| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,780,661 | C→A | 11.3% | pseudogene (906/2253 nt) | ygaQ → | uncharacterized protein; putative enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,780,661 | 0 | C | A | 11.3% | 912.5 / 59.8 | 257 | pseudogene (906/2253 nt) | ygaQ | uncharacterized protein; putative enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (112/116); new base A (17/12); total (129/128) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
TCCGCGCCGACGGACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCAAGGTCAGGTTTTG > CP009273/2780513‑2780808 | cgcgCCGACGGACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGat > 2:4244310/1‑150 (MQ=255) cgcgCCGACGGACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGat < 1:3212151/150‑1 (MQ=255) cgcCGACGGACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTGGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGatat < 1:2098945/150‑1 (MQ=255) gcCGACGGACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATc < 1:2115087/150‑1 (MQ=255) ccGACGGACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCa < 2:2692882/150‑1 (MQ=255) ccGACGGACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCa > 1:62715/1‑150 (MQ=255) ccGACGGACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCa > 1:2435192/1‑150 (MQ=255) gACGGACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCAtt < 1:1988580/150‑1 (MQ=255) gACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTg < 2:3425152/150‑1 (MQ=255) aCCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGa < 2:57702/150‑1 (MQ=255) cAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGAtt < 2:4324742/150‑1 (MQ=255) cAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGAtt > 1:4576234/1‑150 (MQ=255) cAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGAtt > 2:1117885/1‑150 (MQ=255) cAGAAACTCCCGAAGAAGAAAACGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGAtt < 1:4593524/150‑1 (MQ=255) aGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATta > 1:2363316/1‑150 (MQ=255) aGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATta < 2:55289/150‑1 (MQ=255) gAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATtat > 1:1956131/1‑150 (MQ=255) gAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATtat < 2:1497344/150‑1 (MQ=255) aaaCTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATtata > 1:800668/1‑150 (MQ=255) aCTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATAcc < 1:4321767/150‑1 (MQ=255) ccGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGATTATACCTTTa < 2:3907039/150‑1 (MQ=255) cGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTaa > 1:1051947/1‑150 (MQ=255) aagaagaaAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACt < 1:69005/150‑1 (MQ=255) agaagaaAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACtt > 1:2300665/1‑150 (MQ=255) agaaAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGGACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTAt < 2:2535923/150‑1 (MQ=255) agaaAAGGGTTACTGGTTACATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGAATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGAATCGAAATCATACCTTATTATACATTTAACTTTAt > 1:1452735/1‑150 (MQ=255) aaGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGa > 2:1106094/1‑150 (MQ=255) aaGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGa > 2:1683794/1‑150 (MQ=255) aaGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGa < 2:4506911/150‑1 (MQ=255) gggTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAAt > 1:4487287/1‑150 (MQ=255) gggTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAAt > 1:4487257/1‑150 (MQ=255) ggTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAAtt < 2:1327825/150‑1 (MQ=255) gTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTg > 2:3805410/1‑150 (MQ=255) tACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTggg < 1:3858612/150‑1 (MQ=255) tACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTggg < 2:2770578/150‑1 (MQ=255) aCTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTgggg < 1:4075536/150‑1 (MQ=255) aCTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTgggg > 1:1321731/1‑150 (MQ=255) aCTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTgggg < 1:2011641/150‑1 (MQ=255) ggTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTa < 1:708636/150‑1 (MQ=255) gTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAg > 2:765416/1‑150 (MQ=255) aTGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTa < 2:2789305/150‑1 (MQ=255) tGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTaa > 2:4581044/1‑150 (MQ=255) gCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTaaa > 2:2629061/1‑150 (MQ=255) cTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTaaaa > 2:1944799/1‑150 (MQ=255) tATCAACCCGAAGATCTTGGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAAt < 2:3929571/150‑1 (MQ=255) tCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGa < 1:3349064/150‑1 (MQ=255) cAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGAc < 1:3736697/150‑1 (MQ=255) aaCCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGAcc > 2:2502976/1‑150 (MQ=255) cccGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTg < 2:1298890/150‑1 (MQ=255) ccGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTgg > 2:1261198/1‑150 (MQ=255) cGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTAGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGa < 1:2748343/150‑1 (MQ=255) aaGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGAtt > 1:3932136/1‑150 (MQ=255) aaGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGAtt > 1:2789805/1‑150 (MQ=255) aTCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATc > 2:4001494/1‑150 (MQ=255) tCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATcc < 2:218532/150‑1 (MQ=255) tCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATcc > 2:708544/1‑150 (MQ=255) cTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATccc < 1:2931713/150‑1 (MQ=255) ttGTACCATCCATAATCCAATTGGATATTTGCAGGATTTTATTGCATTTGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCctc < 2:4628689/150‑1 (MQ=255) tGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCctct > 2:3693072/1‑150 (MQ=255) tACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTctgc > 2:3239640/1‑150 (MQ=255) tACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTctgc > 2:4201268/1‑150 (MQ=255) ccatAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGatat < 1:256980/150‑1 (MQ=255) aTCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAg < 2:4429087/150‑1 (MQ=255) aTCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAg < 2:947337/150‑1 (MQ=255) gggAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGTTTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGAt < 1:4421869/150‑1 (MQ=255) gggAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGAt < 1:1142540/150‑1 (MQ=255) gagaTTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCa > 1:713062/1‑150 (MQ=255) gagaTTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCa > 1:3028485/1‑150 (MQ=255) agaTTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAg > 2:452704/1‑150 (MQ=255) agaTTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGAGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAg > 2:4162079/1‑150 (MQ=255) gaTTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGt < 2:3681248/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTaaa > 1:984848/1‑150 (MQ=255) tGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAg > 2:2117339/1‑150 (MQ=255) cAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGat < 2:4385135/150‑1 (MQ=255) cAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGat > 1:597015/1‑150 (MQ=255) aGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGata < 2:62715/150‑1 (MQ=255) aGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGata > 1:3563704/1‑150 (MQ=255) gATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGAtata < 1:2824195/150‑1 (MQ=255) aTTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAg > 2:1978782/1‑150 (MQ=255) tttATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGaa > 2:2919923/1‑150 (MQ=255) tttATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGaa > 2:4013630/1‑150 (MQ=255) tttATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGaa < 2:3149496/150‑1 (MQ=255) ttATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTAGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAg > 1:2916815/1‑150 (MQ=255) tATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAgg > 1:3558183/1‑150 (MQ=255) tGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATcc > 1:3112875/1‑150 (MQ=255) tGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATcc > 2:1894218/1‑150 (MQ=255) tGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATcc < 2:981561/150‑1 (MQ=255) gTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATAGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCt < 2:3452940/150‑1 (MQ=255) aGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTa < 1:3971017/150‑1 (MQ=255) aTGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTAtt > 1:1692217/1‑150 (MQ=255) tAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCa < 1:79279/150‑1 (MQ=255) tAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCa > 1:1623550/1‑150 (MQ=255) aaaaaTTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCAAg > 1:826215/1‑150 (MQ=255) aaaaTTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCAAgg < 1:1005815/150‑1 (MQ=255) ttGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCAAGGTCAgg < 2:1647830/150‑1 (MQ=255) tGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCAAGGTCAGGt > 2:810534/1‑150 (MQ=255) tataGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCAAGGTCAGGtttt > 1:1846487/1‑150 (MQ=255) tATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCAAGGTCAGGtttt > 1:4467310/1‑150 (MQ=255) aTCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCAAGGTCAGGTTTTg > 1:3226050/1‑150 (MQ=255) aTCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCAAGGTCAGGTTTTg < 1:2187283/150‑1 (MQ=255) | TCCGCGCCGACGGACCAGAAACTCCCGAAGAAGAAAAGGGTTACTGGTTTCATGCTTATCAACCCGAAGATCTTTGTACCATCCATAATCCAATGGGAGATTTGCAGGATTTTATTGCATTGGTTAAAGATGCTAAAAAATTTGGTATCGATATCATTCCTGATTATACCTTTAACTTTATGGGAATTGGGGGTAGTGGTAAAAATGACCTGGATTATCCCTCTGCTGATATACGAGCGAAGATCAGTAAAGATATAGAAGGTGGTATCCCTGGCTATTAGCAAGGTCAGGTTTTG > CP009273/2780513‑2780808 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |