| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,035,271 | G→T | 48.3% | V200V (GTG→GTT) | ygfZ → | iron‑sulfur cluster repair protein, plumbagin resistance |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,035,271 | 0 | G | T | 48.3% | 184.6 / inf | 289 | V200V (GTG→GTT) | ygfZ | iron‑sulfur cluster repair protein, plumbagin resistance |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (70/79); new base T (80/60); total (150/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.92e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
TTGCTATGGTTTGAACACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTGCGCTCTGG > CP009273/3035122‑3035418 | ttGCTATGGTTTGAACACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGtg > 2:2234563/1‑150 (MQ=255)ttGCTATGGTTTGAACACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGtg < 2:3106520/150‑1 (MQ=255) gCTATGGTTTGAACACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGttat > 1:98868/1‑150 (MQ=255) aTGGTTTGAACACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGttattga < 1:1488847/150‑1 (MQ=255) tGAACACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATgccgc > 1:3612891/1‑150 (MQ=255) aaCACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCa > 1:751863/1‑150 (MQ=255) acCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGACGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACa < 2:4277837/150‑1 (MQ=255) cccGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAg < 1:4439957/150‑1 (MQ=255) cccGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAg > 2:504603/1‑150 (MQ=255) ccGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGc < 1:4096727/150‑1 (MQ=255) cGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGttt > 1:4465611/1‑150 (MQ=255) ttCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATc > 1:1430936/1‑150 (MQ=255) tCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATcc < 1:2818775/150‑1 (MQ=255) tCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATcc > 2:4354264/1‑150 (MQ=255) cTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCca < 1:4352673/150‑1 (MQ=255) gATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCcaca > 1:2481014/1‑150 (MQ=255) tCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAgg < 2:19387/150‑1 (MQ=255) cGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGc < 2:3545509/150‑1 (MQ=255) gTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATATCCAACATTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGTTTATTTATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCg < 2:3003634/150‑1 (MQ=255) aaCCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGAc > 2:4306902/1‑150 (MQ=255) ccGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCa < 1:2539062/150‑1 (MQ=255) ccGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCa > 2:3459476/1‑150 (MQ=255) tGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAAtct > 1:4138466/1‑150 (MQ=255) tGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAAtct < 2:587047/150‑1 (MQ=255) aGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCa < 1:3522887/150‑1 (MQ=255) gCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAg > 2:2673043/1‑150 (MQ=255) gCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAg < 1:3332127/150‑1 (MQ=255) gCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAg < 1:4259426/150‑1 (MQ=255) gCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAg > 2:4065640/1‑150 (MQ=255) cTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAgg < 2:3661373/150‑1 (MQ=255) tGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCt < 2:3277994/150‑1 (MQ=255) gCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTg > 2:2238597/1‑150 (MQ=255) gCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGAGTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTg > 2:3129572/1‑150 (MQ=255) cTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTgg < 2:130317/150‑1 (MQ=255) cTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTgg > 1:3418254/1‑150 (MQ=255) atatGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCg > 2:3913917/1‑150 (MQ=255) tGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTa < 2:1386166/150‑1 (MQ=255) cTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATc > 1:3250458/1‑150 (MQ=255) tGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCa > 2:1285167/1‑150 (MQ=255) tGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCa > 2:3642233/1‑150 (MQ=255) tGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCa < 1:1765547/150‑1 (MQ=255) aCCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGc > 1:2716120/1‑150 (MQ=255) aaCTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACACTAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGa < 2:2912657/150‑1 (MQ=255) aCTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGaa > 1:2310497/1‑150 (MQ=255) gcgcGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAgg < 2:1834297/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGc < 1:1636140/150‑1 (MQ=255) cgGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTg < 1:3054795/150‑1 (MQ=255) ggTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGACAGGCTGt > 1:1203187/1‑150 (MQ=255) ggTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGt > 1:621587/1‑150 (MQ=255) tGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGTTGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTta > 1:4610912/1‑150 (MQ=255) tGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTta > 2:4538114/1‑150 (MQ=255) aGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATAc < 2:411805/150‑1 (MQ=255) aGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATAc > 2:3193106/1‑150 (MQ=255) cTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACaa > 1:3375590/1‑150 (MQ=255) cTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACaa < 1:3396980/150‑1 (MQ=255) cAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGAt > 2:938166/1‑150 (MQ=255) aaTAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGAtg < 1:207806/150‑1 (MQ=255) aaTAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGAtg < 1:207752/150‑1 (MQ=255) aaTAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGAtg < 1:2991705/150‑1 (MQ=255) tAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGAtggt > 2:3406789/1‑150 (MQ=255) aGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGAtggtg < 2:4564452/150‑1 (MQ=255) aGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGAtggtg < 1:4592568/150‑1 (MQ=255) gCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGAtggtgg > 2:3232242/1‑150 (MQ=255) ccAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGgc < 1:4392230/150‑1 (MQ=255) ccAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGgc < 1:1064879/150‑1 (MQ=255) aaCAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGgcgc > 1:3997654/1‑150 (MQ=255) cAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGa > 2:3721246/1‑150 (MQ=255) aGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAg > 2:1506594/1‑150 (MQ=255) aGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAg > 1:4139044/1‑150 (MQ=255) tggctggcATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTAATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCa > 2:4169305/1‑150 (MQ=255) tggcATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAAt > 2:1178597/1‑150 (MQ=255) ggcATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAAtt < 2:4242499/150‑1 (MQ=255) ggcATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAAtt < 1:3716065/150‑1 (MQ=255) ggcATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAAtt > 1:4361319/1‑150 (MQ=255) gcATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTc > 2:3942882/1‑150 (MQ=255) aTTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCg > 1:3833405/1‑150 (MQ=255) ttAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCgt > 1:773479/1‑150 (MQ=255) ttAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCgt > 1:1704404/1‑150 (MQ=255) ttAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCgt > 1:1878935/1‑150 (MQ=255) aaaCATTGAAGCGGGTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCgtgg < 1:648364/150‑1 (MQ=255) aCATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCACCAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCgtggtg < 2:743870/150‑1 (MQ=255) aCATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACCGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCgtggtg < 1:904029/150‑1 (MQ=255) aTTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGcc > 2:2496720/1‑150 (MQ=255) aTTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGcc > 2:1800795/1‑150 (MQ=255) aTTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGcc < 1:4074356/150‑1 (MQ=255) ttGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCa < 1:1006162/150‑1 (MQ=255) gAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAAt > 2:335239/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAAt > 1:2679505/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAAt > 2:1541816/1‑150 (MQ=255) aGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATaa > 1:2363174/1‑150 (MQ=255) gggTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACg > 1:2246784/1‑150 (MQ=255) ggTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGt > 1:193421/1‑150 (MQ=255) ggTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGt > 2:2020578/1‑150 (MQ=255) ggTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGt > 2:347588/1‑150 (MQ=255) gTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCACAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTg > 1:3433024/1‑150 (MQ=255) gTTTCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTg < 2:904153/150‑1 (MQ=255) tttCCCGGTTATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTgc < 2:3152507/150‑1 (MQ=255) tCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTgcgc > 1:1398267/1‑150 (MQ=255) ccGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTGCGctc > 2:1975669/1‑150 (MQ=255) gTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTGCGCTCTgg < 1:114285/150‑1 (MQ=255) | TTGCTATGGTTTGAACACCCGGCAGAACGTTTCCTGATCGTAACCGATGAAGCTACTGCTAATATGCTGACCGATAAACTGCGCGGTGAAGCGGAACTGAACAATAGCCAACAGTGGCTGGCATTAAACATTGAAGCGGGTTTCCCGGTGATTGATGCCGCCAACAGCGGGCAGTTTATCCCACAGGCGACCAATCTCCAGGCGCTGGGCGGTATCAGCTTTAAGAAAGGCTGTTATACCGGACAAGAGATGGTGGCGCGAGCAAAATTCCGTGGTGCCAATAAACGTGCGCTCTGG > CP009273/3035122‑3035418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |