| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 153,472 | G→T | 94.8% | intergenic (‑102/+268) | yadN ← / ← folK | putative fimbrial‑like adhesin protein/2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 153,472 | 0 | G | T | 94.8% | 779.0 / 31.2 | 248 | intergenic (‑102/+268) | yadN/folK | putative fimbrial‑like adhesin protein/2‑amino‑4‑hydroxy‑6‑hydroxymethyldihyropteridine pyrophosphokinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (9/4); new base T (119/115); total (129/119) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
TCGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGG > CP009273/153325‑153616 | tCGCCATCATAAGACCAGACAGTGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTat < 2:1168279/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATtata < 1:822242/150‑1 (MQ=255) gCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTatat > 2:4370781/1‑150 (MQ=255) gCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTatat > 2:591585/1‑150 (MQ=255) ccAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAtt > 2:3321842/1‑150 (MQ=255) cAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAttt > 1:3548225/1‑150 (MQ=255) cAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATAttt < 1:4090235/150‑1 (MQ=255) aGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTg > 2:2899477/1‑150 (MQ=255) aGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTg > 2:2900355/1‑150 (MQ=255) aGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTg > 1:2268249/1‑150 (MQ=255) aTAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTa > 2:2769570/1‑150 (MQ=255) aCCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCaa < 2:129098/150‑1 (MQ=255) aGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAtt > 1:4010002/1‑150 (MQ=255) aGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAAtt > 2:3933524/1‑150 (MQ=255) aCAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTa < 1:4613276/150‑1 (MQ=255) cAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTAc < 1:3919822/150‑1 (MQ=255) cAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTAc < 2:3976238/150‑1 (MQ=255) aaaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCAtt > 1:490411/1‑150 (MQ=255) aaaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCAtt > 1:3590528/1‑150 (MQ=255) aaCCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTg < 2:2577439/150‑1 (MQ=255) ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGtt < 1:4224499/150‑1 (MQ=255) ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGtt > 1:2315108/1‑150 (MQ=255) ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGtt > 1:252023/1‑150 (MQ=255) ccTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAAAGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGtt > 1:2172399/1‑150 (MQ=255) tttAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGt < 1:2917892/150‑1 (MQ=255) ttAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTc < 2:4538453/150‑1 (MQ=255) ttAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTc > 1:1367152/1‑150 (MQ=255) ttAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTc < 1:4376937/150‑1 (MQ=255) tAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCg > 1:3449875/1‑150 (MQ=255) aCATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAAGTAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTTCAACCATTGTTCATTTGGTCGCCt > 2:4232132/1‑150 (MQ=255) cATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTa > 1:961291/1‑150 (MQ=255) aTAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAt > 2:1556194/1‑150 (MQ=255) tAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAtt > 2:87570/1‑150 (MQ=255) tAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAtt < 1:3799182/150‑1 (MQ=255) tAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAtt < 2:4403293/150‑1 (MQ=255) tAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAtt > 2:3127289/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTAGtg > 2:3912109/1‑150 (MQ=255) aaaTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAATAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATtgtg < 1:3025105/150‑1 (MQ=255) aTCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCa < 2:1102454/150‑1 (MQ=255) ccTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACt > 1:3488714/1‑150 (MQ=255) ttAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTa < 1:151183/150‑1 (MQ=255) taataaAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAg > 2:547926/1‑150 (MQ=255) aataaACTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGa < 2:1787920/150‑1 (MQ=255) ataaAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGaa < 2:1501341/150‑1 (MQ=255) ataaAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGaa < 1:2750229/150‑1 (MQ=255) ataaAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGaa < 1:3198965/150‑1 (MQ=255) ataaAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGaa < 2:2670679/150‑1 (MQ=255) ataaAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGaa < 1:3198960/150‑1 (MQ=255) taaAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACAATTCAAGACACAAATAGCAGAAACAAAGCTAACATATAAATGAGCAATAAAATTTGATAAACAAATTTACAAACATTGATAATAAGGACGCCTATTGAGAACTTTAGAAg > 1:713441/1‑150 (MQ=255) aaaaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATTACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGc > 1:1078843/1‑150 (MQ=255) aaaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCt > 2:3469511/1‑150 (MQ=255) aaTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCtt < 1:1703741/150‑1 (MQ=255) aTTCCATTAGTCAGACTACTTGTTTGAAGAATGACTATTCTTGACACCAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTTTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCTTTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCttt < 1:1345852/150‑1 (MQ=255) aTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCttt > 2:3238372/1‑150 (MQ=255) aTTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCAAGAAACAAATAGGAGAAACAAATGATAGATATTAATGAGAAATTATATTTGTTACCCAAAATTACAACCAGTGTTCATTAGGTCGCCTATTTTGCACTATAGAAGCtta > 2:1682684/1‑149 (MQ=255) ttCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCtttt < 1:2866090/150‑1 (MQ=255) tCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTg < 2:235794/150‑1 (MQ=255) ccATTAGTCAGACGACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGa < 2:753624/150‑1 (MQ=255) cATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGaa > 2:383679/1‑150 (MQ=255) aGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaa > 2:3137293/1‑150 (MQ=255) gTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaat < 1:4016511/150‑1 (MQ=255) tCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaatt < 2:4381880/150‑1 (MQ=255) tCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaatt > 1:2515913/1‑150 (MQ=255) tCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaatt > 1:932528/1‑150 (MQ=255) aGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACaaattaa > 1:1988886/1‑150 (MQ=255) tACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAAttt > 1:936349/1‑150 (MQ=255) aCATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTa < 2:2185778/150‑1 (MQ=255) cATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTAc < 1:3839548/150‑1 (MQ=255) aTGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACt > 1:1957424/1‑150 (MQ=255) tGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAAtt < 2:3713968/150‑1 (MQ=255) gaagaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTc < 1:33857/150‑1 (MQ=255) gaagaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTc < 2:2441720/150‑1 (MQ=255) gaagaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTc < 1:4553372/150‑1 (MQ=255) aagaaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCa > 1:12560/1‑150 (MQ=255) aaTGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCaaaa < 1:3932196/150‑1 (MQ=255) aCTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTaa < 2:2967590/150‑1 (MQ=255) aTTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTGTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTa > 2:3063705/1‑150 (MQ=255) ttCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTaa > 2:1119889/1‑150 (MQ=255) cATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTaaaa < 1:1548217/150‑1 (MQ=255) tGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAAt > 1:1720584/1‑150 (MQ=255) caAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGtt < 1:4505656/150‑1 (MQ=255) aTAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTcac > 2:3258816/1‑150 (MQ=255) ggAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAg > 1:3026128/1‑150 (MQ=255) gagaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGt < 2:3548225/150‑1 (MQ=255) agaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTg < 2:3336467/150‑1 (MQ=255) agaAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTg < 2:1345558/150‑1 (MQ=255) aaCAAATGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCaa < 1:618078/150‑1 (MQ=255) aCAAATGTTAGATAATAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAAt < 2:3590095/150‑1 (MQ=255) aaaTGTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTg > 2:2007760/1‑150 (MQ=255) gTTAGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTa > 1:2405478/1‑150 (MQ=255) aGATATTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAggg > 2:973520/1‑150 (MQ=255) atatTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGATGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTGACAAGTGCGATTGGTTAGGGTa > 2:4077165/1‑150 (MQ=255) tatTAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGAACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTAt > 1:912344/1‑150 (MQ=255) tAATGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGga > 1:1154676/1‑150 (MQ=255) aTGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGgaga < 1:1038945/150‑1 (MQ=255) tGAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGAGCAATTGGTTAGGGTATGGAGAt > 1:2609278/1‑150 (MQ=255) gAGCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATg < 1:3366787/150‑1 (MQ=255) gCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATggg < 2:1407127/150‑1 (MQ=255) gCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATggg > 2:86645/1‑150 (MQ=255) gCAATTATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTGAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATggg < 2:4473420/150‑1 (MQ=255) | TCGCCAGCATAAGACCAGACAGGGCAAAACCTAATTTTTTAGACATAAAAATCCTTTAATAAAATTCCATTAGTCAGACTACATGTTTGAAGAATGACTATTCATGACACAAATAGGAGAAACAAATGTTAGATATTAATGAGCAATGATATTTGTTACCCAAATTTACAACCATTGTTCATTAGGTCGCCTATTGTGCACTTTAGAAGCTTTTGAACAAATTAAATTTACTTAATTCAAAATTAAGTAAAAATAAGTTCACAAGTGCAATTGGTTAGGGTATGGAGATGGG > CP009273/153325‑153616 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |