| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 2,884,385 | G→T | 8.8% | V291V (GTC→GTA) | cysJ ← | sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 2,884,385 | 0 | G | T | 8.8% | 1095.8 / 49.6 | 292 | V291V (GTC→GTA) | cysJ | sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (105/161); new base T (11/15); total (116/176) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
AGTGTTTCACTGCGGGTAAGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTGGTTAACAGA > CP009273/2884236‑2884534 | agTGTTTCACTGCGGGTAAGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCg < 1:4027253/150‑1 (MQ=255) ttCACTGCGGGTAAGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAg < 1:3406662/150‑1 (MQ=255) tGCGGGTAAGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCtt > 1:2244011/1‑150 (MQ=255) cGGGTAAGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTc < 2:4300860/150‑1 (MQ=255) ggTAAGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCAc < 1:4533833/150‑1 (MQ=255) ggTAAGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCAc > 2:3568389/1‑150 (MQ=255) aaGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAg > 1:1194001/1‑150 (MQ=255) aaGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAg > 1:1487136/1‑150 (MQ=255) aaGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTCTCACCAg < 1:1111514/150‑1 (MQ=255) aGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGt < 1:2320141/150‑1 (MQ=255) gTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGcc < 1:3640053/150‑1 (MQ=255) tGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCg > 2:521858/1‑150 (MQ=255) ggCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCgg > 2:279998/1‑150 (MQ=255) cGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGAt < 1:1011659/150‑1 (MQ=255) gTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATc < 1:4068327/150‑1 (MQ=255) gTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATc < 1:1398949/150‑1 (MQ=255) aaTTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCTACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGt > 2:3781404/1‑150 (MQ=255) aaTTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGt > 1:3081261/1‑150 (MQ=255) aTTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGtt < 2:4369590/150‑1 (MQ=255) ttCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTc < 2:2506877/150‑1 (MQ=255) ttCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTAGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTACTACAAGTTATTTCACCAGTGCCGGATCGTTc > 1:639318/1‑150 (MQ=255) tctcAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCACCGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCTACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCt > 2:3141534/1‑150 (MQ=255) aacaaTGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATa < 2:1977828/150‑1 (MQ=255) caaTGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATAcc < 1:3896966/150‑1 (MQ=255) caaTGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATAcc < 2:2652644/150‑1 (MQ=255) caaTGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATAcc < 1:1573658/150‑1 (MQ=255) aaTGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCa < 1:1912483/150‑1 (MQ=255) aaTGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCa > 2:1664280/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGa > 2:2279169/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGAc < 2:2884991/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCTACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACg < 1:3232400/150‑1 (MQ=255) gCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGccc < 2:3360206/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCa < 2:3969080/150‑1 (MQ=255) gACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTc > 2:1221145/1‑150 (MQ=255) gACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGGTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTc > 2:1291559/1‑150 (MQ=255) ggTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCTACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCAcc < 2:3409143/150‑1 (MQ=255) gTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCAccc < 2:4003419/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCgg > 1:1502706/1‑150 (MQ=255) cGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGt < 2:2704098/150‑1 (MQ=255) cGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGt > 1:2734784/1‑150 (MQ=255) gAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTa > 1:380387/1‑150 (MQ=255) gAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTa < 2:1901050/150‑1 (MQ=255) gAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTa > 1:517573/1‑150 (MQ=255) aGTGCAACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGATTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTACAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAAc < 2:2067530/150‑1 (MQ=255) tGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGccc > 1:856062/1‑150 (MQ=255) tGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGccc < 1:1011350/150‑1 (MQ=255) tGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGccc < 2:2956794/150‑1 (MQ=255) aGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAg > 1:1458904/1‑150 (MQ=255) cAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTc < 1:2545013/150‑1 (MQ=255) cAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTc < 2:145232/150‑1 (MQ=255) agagGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCa < 1:4596411/150‑1 (MQ=255) gagGCAACGTTTTGCCCTCGACGGAGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTACTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCaa > 2:3823239/1‑150 (MQ=255) ggCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAAtt < 1:3054143/150‑1 (MQ=255) gCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAAttt < 2:570875/150‑1 (MQ=255) gCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAAttt < 1:3171657/150‑1 (MQ=255) aaCGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCg < 1:2640961/150‑1 (MQ=255) tGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGc < 2:3221728/150‑1 (MQ=255) gCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCg < 2:837273/150‑1 (MQ=255) cccTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGa > 1:1890956/1‑150 (MQ=255) ccTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGaa < 1:2151765/150‑1 (MQ=255) cTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAAc < 1:793703/150‑1 (MQ=255) cTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAAc < 1:1289136/150‑1 (MQ=255) cGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGt < 1:1456790/150‑1 (MQ=255) aCGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCt < 1:2216335/150‑1 (MQ=255) cGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCtt < 2:2063473/150‑1 (MQ=255) cGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCtt < 2:2351472/150‑1 (MQ=255) tGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAATTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGTTATGGCGAACGTCttttt > 1:2415335/1‑150 (MQ=255) gACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTc > 1:2201095/1‑150 (MQ=255) gACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTc > 1:3187884/1‑150 (MQ=255) gACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTc < 2:4551790/150‑1 (MQ=255) gACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTc > 1:590063/1‑150 (MQ=255) aCAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCa < 2:472108/150‑1 (MQ=255) aCAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCa < 1:2485246/150‑1 (MQ=255) aCAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGAGACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCa < 2:2244011/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCag < 2:905089/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCag < 2:2921226/150‑1 (MQ=255) ggTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCTACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCagag < 2:3670044/150‑1 (MQ=255) ggTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCagag > 2:3052584/1‑150 (MQ=255) gTTCATNGCCTTTCAGCCACAGCANTTCGACAANTTCTTTCACNAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGt < 1:3451610/150‑1 (MQ=255) gTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGt < 1:1885117/150‑1 (MQ=255) tCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCTACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTa > 2:4440599/1‑150 (MQ=255) cATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTAc < 1:3282000/150‑1 (MQ=255) cATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTAc < 1:4246036/150‑1 (MQ=255) tCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGc > 1:2946090/1‑150 (MQ=255) cGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGcc < 1:4385388/150‑1 (MQ=255) ccTTTCAGCCACAGCAGTTCTACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCg < 2:1084650/150‑1 (MQ=255) ccTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCg < 2:3609784/150‑1 (MQ=255) cTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCgg < 1:2572976/150‑1 (MQ=255) ttCAGCCACAGCAGTTCTACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTa < 1:692714/150‑1 (MQ=255) cacaGCAGTTCTACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTc < 2:21934/150‑1 (MQ=255) acaGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCt > 2:656506/1‑150 (MQ=255) agcagTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTgg > 2:3453445/1‑150 (MQ=255) agcagTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTgg > 2:761729/1‑150 (MQ=255) cagTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTGGtt < 2:1307863/150‑1 (MQ=255) cagTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTGGtt < 2:4097246/150‑1 (MQ=255) cagTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTGGtt < 2:1770633/150‑1 (MQ=255) cagTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTGGtt > 2:2399570/1‑150 (MQ=255) ttCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTGGTTAAc > 1:1244866/1‑150 (MQ=255) ttCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTGGTTAAc > 1:985853/1‑150 (MQ=255) gACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTGGTTAACaga > 1:3694490/1‑150 (MQ=255) | AGTGTTTCACTGCGGGTAAGCGTGGCGTAATTCTCAACAATGTTGGCGGTGTTGACGGTCAGTTCGAAGTGCCACTGTAGCGCTTCGTTCAGAGGCAACGTTTTGCCCTCGACGGTGACAGGTTCATCGCCTTTCAGCCACAGCAGTTCGACAAGTTCTTTCACCAGTGCCGGATCGTTCTGATACCAGACGCCCAGCGCGTCACCCGGCTGGTAACGCATGCCCGAGTCACCTAAGTCAATTTCGATATGGCGAACGTCTTTTTCAGAGTTACGCCCGGTAATTTTCTGGTTAACAGA > CP009273/2884236‑2884534 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |