Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 738,124 | 1 | . | T | 12.8% | 1009.5 / 165.8 | 273 | intergenic (‑112/‑159) | dtpD/ybgI | dipeptide and tripeptide permease D/NIF3 family metal‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (110/128); new base T (24/11); total (134/139) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.79e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
TAGTAAATAGCGCGCGGCTGTGATGCGTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGA‑TTGCATAAATATACATTAGCTGAAGCGTGATGATATAAACAATTTGCGTCTTTTGGCGTCGGGTTTGTTTCTTAATATGTCAAAAGATTGGCTATCGACGAACTGGCGAGGTAACGCTATGTTAACGGTGTAGCTATCAGAATACGGAA > CP009273/737975‑738273 | tAGTAAATAGCGCGCGGCTGTGATGCGTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGa < 2:1260722/150‑1 (MQ=255) gTAAATAGCGCGCGGCTGTGATGCGTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGA‑tt > 1:4122800/1‑150 (MQ=255) gcgcgGCTGTGATGCGTGTTTATTCATAATAATTCCACAATTGACGGCAACGTCACGTAATAGTTGCGCGGCGTGCTTGTGTTTCCTTAAAGTTAAAACTTTGATACAGATCTGATTATTTATGCAATATGCTGTCTGA‑TTGCATAAata < 1:1089567/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |