| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,256,045 | A→T | 7.0% | I310I (ATT→ATA) | fruB ← | fused fructose‑specific PTS enzymes: IIA component/HPr component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,256,045 | 0 | A | T | 7.0% | 844.4 / 40.4 | 258 | I310I (ATT→ATA) | fruB | fused fructose‑specific PTS enzymes: IIA component/HPr component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (112/128); new base T (12/6); total (124/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
GCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCGCTTTCAGCAAGCGGTC > CP009273/2255896‑2256194 | gcCTGTTCAGCTTCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTACCGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTa < 2:3167908/150‑1 (MQ=255)gcCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTa < 2:836175/150‑1 (MQ=255)gcCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTa < 2:2726092/150‑1 (MQ=255) ccTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTaa > 2:692248/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAAt < 1:1512648/150‑1 (MQ=255) cTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAAt < 1:4166220/150‑1 (MQ=255) tGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATg < 1:1420412/150‑1 (MQ=255) tGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATg < 1:1420752/150‑1 (MQ=255) tGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATg > 2:4631288/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATgg < 2:4501915/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATgg > 2:1000141/1‑150 (MQ=255) cAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTAt > 2:4286423/1‑150 (MQ=255) cAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTAt < 2:440896/150‑1 (MQ=255) aGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTCCCATCCAGGTTTGTCACGGTACTATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTAtt > 2:2123108/1‑150 (MQ=255) aGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTAtt < 2:4025158/150‑1 (MQ=255) aGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTAtt > 1:2874888/1‑150 (MQ=255) cATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGa < 2:2330741/150‑1 (MQ=255) cATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGa > 2:3668036/1‑150 (MQ=255) aTCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGAc > 1:3524463/1‑150 (MQ=255) tGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAg < 2:4171764/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTTATGGTATTGACCAGCATgg < 1:2371984/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTa < 1:3743816/150‑1 (MQ=255) gggCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTAc < 2:3715074/150‑1 (MQ=255) gggCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGGACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTAc < 1:4544572/150‑1 (MQ=255) gTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGa > 2:909937/1‑150 (MQ=255) gTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCAGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTACAAACACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACAAGCATGGTACCTGGa > 1:2474714/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACg < 2:25546/150‑1 (MQ=255) aaGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGa > 1:2019859/1‑150 (MQ=255) cGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCa > 1:3179520/1‑150 (MQ=255) gTAGGCGATGACCTCTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTTATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCAt < 1:2188238/150‑1 (MQ=255) ggCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCa < 1:1617130/150‑1 (MQ=255) ggCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCa < 1:2369916/150‑1 (MQ=255) cGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAgg < 2:1437216/150‑1 (MQ=255) gATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGc > 2:3835595/1‑150 (MQ=255) aTGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGcc > 2:1607350/1‑150 (MQ=255) aTGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGcc < 1:2100923/150‑1 (MQ=255) tGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCg < 1:2036238/150‑1 (MQ=255) gACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTTATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCgt > 1:3542898/1‑150 (MQ=255) ccTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCgtgt > 1:2782100/1‑150 (MQ=255) ccTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCgtgt > 1:1142839/1‑150 (MQ=255) cTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGtt > 1:802302/1‑150 (MQ=255) cTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGtt > 1:3119223/1‑150 (MQ=255) tttCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTc > 2:861503/1‑150 (MQ=255) cTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCAtt < 2:4495024/150‑1 (MQ=255) ttAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTg > 1:255056/1‑150 (MQ=255) tAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTgc < 1:2451569/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTgcg < 1:1803947/150‑1 (MQ=255) cGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTAAGTCCGTTTTCCGGTTAGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGAAATATCACTGTTAAAATGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACATTGAAGAGCATGCAGGCCGAGTTCATATCGca > 2:1647500/1‑150 (MQ=255) tGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACaaa > 1:3472139/1‑150 (MQ=255) gCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACTTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAAc > 1:2672706/1‑150 (MQ=255) ccACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACt < 2:2201013/150‑1 (MQ=255) ccACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACt < 1:2582796/150‑1 (MQ=255) ccAAAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACt < 2:2261663/150‑1 (MQ=255) acaACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTcc < 2:938860/150‑1 (MQ=255) aaCTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCcgc < 1:3971191/150‑1 (MQ=255) ttCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCtt < 2:3257024/150‑1 (MQ=255) atcaGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAac > 1:516826/1‑150 (MQ=255) gTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCgtcgg > 2:747037/1‑150 (MQ=255) ccGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCgtcggtc > 2:1826843/1‑150 (MQ=255) gccggtttgccggtACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGca > 1:3651205/1‑150 (MQ=255) gccggtttgccggtACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGca < 2:4456992/150‑1 (MQ=255) ccggtttgccggtACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGcat < 1:921590/150‑1 (MQ=255) ttgccggtACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCg > 2:3058027/1‑150 (MQ=255) ttgccggtACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCAGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTTCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCg > 2:1745507/1‑150 (MQ=255) gccggtACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCt > 1:3468472/1‑150 (MQ=255) ccggtACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTg < 2:4410429/150‑1 (MQ=255) aCCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTTATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTcag > 2:2974393/1‑150 (MQ=255) ccATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTcagc > 1:4590779/1‑150 (MQ=255) cATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTcagca > 2:515181/1‑150 (MQ=255) cATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTcagca < 1:4305290/150‑1 (MQ=255) aTCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTcagcag > 1:950271/1‑150 (MQ=255) aaGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAgcgc < 1:355978/150‑1 (MQ=255) aGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGcc < 2:869577/150‑1 (MQ=255) ggTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCa < 2:4151484/150‑1 (MQ=255) gTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAg > 2:4531180/1‑150 (MQ=255) tGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCaa < 2:1572819/150‑1 (MQ=255) gTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTTATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAAc < 1:1970683/150‑1 (MQ=255) tCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACg < 2:128947/150‑1 (MQ=255) tCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACg < 2:2400389/150‑1 (MQ=255) ggTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGc < 1:2220355/150‑1 (MQ=255) gTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGcc > 2:3577840/1‑150 (MQ=255) gTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGcc < 1:774253/150‑1 (MQ=255) atCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATc > 2:2484816/1‑150 (MQ=255) atCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATc > 2:2484752/1‑150 (MQ=255) tCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATcc < 2:2073316/150‑1 (MQ=255) tCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATcc < 2:1948984/150‑1 (MQ=255) tCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATcc < 2:582184/150‑1 (MQ=255) tCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATcc > 1:914330/1‑150 (MQ=255) tCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATcc < 1:692248/150‑1 (MQ=255) cACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCg > 2:4106968/1‑150 (MQ=255) cACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCg > 1:2985980/1‑150 (MQ=255) cACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCg < 1:3835595/150‑1 (MQ=255) ttAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCGCTTTc < 1:3221893/150‑1 (MQ=255) ttAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCGCTTTc < 2:400593/150‑1 (MQ=255) ttGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCGCTTTCAGCaa < 2:1813496/150‑1 (MQ=255) tGTTTAATGGTATTGACCATCATGGTAACTGGACTAGAATGCAGGCCGTTTTAATTGCTCACCACATACTCCGAGATTAACACGTCGTCGGTCTGCTCATAATAGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATACGCTTTCAGCAAg < 2:124706/150‑1 (MQ=255) tGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCGCTTTCAGCAAg > 2:415638/1‑150 (MQ=255) tttAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCGCTTTCAGCAAGCg > 1:1193109/1‑150 (MQ=255) ttAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCGCTTTCAGCAAGCgg < 1:1715479/150‑1 (MQ=255) aaTGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCGCTTTCAGCAAGCGGTc > 1:3345324/1‑150 (MQ=255) | GCCTGTTCAGCATCTGCACCCTGGGCGGTAAAGCGTAGGCGATGACCTTTCTTAACGCCAAGTGCCACAACTTTCATCAGACTACGTCCGTTTGCCGGTTTGCCGGTACCATCAAGGTTTGTCACGGTAATATCACTGTTAAATTGTTTAATGGTATTGACCAGCATGGTACCTGGACGAGCATGCAGGCCGTGTTCATTGCGCACCACAAACTCCGCGCTTAACACGTCGTCGGTCGGCGCATCATCGCTGGTCAGCAGCGCCAGCAACGTTGCCGCATCCGCTTTCAGCAAGCGGTC > CP009273/2255896‑2256194 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |