| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,233,243 | T→G | 5.6% | K195N (AAA→AAC) | mglB ← | methyl‑galactoside transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,233,243 | 0 | T | G | 5.6% | 904.8 / 40.8 | 297 | K195N (AAA→AAC) | mglB | methyl‑galactoside transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (121/159); new base G (8/9); total (129/168) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
AGCGCTTCAACCGCGCCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGATTCGCCGCCCAGTGTTTAGCAAT > CP009273/2233094‑2233392 | aGCGCTTCAACCGCGCCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGtt > 1:4169766/1‑150 (MQ=255) cgcTTCAACCGCGCCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGtttt > 2:646104/1‑150 (MQ=255) cgcTTCAACCGCGCCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGtttt < 2:4367574/150‑1 (MQ=255) tCAACCGCGCCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATg < 1:1057943/150‑1 (MQ=255) cAACCGCGCCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGc < 1:1196916/150‑1 (MQ=255) aCCGCGCCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCt < 1:2464109/150‑1 (MQ=255) cgcgCCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCttt < 1:197235/150‑1 (MQ=255) cgcgCCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCttt > 2:4633506/1‑150 (MQ=255) gcCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATc > 2:546219/1‑150 (MQ=255) tGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCaa < 2:455968/150‑1 (MQ=255) tGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCaa > 2:3790536/1‑150 (MQ=255) ccATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAAtt > 1:1911263/1‑150 (MQ=255) tcgcatcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCtt < 2:3333617/150‑1 (MQ=255) tcgcatcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCtt < 2:2770615/150‑1 (MQ=255) cgcatcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCttt < 1:235054/150‑1 (MQ=255) cgcatcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCttt < 1:2349566/150‑1 (MQ=255) cgcatcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTGTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCttt < 1:592954/150‑1 (MQ=255) catcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTaa < 2:1153985/150‑1 (MQ=255) catcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTaa > 1:31995/1‑150 (MQ=255) catcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTaa > 1:2519153/1‑150 (MQ=255) catcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGGTCAATTCTTTaa > 2:2982567/1‑150 (MQ=255) atcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAAt > 1:4028609/1‑150 (MQ=255) tcgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATc < 1:4243617/150‑1 (MQ=255) cgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCa > 2:764760/1‑150 (MQ=255) cgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCa < 2:3139186/150‑1 (MQ=255) cgTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCa < 1:3963169/150‑1 (MQ=255) gttgttGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCAc > 1:1402825/1‑150 (MQ=255) gttgttGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCAc < 2:515633/150‑1 (MQ=255) gttgttGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCAc > 1:3053819/1‑150 (MQ=255) gttgGCGATAACCACTTCGATTTTGATGGCGTACGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCTGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTGTTGATCCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTa > 1:2100023/1‑150 (MQ=255) ttgGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTaa < 1:1715167/150‑1 (MQ=255) tgGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAg > 1:4485356/1‑150 (MQ=255) gCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTg < 2:157783/150‑1 (MQ=255) cGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTgg < 2:1261627/150‑1 (MQ=255) gATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCGTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGt < 2:2173322/150‑1 (MQ=255) aTAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTa > 2:229931/1‑150 (MQ=255) tAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACAGTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTAc < 2:3731366/150‑1 (MQ=255) ccACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCGTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTg < 1:1843137/150‑1 (MQ=255) cACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGc > 1:3823852/1‑150 (MQ=255) cTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCtt < 2:3017833/150‑1 (MQ=255) ttCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTc < 2:2518565/150‑1 (MQ=255) ttttGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCAt > 2:1874639/1‑150 (MQ=255) ttgttgGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATcc < 1:3459668/150‑1 (MQ=255) ttgttgGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATcc > 1:1184763/1‑150 (MQ=255) ttgttgGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATcc < 2:2287098/150‑1 (MQ=255) gttgGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTGTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCgg > 2:3653768/1‑150 (MQ=255) ttgGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGa > 2:2377376/1‑150 (MQ=255) ttgGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGa < 2:1800714/150‑1 (MQ=255) tgGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGAt > 2:2954313/1‑150 (MQ=255) tgGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACCGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGAt < 2:3924222/150‑1 (MQ=255) gCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATgg < 2:1531478/150‑1 (MQ=255) gCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATgg < 2:4039441/150‑1 (MQ=255) gTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGcc > 1:3880703/1‑150 (MQ=255) ttCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGccc > 1:1467126/1‑150 (MQ=255) tCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTATCTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCg < 1:3589817/150‑1 (MQ=255) ggCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGtt < 2:3529721/150‑1 (MQ=255) gCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTc < 1:2468354/150‑1 (MQ=255) gCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTc < 1:4041335/150‑1 (MQ=255) cAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCAc > 2:4133195/1‑150 (MQ=255) aGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCAcc > 1:2802617/1‑150 (MQ=255) aGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCAcc > 1:2843345/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTcag < 1:3073782/150‑1 (MQ=255) aGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTcagca < 2:856208/150‑1 (MQ=255) aGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTcagca > 2:205738/1‑150 (MQ=255) aGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTcagca > 1:2043731/1‑150 (MQ=255) gTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTAc < 1:132555/150‑1 (MQ=255) gTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTAc > 2:2582436/1‑150 (MQ=255) gTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTAc < 2:2891692/150‑1 (MQ=255) ccATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGa > 2:2248470/1‑150 (MQ=255) ttatcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGa < 1:3929277/150‑1 (MQ=255) atcttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTGTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAAt > 1:919821/1‑150 (MQ=255) cttTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCt < 2:3196365/150‑1 (MQ=255) tttCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTg < 1:3716880/150‑1 (MQ=255) tttCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTg < 2:100782/150‑1 (MQ=255) cGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTGTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGAcc > 2:1704452/1‑150 (MQ=255) cGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTGTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGAcc > 2:3586474/1‑150 (MQ=255) ccTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGt > 1:1245800/1‑150 (MQ=255) aGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCttt < 1:144503/150‑1 (MQ=255) gCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTGTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTg < 2:2615097/150‑1 (MQ=255) ggTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGtt < 1:1808281/150‑1 (MQ=255) ggTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGtt > 2:1448009/1‑150 (MQ=255) ggTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGtt < 1:33520/150‑1 (MQ=255) gtCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAg > 1:4518665/1‑150 (MQ=255) gtCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAg < 2:4220136/150‑1 (MQ=255) tCCCACATTTCGGTATCTAACTGTAACTTTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCTGATTGCCCGGTTCACCTATCAGCATTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTAAGa > 2:338210/1‑150 (MQ=255) cccACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAATTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAgtt > 2:1074234/1‑148 (MQ=255) cccACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGAt > 2:3480414/1‑150 (MQ=255) ccACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATc > 2:4420592/1‑150 (MQ=255) caTTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTGTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCa < 1:1640595/150‑1 (MQ=255) cGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCt < 2:1325584/150‑1 (MQ=255) cGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGATTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCt < 1:3504371/150‑1 (MQ=255) gTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGa > 1:3982714/1‑150 (MQ=255) tATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGAt > 1:2199788/1‑150 (MQ=255) aactgtaactgtTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGATTcgcc < 1:1993440/150‑1 (MQ=255) aactgtaactgtTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGATTcgcc < 1:4542996/150‑1 (MQ=255) tgtaactgtTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGATTCgccgcc < 1:1571557/150‑1 (MQ=255) gtaactgtTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGATTCGCCGccc < 2:1956992/150‑1 (MQ=255) taactgtTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGATTCGCCGCCCa > 1:2570018/1‑150 (MQ=255) actgtTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGATTCGCCGCCCAgt > 1:462310/1‑150 (MQ=255) tCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGATTCGCCGCCCAGTGTTTa > 1:2162844/1‑150 (MQ=255) | AGCGCTTCAACCGCGCCCATTGCCATCGCATCGTTGTTGGCGATAACCACTTCGATTTTGTTGGCGTTCGGGCCAGACAGCCAGGCGTCCATCTTATCTTTCGCCTGAGCGGTGTCCCACATTGCGGTATCTAACTGTAACTGTTCAGTTTTGATGCCTTTATCGTTCAATTCTTTAATCACGTAAGTGGTACGTGCTTCTGCATCCGGATGGCCCGGTTCACCTTTCAGCAGTACGAACTGAATCTGACCGTCTTTGTTCAGATCCCAACCCTGATTCGCCGCCCAGTGTTTAGCAAT > CP009273/2233094‑2233392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |