Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 1,865,000 | C→A | 7.7% | P120Q (CCA→CAA) | yeaI → | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 1,865,000 | 0 | C | A | 7.7% | 808.0 / 29.1 | 221 | P120Q (CCA→CAA) | yeaI | putative membrane‑anchored diguanylate cyclase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (91/112); new base A (15/3); total (106/115) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.31e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
TTGCATTACTACCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCATTTTAAGCCTTGCATTTTTAAGTGGCCTTATCTATTTAGTTGAAACCATTGTAATTATCCATAAACCAATTAACGGCAGTACACTGATCCAGACAAAGTCGAATGATGTTTCTATTTTCTATATTTTCCGCCAACTCAGT > CP009273/1864851‑1865148 | tactacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACt < 1:1955096/150‑1 (MQ=255) ctacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCa > 2:4186751/1‑150 (MQ=255) tacCTTATATAACGAAAACACAAATGTAAAACTCATCCCACAGATGAATTACCTGATGGTTGTTGTGGCTTTGTTTTTCCTTAACGCCGTCATTTTTCTTTTCATGTTAATGAAATATTTCACTAACAAACAAATTTTACCAACACTCAt < 1:2692225/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |