| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 151,620 | C→A | 54.2% | K98N (AAG→AAT) | htrE ← | putative outer membrane usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 151,620 | 0 | C | A | 54.2% | 15.0 / inf | 212 | K98N (AAG→AAT) | htrE | putative outer membrane usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/53); new base A (78/37); total (122/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.30e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
AGACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTGAGA > CP009273/151471‑151767 | aGACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATAAATATGAAACTGCAATAAATTc > 2:2899747/1‑150 (MQ=255) aCGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCtt < 2:3181659/150‑1 (MQ=255) cGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCttt < 1:3017379/150‑1 (MQ=255) cGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTAttt > 2:2647066/1‑150 (MQ=255) gTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTa < 1:3232164/150‑1 (MQ=255) gTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTa > 2:3723663/1‑150 (MQ=255) gATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAAtg < 2:1798060/150‑1 (MQ=255) gTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGAt > 1:4538469/1‑150 (MQ=255) tAACTTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCTTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCTTTATTTATATCGGGATAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATAc < 2:2440534/150‑1 (MQ=255) gTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGc > 2:4536961/1‑150 (MQ=255) gTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGc > 2:3306701/1‑150 (MQ=255) gTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGc > 2:4001066/1‑150 (MQ=255) tCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGcc > 2:1367215/1‑150 (MQ=255) tCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGcc > 2:3814297/1‑150 (MQ=255) aTAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTg > 2:244574/1‑150 (MQ=255) tAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTgg < 2:2743034/150‑1 (MQ=255) gAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGt > 1:3665806/1‑150 (MQ=255) aCAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTc < 1:4347207/150‑1 (MQ=255) aCAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTc > 1:1479482/1‑150 (MQ=255) aGAATCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCtt > 2:1536329/1‑150 (MQ=255) aGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCtt > 2:2992254/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCttt < 2:2580424/150‑1 (MQ=255) aaGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCtttt < 1:2674224/150‑1 (MQ=255) aGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCttttt < 1:3390692/150‑1 (MQ=255) aGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCttttt > 2:3678468/1‑150 (MQ=255) ccTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTc > 1:226135/1‑150 (MQ=255) cTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTcc < 2:3722953/150‑1 (MQ=255) tGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCt < 1:2794392/150‑1 (MQ=255) aTAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAAtt > 2:195100/1‑150 (MQ=255) tAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTg < 1:1186016/150‑1 (MQ=255) tAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGACGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTATTTATTTATATCGGGAGAATTAATATTAAACTGAAATAAATTATTTAATGTGATACAATAATGTGAGTAATTTTTTCCTTCAATTg > 2:1359928/1‑150 (MQ=255) aTTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCg < 2:3269428/150‑1 (MQ=255) aTTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCg < 1:2048008/150‑1 (MQ=255) ttCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGAc > 1:361054/1‑150 (MQ=255) tCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGACTTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGCTACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGAcc > 1:556430/1‑149 (MQ=255) gTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAAt > 1:678762/1‑150 (MQ=255) gTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAAt < 1:520499/150‑1 (MQ=255) aaaTTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTa < 1:948377/150‑1 (MQ=255) aaTTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTaa < 1:211799/150‑1 (MQ=255) tGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAATCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATAc > 1:513715/1‑150 (MQ=255) gAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACt < 1:2494191/150‑1 (MQ=255) gAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACt > 2:2351342/1‑150 (MQ=255) gAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACt > 1:2024513/1‑150 (MQ=255) aGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACtt < 1:4242622/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAATTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAAt < 1:3600158/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAACGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAAt < 1:4563380/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATg < 2:3056716/150‑1 (MQ=255) cGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGa < 2:2388181/150‑1 (MQ=255) cGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGAttgg < 2:3980432/150‑1 (MQ=255) ttCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGAttggttg > 1:188821/1‑150 (MQ=255) aTCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATtggttggta < 1:2330256/150‑2 (MQ=255) cTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGttt < 1:4114566/150‑1 (MQ=255) tGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTa < 1:3768328/150‑1 (MQ=255) cAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACAt < 2:743855/150‑1 (MQ=255) aGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAaca > 1:3874235/1‑150 (MQ=255) gAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAacac > 1:3652323/1‑150 (MQ=255) gAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAAGGATTGGTTGGTCGTTTACATAAacac > 1:2939608/1‑150 (MQ=255) aaCGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACt > 2:3676800/1‑150 (MQ=255) aCGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTg < 1:1623507/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGa < 2:4329522/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGa < 1:1593067/150‑1 (MQ=255) gCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAcg > 2:3127948/1‑150 (MQ=255) cTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTAATTTTTACTTCAATTTAGACAAATTTAATAATTTGGTTAATGTTTGGTTGGTCGTTTAAAAAAacaaatacgt > 1:841818/1‑143 (MQ=255) ttttCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAcgtcg < 1:3080231/150‑1 (MQ=255) tttCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAcgtcgt > 2:3787970/1‑150 (MQ=255) cGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTaaa < 1:1914712/150‑1 (MQ=255) gTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAac < 1:4175421/150‑1 (MQ=255) gTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAac > 2:2539028/1‑150 (MQ=255) gTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTGTACATAAACACTGACGTCGTAAac > 1:1837316/1‑150 (MQ=255) ttatttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCAGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTCATACTTTGGTTAATGATGGGTTGGTCGGTTACATAAACACGGACGTCGTAAaca > 2:2555503/1‑150 (MQ=255) tatttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTAAATAAACACTGACGTCGTAAacac > 1:3214939/1‑150 (MQ=255) atttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACAcc < 2:524307/150‑1 (MQ=255) atttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACAcc < 1:4215377/150‑1 (MQ=255) tttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGACTGGGCGTACTTTTTTCCATCAAAAGCGACAAATGAAATAATTTGGTGAATGATTGGTTGTTCGTTTACATAAAAACTGACGTCGTAAACAacc > 1:3818610/1‑150 (MQ=255) tatCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGta > 1:4596605/1‑150 (MQ=255) tatCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGta > 2:1161640/1‑150 (MQ=255) atCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGtat < 1:686350/150‑1 (MQ=255) tCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGtata > 1:4566964/1‑150 (MQ=255) gggAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGc < 1:288718/150‑1 (MQ=255) gggAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGc > 2:1659086/1‑150 (MQ=255) agaATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCggg > 2:206363/1‑150 (MQ=255) agaATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCggg > 2:206419/1‑150 (MQ=255) gaATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCgggg > 2:4633674/1‑150 (MQ=255) gaATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCgggg > 2:3569669/1‑150 (MQ=255) aTTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGtt > 2:3894974/1‑150 (MQ=255) tAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTAc > 2:1270644/1‑150 (MQ=255) aaTATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTAcc > 2:1032796/1‑150 (MQ=255) atatGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCt > 1:3234904/1‑150 (MQ=255) atGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTc < 1:2463658/150‑1 (MQ=255) gAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCAc > 2:1339515/1‑150 (MQ=255) gAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCAc > 1:761512/1‑150 (MQ=255) aaaCTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACt > 1:4575725/1‑150 (MQ=255) aaaCTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACt > 2:2109802/1‑150 (MQ=255) aCTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGt > 1:4456707/1‑150 (MQ=255) aCTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGt < 1:1254763/150‑1 (MQ=255) cTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTa > 1:169892/1‑150 (MQ=255) tAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGGCGTTTTCATAAAAACTGAAGTCGTAAAAACCCGGTATAGCGGGGTTACCATCACTGTACCGGCt > 1:1735996/1‑150 (MQ=255) tAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTATTTTTTCCTTAAAATGCGACAAATTTAATACTTTTGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTAAATAAAAACTGACGTCGTAAAAACCCGGTATAGCGGGGTTAACTTAACTGTACCCGCt > 1:1735330/1‑150 (MQ=255) aaTTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTga > 2:1599411/1‑150 (MQ=255) ttCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTgaga < 1:2637608/150‑1 (MQ=255) | AGACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTGAGA > CP009273/151471‑151767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |