| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,068,854 | C→A | 41.1% | E230* (GAG→TAG) | yggF ← | fructose 1,6 bisphosphatase isozyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,068,854 | 0 | C | A | 41.1% | 327.7 / inf | 282 | E230* (GAG→TAG) | yggF | fructose 1,6 bisphosphatase isozyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (86/80); new base A (63/53); total (149/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.17e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
AAAGAGGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCAAAAA > CP009273/3068705‑3069003 | aaaGAGGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTc < 2:1412044/150‑1 (MQ=255) agGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGcc > 1:1073414/1‑150 (MQ=255) agGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGcc > 1:2543584/1‑150 (MQ=255) agGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGcc < 1:806528/150‑1 (MQ=255) agGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGcc < 2:4353635/150‑1 (MQ=255) agGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGcc < 2:3909152/150‑1 (MQ=255) atCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCat < 1:1254791/150‑1 (MQ=255) atCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCat < 1:2938553/150‑1 (MQ=255) gTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATc > 2:2178027/1‑150 (MQ=255) gTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATc > 1:1988602/1‑150 (MQ=255) gTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATc > 1:3578510/1‑150 (MQ=255) cccccTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATcccc > 2:1051411/1‑150 (MQ=255) accTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGc > 2:4513811/2‑150 (MQ=255) cACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTaa > 2:557642/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATg < 1:888764/150‑1 (MQ=255) cAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGc < 1:1023395/150‑1 (MQ=255) aGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCt < 2:168114/150‑1 (MQ=255) gTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCtt < 1:1487871/150‑1 (MQ=255) ttaaTCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCAGTGGCTTGCTACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCGGCCTACTGCttt < 2:3132107/147‑1 (MQ=255) ttCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCttt < 2:3483017/150‑1 (MQ=255) ttCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCttt < 2:1114763/150‑1 (MQ=255) tCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTa > 1:1958768/1‑150 (MQ=255) tCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTa > 1:2621637/1‑150 (MQ=255) aTCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTTCATATCCCCGCCTATTGCTTTAAc < 2:578399/150‑1 (MQ=255) aTCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAAc > 1:3131572/1‑150 (MQ=255) aTCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAAc < 1:4342870/150‑1 (MQ=255) aTCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAAc > 2:2075246/1‑150 (MQ=255) cgagcgagTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACgg < 2:3045668/150‑1 (MQ=255) cgagcgagTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACgg < 2:1460464/150‑1 (MQ=255) gagcgagTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGc > 2:3618779/1‑150 (MQ=255) gagcgagTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGc > 1:179410/1‑150 (MQ=255) agTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAgg < 1:4096078/150‑1 (MQ=255) gTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGc < 2:4406452/150‑1 (MQ=255) tACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCa > 2:2912090/1‑150 (MQ=255) acacacGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAg < 1:4491659/150‑1 (MQ=255) cacacGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGa > 2:956754/1‑150 (MQ=255) acacGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGaa > 1:990697/1‑150 (MQ=255) cacGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGaaa < 2:3239713/150‑1 (MQ=255) acGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAAt < 2:2131421/150‑1 (MQ=255) acGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAAt > 2:4163479/1‑150 (MQ=255) ggTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCa > 1:4516980/1‑150 (MQ=255) gTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCAc < 2:1229549/150‑1 (MQ=255) gTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCAc < 2:3547660/150‑1 (MQ=255) gTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCAc < 2:2038655/150‑1 (MQ=255) gTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCCCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCAc > 1:2391493/1‑150 (MQ=255) cGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCtt < 2:2568894/150‑1 (MQ=255) gTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTc < 2:3185251/150‑1 (MQ=255) cGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGgcg < 1:2834241/150‑1 (MQ=255) gCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGgcgc > 1:2479647/1‑150 (MQ=255) cATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCAcc > 1:3416499/1‑150 (MQ=255) aTTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCAccg > 1:2328958/1‑150 (MQ=255) ccTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGa > 2:4216035/1‑150 (MQ=255) ccTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGa < 1:2806730/150‑1 (MQ=255) ccTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGa > 1:142711/1‑150 (MQ=255) cTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGAAATCCCCATAAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCAAAACCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGAt > 2:4129154/1‑150 (MQ=255) ttGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATg < 2:4012698/150‑1 (MQ=255) tGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATgg < 2:168462/150‑1 (MQ=255) gCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGgt < 2:3679351/150‑1 (MQ=255) cGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCTCCTAATGATTTAACGGCACAGGCAGAAAACACGCCTTCTGGAGCACCGCCGAAGGTGTac > 1:3301611/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTacat > 2:601733/1‑150 (MQ=255) cgcTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTacatcaca < 1:3208699/150‑1 (MQ=255) cgcTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCGGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTacatcaca < 1:3208781/150‑1 (MQ=255) cTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTacatcacatc > 1:1693463/1‑150 (MQ=255) tCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCg > 2:3468781/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGt > 2:3146611/1‑150 (MQ=255) cTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTCCATCACATCGTa > 1:3884492/1‑150 (MQ=255) cTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTa < 1:4571095/150‑1 (MQ=255) tctGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGa > 1:1278407/1‑150 (MQ=255) ctGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGAt > 2:4380227/1‑150 (MQ=255) aaTCTGCCGATTTTCCNTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCNGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATc > 2:2360655/1‑150 (MQ=255) aTCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATcc > 1:1364760/1‑150 (MQ=255) cTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCGCATCGTAAGGATTATCCTg < 1:3699457/150‑1 (MQ=255) gCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGcc < 1:1314744/150‑1 (MQ=255) gCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGcc < 2:1584953/150‑1 (MQ=255) ccGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCca < 2:1756071/150‑1 (MQ=255) gATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCcagc > 2:2720397/1‑150 (MQ=255) gATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCcagc > 2:85453/1‑150 (MQ=255) aTTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCcagca > 1:2911800/1‑150 (MQ=255) tCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTc < 1:1583911/150‑1 (MQ=255) ccGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCa > 2:1373632/1‑150 (MQ=255) tgtAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCa > 2:820089/1‑150 (MQ=255) tgtAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCa < 1:483473/150‑1 (MQ=255) gtAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCATTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGGAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCAc > 1:4471561/1‑150 (MQ=255) aaTCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGAGTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGc > 2:225173/1‑150 (MQ=255) tCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTg < 1:673338/150‑1 (MQ=255) ccccTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTgg > 1:3841039/1‑150 (MQ=255) cTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTggcgg > 2:3385378/1‑150 (MQ=255) tAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGa > 1:1603632/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGAc > 1:4013945/1‑150 (MQ=255) ggCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGc > 2:720472/1‑150 (MQ=255) aaaGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATc > 1:781350/1‑150 (MQ=255) aGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCg > 1:3614529/1‑150 (MQ=255) aGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACACCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCg > 1:1471549/1‑150 (MQ=255) cAATCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCa > 2:3770119/1‑150 (MQ=255) aaTCAGCTAGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAg > 1:4162049/1‑150 (MQ=255) aGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCa < 2:3869758/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCaaa > 2:1888201/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCaaa < 2:1958768/150‑1 (MQ=255) tCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCaaaa > 1:2987653/1‑150 (MQ=255) tCGGCATGCATATCACCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCaaaa > 2:1960624/1‑150 (MQ=255) | AAAGAGGATATCGTTCCCCCTCACCAGTTCATCGAGCGAGTACACACGGTTAACGTCAACGCCCATTGCCTTGCAACGCTTGCGCTCCTGCTCTGCAATCTGCCGATTTTCCGTGTAATCCCCTTTAGCCTGGCAAAAGTCAATCAGCTCGGCCTGCATATCCCCGCCTAATGCTTTAACGGCACAGGCAGAAATCACGCCTTCTGGCGCACCGCCGATGGTGTACATCACATCGTAAGGATTATCCTGCCAGCAGGTCAGCACGCTGGCGGCGACATCGCCATCCGGCAGGGCAAAAA > CP009273/3068705‑3069003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |