| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,015,451 | T→A | 50.7% | G34G (GGT→GGA) | fliP → | flagellar biosynthesis protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,015,451 | 0 | T | A | 50.7% | 14.7 / inf | 284 | G34G (GGT→GGA) | fliP | flagellar biosynthesis protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (68/71); new base A (76/68); total (145/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
TTCAGTCGGTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTATTGCGTAACGCGCTGGGAACACCCTCCGCGCC > CP009273/2015304‑2015600 | ttCAGTCGGTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAgg > 1:4351241/1‑150 (MQ=255) gTCGGTCATGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACaa < 1:18651/150‑1 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTc < 1:1789132/150‑1 (MQ=255) tGAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTc < 1:3780060/150‑1 (MQ=255) gAAAAATTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCg > 1:2832527/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCt < 2:2883857/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCt > 1:4419361/1‑150 (MQ=255) aaaTTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTc > 2:115123/1‑150 (MQ=255) aTTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTccc > 1:3918787/1‑150 (MQ=255) aTTTGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTccc < 1:2772394/150‑1 (MQ=255) ttGCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCgg > 1:2415233/1‑150 (MQ=255) gCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTg > 2:1410307/1‑150 (MQ=255) gCTTAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCGTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTg < 2:611565/150‑1 (MQ=255) ttAAGCGTAGCGTGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCa < 1:1330394/150‑1 (MQ=255) ttAAGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCa > 2:2985665/1‑150 (MQ=255) aGCGTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGAc < 2:1123160/150‑1 (MQ=255) gTAGCGGGAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCt < 2:2641707/150‑1 (MQ=255) gggAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGgttt < 1:2721558/150‑3 (MQ=255) gggAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGgtgt < 1:177895/150‑1 (MQ=255) ggAGATCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGtt > 2:2232108/1‑150 (MQ=255) gagaTCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTtc > 2:2937611/1‑150 (MQ=255) agaTCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCCGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTtca > 2:3815349/1‑150 (MQ=255) aTCCTGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTtcatc < 1:3006268/150‑1 (MQ=255) tGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCAACACCt > 2:2733978/1‑150 (MQ=255) tGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTAATCACCt > 2:237670/1‑150 (MQ=255) tGATGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTACTTCTCTTGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACAGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCCGTGCAGACGCTGGTGTTCATCAcca > 1:2812393/1‑149 (MQ=255) tGCGTCGTTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCGTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCATCGCGCAACAGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGt > 1:4506767/1‑150 (MQ=255) cgtcgtTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTg > 2:3436363/1‑150 (MQ=255) cgtcgtTTATTGTCTGTCGCACCAGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTg > 1:633410/1‑150 (MQ=255) gtcgtTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGa > 2:4496919/1‑150 (MQ=255) tcgtTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGATGATTACTCCACTCGCCTTCGCGCAACTGCCTGGTATCACCAGCCAGCCGATGCCTGGATGAGGAAAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCATACGCTTGTGTTCATCACCTAGTTGAc < 1:421453/150‑1 (MQ=255) cgtTTATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACg > 2:4365286/1‑150 (MQ=255) ttATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGttt > 1:1401499/1‑150 (MQ=255) ttATTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGttt < 2:300325/150‑1 (MQ=255) aTTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTAt > 2:929814/1‑150 (MQ=255) aTTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTAt > 2:2167003/1‑150 (MQ=255) aTTGTCTGTCGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTAt > 2:1338234/1‑150 (MQ=255) tgtctgtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTc > 1:431324/1‑150 (MQ=255) tgtctgtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTc > 2:1271234/1‑150 (MQ=255) ctgtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCgg > 1:865358/1‑150 (MQ=255) tgtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGc > 2:902153/1‑150 (MQ=255) gtcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTAAGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCTGCa > 2:845597/1‑150 (MQ=255) tcGCACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCaa < 2:3999440/150‑1 (MQ=255) cACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAAttt > 2:1949878/1‑150 (MQ=255) cACCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAAttt < 2:1548901/150‑1 (MQ=255) aCCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAAtttt < 1:4107505/150‑1 (MQ=255) aCCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAAtttt < 2:82087/150‑1 (MQ=255) aCCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCAGGCAAtttt < 1:2574474/150‑1 (MQ=255) aCCTGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAAtttt > 1:1758180/1‑150 (MQ=255) tGTCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACt < 2:365391/150‑1 (MQ=255) tCCTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACtga > 1:2671200/1‑150 (MQ=255) ccTTCTCTGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACtgat > 2:2576574/1‑150 (MQ=255) tGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGAcc < 1:622433/150‑1 (MQ=255) tGGCTGATTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGAcc > 1:1274064/1‑150 (MQ=255) aTTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTc < 1:2156803/150‑1 (MQ=255) aTTACGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTc < 2:3751472/150‑1 (MQ=255) aCGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCAcc < 1:513937/150‑1 (MQ=255) cGCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCAccc > 1:2334775/1‑150 (MQ=255) gCCCCTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCg > 2:4607762/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcat < 1:1525053/150‑1 (MQ=255) ccTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcat > 2:1964610/1‑150 (MQ=255) ccTCGCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcat > 2:2433281/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcatcatc > 2:4178501/1‑150 (MQ=255) ccTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcatcatca < 2:2963747/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGcatcatcat > 1:1816295/1‑150 (MQ=255) ttCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTTATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCAtt < 2:3590666/150‑1 (MQ=255) ttCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCAtt < 2:529734/150‑1 (MQ=255) ttCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCAtt < 2:3718654/150‑1 (MQ=255) ttCGCGCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCAtt < 2:655187/150‑1 (MQ=255) cgcgCAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGt > 1:2856844/1‑150 (MQ=255) gcgcAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGtt < 2:1627566/150‑1 (MQ=255) cgcAACTGCCGGGTATCACCAGCCTGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGttt < 1:3048288/150‑1 (MQ=255) cgcAACTGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGttt > 2:1679852/1‑150 (MQ=255) 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tGCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGtt > 1:3698954/1‑150 (MQ=255) gCCGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGttt < 2:1881441/150‑1 (MQ=255) cGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGAGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGCTGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTAt < 2:3328119/150‑1 (MQ=255) cGGGTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGAGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCACTTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTGTTGGTTTAt > 1:2904623/1‑150 (MQ=255) gggTATCACCAGCCAGCCGCTGCCTGGCGGTGGACAAAGCTGGTCGCTCCCGGTGCAGACGCTGGTGTTCATCACCTCGTTGACGTTTATTCCGGCAATTTTACTGATGATGACCAGTTTCACCCGCATCATCATTGTTTTTGGTTTAtt < 1:3081352/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |