGATTGAACGCGGTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGa < 1:3320213/150‑1 (MQ=255) aTTGAACGCGGTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCt < 1:3068018/150‑1 (MQ=255) ttGAACGCGGTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTg < 1:3193701/150‑1 (MQ=255) tGAACGCGGTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGa < 1:3363879/150‑1 (MQ=255) tGAACGCGGTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGa > 2:3114607/1‑150 (MQ=255) ggTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGt < 1:899396/150‑1 (MQ=255) gTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGtt > 1:2059038/1‑150 (MQ=255) gTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGtt < 2:1760235/150‑1 (MQ=255) cACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCTGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTAt < 1:320010/150‑1 (MQ=255) cACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTAt < 1:1239995/150‑1 (MQ=255) aCCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATc < 2:1005922/150‑1 (MQ=255) aCCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATc > 1:2403974/1‑150 (MQ=255) cgcgAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATcgc < 1:3507561/150‑1 (MQ=255) cgcgAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATcgc < 2:229824/150‑1 (MQ=255) cgcgAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATcgc < 1:4086984/150‑1 (MQ=255) gAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGcc > 2:4212701/1‑150 (MQ=255) gAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGcc < 1:569084/150‑1 (MQ=255) gAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGcc < 2:4125235/150‑1 (MQ=255) aaaTCGGCGTCAT‑CCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCAt > 1:1837626/1‑150 (MQ=255) ggCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATgcag > 2:748619/1‑150 (MQ=255) ggCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATgcag > 2:127407/1‑150 (MQ=255) ggCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATgcag > 2:1821996/1‑150 (MQ=255) gTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCaa < 1:4452654/150‑1 (MQ=255) gTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCaa > 2:1987773/1‑150 (MQ=255) aTCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATc > 1:2894167/1‑150 (MQ=255) aTCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATc > 1:2894108/1‑150 (MQ=255) aTCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATc < 2:2752344/150‑1 (MQ=255) tCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATcc < 1:3720313/150‑1 (MQ=255) tCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATcc < 1:1402504/150‑1 (MQ=255) cGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTc > 2:2198133/1‑150 (MQ=255) 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ccTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGATGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGGAGGGTGACTTTGTACCTGAATCAGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCGTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTgtgg < 2:4330441/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCg > 1:4400740/1‑150 (MQ=255) ggTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGat > 2:4507511/1‑150 (MQ=255) ggTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGat > 1:1988531/1‑150 (MQ=255) ggTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGat > 2:2322045/1‑150 (MQ=255) ggTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGat > 2:1479704/1‑150 (MQ=255) gTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGata > 1:4204199/1‑150 (MQ=255) ttATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCa < 2:2068401/150‑1 (MQ=255) aTGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGTTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCAGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATg < 1:1045227/150‑1 (MQ=255) ggCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAAt < 1:4547946/150‑1 (MQ=255) ggCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAAt < 1:297430/150‑1 (MQ=255) gCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATg < 2:2705622/150‑1 (MQ=255) aTGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGgc < 2:1078686/150‑1 (MQ=255) aTGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGgc < 1:3809482/150‑1 (MQ=255) ggAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGgcgc > 1:1054/1‑150 (MQ=255) agaagCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACt > 2:3421214/1‑150 (MQ=255) gaagCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACtt < 2:3223698/150‑1 (MQ=255) gaagCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACtt > 1:2193157/1‑150 (MQ=255) gCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTtgt > 2:54975/1‑150 (MQ=255) gCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCGTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTtgt > 2:55456/1‑150 (MQ=255) tgatCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGtgctg < 2:2136408/150‑1 (MQ=255) atCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTgctgct < 1:3272646/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGctgctg > 1:2854645/1‑150 (MQ=255) tCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGctgctg > 1:2611746/1‑150 (MQ=255) tCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGctgctg < 1:774944/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGctgctg > 2:345642/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCtga > 1:4398619/1‑150 (MQ=255) aGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTGTGTGCTGCtgatg > 2:3588596/1‑150 (MQ=255) tGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGaaa > 2:285550/1‑150 (MQ=255) ccGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATg > 1:2521518/1‑150 (MQ=255) cGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATgg < 2:4500879/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATgg > 2:1699688/1‑150 (MQ=255) gAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGc > 2:508852/1‑150 (MQ=255) aaGCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCt < 1:2243589/150‑1 (MQ=255) aGCTGGATTTTGCAGTGTTACTTTGAAACTGAATACGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTTCCGTCTTCTGTGGTGGCTATATCATGTCAATGGTGGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTg < 1:3890137/150‑1 (MQ=255) aGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTg > 2:3337579/1‑150 (MQ=255) aGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTg < 2:3934665/150‑1 (MQ=255) aGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTg > 1:1603229/1‑150 (MQ=255) gCTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTgc < 1:3040438/150‑1 (MQ=255) gCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTgc < 2:2582772/150‑1 (MQ=255) cTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTgcg > 1:364619/1‑150 (MQ=255) cTGGATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTgcg > 2:4109709/1‑150 (MQ=255) gATTGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTAACGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGt > 2:1393954/1‑150 (MQ=255) aTTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTc < 2:4341926/150‑1 (MQ=255) ttGTGCAGGGTTACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTcc < 2:2457178/150‑1 (MQ=255) 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ggTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGAt < 2:2236273/150‑1 (MQ=255) gACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGATGtt < 2:2924587/150‑1 (MQ=255) | GGCGTTATCTGATTGAACGCGGTCACCGCGAAATCGGCGTCATCCCCGGCCCGCTGGAACGTAACACCGGCGCAGGCCGCCTTGCCGGTTTTATGAAGGCGATGGAAGAAGCGATGATCAAGGTGCCGGAAAGCTGGATTGTGCAGGGTGACTTTGAACCTGAATCCGGTTATCGCGCCATGCAGCAAATCCTGTCGCAGCCGCATCGCCCTACTGCCGTCTTCTGTGGTGGCGATATCATGGCAATGGGCGCACTTTGTGCTGCTGATGAAATGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGATGTT > CP009273/1732609‑1732907 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |