New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 360652 = | 274 (1.030) | 6204 (34.960) +AATTAATGTAAGTTAGCGCGAATTGATCTGGTTTGACAGCTTATCA |
186/186 | NT | 97.4% | intergenic (‑586/+9) | lacZ/lacI | pseudogene, truncated/DNA‑binding transcriptional repressor |
? | CP009273 | = 1317577 | 220 (0.830) | coding (101/882 nt) | yciV | PHP domain protein |
Only 100 of 11013 total aligned reads displayed.
ACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCAGCAAGAGAGGAAATTTCACGTTCGGGACTGGCGTTGAATCTTATTCCCGGCGTGGAAATTTCCACGGTCTGGGAAAATCATGAAATTCATA > CP009273/1317428‑1317726 | aCCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCga > 1:3099249/1‑150 (MQ=255) aCCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCga > 1:3457877/1‑150 (MQ=255) ccGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAt > 1:3283393‑M2/1‑149 (MQ=255) ccGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAt > 2:664903‑M2/1‑149 (MQ=255) ccGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAt > 1:3640‑M2/1‑149 (MQ=255) cGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtg < 1:1919769‑M2/150‑3 (MQ=255) atgTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagct > 1:495608‑M2/1‑141 (MQ=255) tgTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctg > 1:998304‑M2/1‑140 (MQ=255) tgTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctg > 1:4253624‑M2/1‑140 (MQ=255) tCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtc > 1:736758‑M2/1‑138 (MQ=255) ggCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaa < 2:1258329‑M2/150‑15 (MQ=255) gcgcAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaa > 2:1503995‑M2/1‑135 (MQ=255) cgcAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaac < 1:2419654‑M2/150‑17 (MQ=255) cgcAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaac < 2:2053325‑M2/150‑17 (MQ=255) gcAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaacc > 1:169325‑M2/1‑133 (MQ=255) gcAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaacc > 2:4350711‑M2/1‑133 (MQ=255) cAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaacca > 2:3796361‑M2/1‑132 (MQ=255) aaaaaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccag > 2:810299‑M2/1‑131 (MQ=255) aaaaaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCAGTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccag < 2:230620‑M2/150‑20 (MQ=255) aaaaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccaga < 2:420884‑M2/150‑21 (MQ=255) aaaaCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagat < 1:1516064‑M2/150‑22 (MQ=255) aCATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaa > 2:3058707‑M2/1‑126 (MQ=255) aTTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaatt > 2:2219186‑M2/1‑124 (MQ=255) aTTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaatt < 2:4272298‑M2/150‑27 (MQ=255) aTTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaatt > 2:2488017‑M2/1‑124 (MQ=255) aTTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaatt > 2:4605479‑M2/1‑124 (MQ=255) ttATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattc > 1:2258492‑M2/1‑123 (MQ=255) tATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcg > 1:2789134‑M2/1‑122 (MQ=255) tATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcg > 1:116128‑M2/1‑122 (MQ=255) gACCGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaa > 2:1175297‑M2/1‑116 (MQ=255) gAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaa < 1:1426261‑M2/150‑35 (MQ=255) aaCGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaac < 1:2945953‑M2/150‑36 (MQ=255) aaCGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaac < 1:3031900‑M2/150‑36 (MQ=255) aCGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaact < 2:902002‑M2/150‑37 (MQ=255) gggAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaactta < 1:2603369‑M2/150‑39 (MQ=255) gAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttaca > 2:1418587‑M2/1‑110 (MQ=255) gTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacatt > 1:2173207‑M2/1‑108 (MQ=255) tGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacatta > 1:400752‑M2/1‑107 (MQ=255) tGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacatta > 2:3632293‑M2/1‑107 (MQ=255) cgcCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaat > 2:2989420‑M2/1‑105 (MQ=255) gcCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaatt > 1:2697256‑M2/1‑104 (MQ=255) gcCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaatt > 2:3955728‑M2/1‑104 (MQ=255) tGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgt < 1:4100040‑M2/150‑51 (MQ=255) aGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttg < 2:313694‑M2/150‑53 (MQ=255) gagtcacgattTATTCTGTGATTTACGACCTGCACAGCCATAAAACAGCTTCCTATGGCTGCCTGACGCAAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTAGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacagtatttgcgtttc > 2:1585456‑M2/5‑97 (MQ=255) gCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgc > 1:4336814‑M2/1‑97 (MQ=255) gCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgc < 2:386648‑M2/150‑54 (MQ=255) acGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCa < 2:27344/150‑1 (MQ=255) aaTTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactg > 2:2911483‑M2/1‑89 (MQ=255) aTTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgc > 2:1344705‑M2/1‑88 (MQ=255) tATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgccc > 2:3216016‑M2/1‑86 (MQ=255) tATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgccc > 1:2333635‑M2/1‑86 (MQ=255) aTGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccg < 1:1334129‑M2/150‑66 (MQ=255) aTGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccg < 1:1997452‑M2/150‑66 (MQ=255) tGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgc > 1:3740049‑M2/1‑84 (MQ=255) tGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgc < 2:730698‑M2/150‑67 (MQ=255) gCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgct > 2:2663362‑M2/1‑83 (MQ=255) cAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgagttgcgctcactgcccgctt > 1:1243741‑M2/1‑82 (MQ=255) gTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttc > 2:3476143‑M2/1‑80 (MQ=255) gATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGTATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttcca < 1:913619‑M2/150‑73 (MQ=255) aTTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccag < 1:4182065‑M2/150‑74 (MQ=255) ttACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtc < 2:4428735‑M2/150‑76 (MQ=255) tACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcg > 1:2093260‑M2/1‑74 (MQ=255) gACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcggga < 2:3715743‑M2/150‑80 (MQ=255) aCCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaa > 2:1679768‑M2/1‑70 (MQ=255) acaGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgt > 2:4042255‑M2/1‑64 (MQ=255) ccATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtg > 2:491373‑M2/1‑60 (MQ=255) cATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgc < 1:3188586‑M2/150‑92 (MQ=255) cATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgc < 2:4515975‑M2/150‑92 (MQ=255) aTACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgcc > 1:1614487‑M2/1‑58 (MQ=255) aCCTCAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccag < 1:577178‑M2/150‑95 (MQ=255) caGCTTCCGATGGATGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacatacataaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgc < 2:1758030‑M2/150‑99 (MQ=255) aGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgca < 2:2819260‑M2/150‑100 (MQ=255) tctTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCTAtgataatctctcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtagggaaacctgtcgtgccagctgcat > 1:1000366‑M2/2‑50 (MQ=255) gCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcat < 1:1841654‑M2/150‑101 (MQ=255) gCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtagggaaacctgtcgtgccagctgcat > 2:3305666‑M2/1‑50 (MQ=255) ttCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcatta > 2:1972194‑M2/1‑48 (MQ=255) ccGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaat > 1:1088422‑M2/1‑46 (MQ=255) ccGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaat > 1:1765847‑M2/1‑46 (MQ=255) gATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatga < 1:3362407‑M2/150‑107 (MQ=255) aTGGCTGCCTGAAGCCATAAGAATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgttaagctgtcaaaccagataaattcgcgctaacttacattatttgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaa > 1:3907310‑M2/1‑43 (MQ=255) tGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaat > 1:2508883‑M2/1‑42 (MQ=255) ccTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaataggcca > 1:3553053‑M2/1‑36 (MQ=255) cTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtagggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaa > 2:10879‑M2/1‑35 (MQ=255) tGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAggataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaaccagtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaac < 1:4508371‑M2/150‑117 (MQ=255) ccAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggcccacgcgcg < 1:836005‑M2/150‑122 (MQ=255) aaGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcgggga < 2:2143207‑M2/150‑126 (MQ=255) tGGTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcg > 2:184016‑M2/1‑19 (MQ=255) gTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggt > 1:4587830‑M2/1‑17 (MQ=255) gTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggt < 2:3391810‑M2/150‑134 (MQ=255) gTGCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggt > 2:2582751‑M2/1‑17 (MQ=255) gCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggttt > 2:3559770‑M2/1‑15 (MQ=255) gCACCGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtagggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggttt < 1:2873204‑M2/150‑136 (MQ=255) cGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgt > 1:4430676‑M2/1‑11 (MQ=255) cGTGCAGTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtagggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgt > 2:4130718‑M2/1‑11 (MQ=255) cGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCAGCAAGAGAGGAAATTTCACGTTCGGGACTGGCGTTGAATCTTATTCCCGGCGTGGAAATTTCCACGGTCTGGGAAAATCAt < 2:1905177/150‑1 (MQ=255) gTCGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattggg > 1:649050‑M2/1‑5 (MQ=255) cGAtgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgggcg > 1:3819025‑M2/1‑3 (MQ=255) gatgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtcgggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcggattgggcgc < 2:2408666‑M2/150‑149 (MQ=255) atgataagctgtcaaaccagatcaattcgcgctaacttacattaattgcgttgcgctcactgcccgctttccagtagggaaacctgtcgtgccagctgcattaatgaatcggccaacgcgcggggagaggcggtttgcgtattgggcgcc > 2:572768‑M2/1‑1 (MQ=255) | ACCGTTATGATGTCGGCGCAAAAAACATTATCCAGAACGGGAGTGCGCCTTGAGCGACACGAATTATGCAGTGATTTACGACCTGCACAGCCATACCACAGCTTCCGATGGCTGCCTGACGCCAGAAGCATTGGTGCACCGTGCAGTCGAGATGCGCGTCGGCACCCTGGCGATCACCGACCATGACACCACAGCTGCAATCGCGCCAGCAAGAGAGGAAATTTCACGTTCGGGACTGGCGTTGAATCTTATTCCCGGCGTGGAAATTTCCACGGTCTGGGAAAATCATGAAATTCATA > CP009273/1317428‑1317726 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |