| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,480,538 | C→A | 31.7% | A130E (GCG→GAG) | yhfK → | putative transporter, FUSC superfamily inner membrane protein, tandem domains |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,480,538 | 0 | C | A | 31.7% | 478.6 / 200.6 | 242 | A130E (GCG→GAG) | yhfK | putative transporter, FUSC superfamily inner membrane protein, tandem domains |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (76/89); new base A (40/37); total (116/126) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
GACACAGCTACTACTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTACCGTGAACTGGCAGATTATT > CP009273/3480389‑3480687 | gACACAGCTACTACTGTCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGc < 1:4508804/150‑1 (MQ=255)gACACAGCTACTACTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGc > 1:168986/1‑150 (MQ=255)gACACAGCTACTACTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGc < 1:3857200/150‑1 (MQ=255)gACACAGCTACTACTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGc > 1:3408043/1‑150 (MQ=255) acacAGCTACTACTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCg < 2:2160721/150‑1 (MQ=255) acacAGCTACTACTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCg > 2:1772083/1‑150 (MQ=255) aGCTACTACTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGAt < 1:2549753/150‑1 (MQ=255) gCTACTACTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATa > 2:2474695/1‑150 (MQ=255) tactacTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACa > 1:1535725/1‑150 (MQ=255) actGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGcc > 1:4471491/1‑150 (MQ=255) actGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGcc > 2:3184971/1‑150 (MQ=255) actGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGcc > 1:4170267/1‑150 (MQ=255) ctGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCg < 1:1417423/150‑1 (MQ=255) aaaaGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTg > 2:406209/1‑150 (MQ=255) aaaGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTgg < 1:3592796/150‑1 (MQ=255) aaGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTggg < 2:3046955/150‑1 (MQ=255) aaGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTggg > 1:3983510/1‑150 (MQ=255) aaGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGGACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTggg > 1:160801/1‑150 (MQ=255) aGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGa > 1:2219080/1‑150 (MQ=255) aTGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAAc > 1:3780823/1‑150 (MQ=255) aTGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAAc > 1:1546498/1‑150 (MQ=255) aTGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAAc > 1:3504173/1‑150 (MQ=255) tGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAAcc < 2:1519230/150‑1 (MQ=255) tGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAAcc > 2:2278605/1‑150 (MQ=255) gTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCg < 1:3089841/150‑1 (MQ=255) gTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCg > 2:1888177/1‑150 (MQ=255) gTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCg > 2:2506347/1‑150 (MQ=255) cccTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGc < 2:2798825/150‑1 (MQ=255) ccTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCt > 1:1436477/1‑150 (MQ=255) cTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTc > 2:3646514/1‑150 (MQ=255) gCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCAt < 2:4395521/150‑1 (MQ=255) tttGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGc > 2:3816596/1‑150 (MQ=255) tGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGt < 1:2776419/150‑1 (MQ=255) tGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGt < 2:474656/150‑1 (MQ=255) ccGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCa < 1:2503657/150‑1 (MQ=255) ccGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCa < 2:4381360/150‑1 (MQ=255) aTTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCActct < 1:3263261/150‑1 (MQ=255) ttAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCActctc > 2:2885399/1‑150 (MQ=255) cGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGt < 1:1742841/150‑1 (MQ=255) gCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTa < 1:1228708/150‑1 (MQ=255) gCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTa < 2:4341999/150‑1 (MQ=255) tGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACg > 1:2674042/1‑150 (MQ=255) gTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGa > 2:2493014/1‑150 (MQ=255) tACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGAt > 2:1036782/1‑150 (MQ=255) aCTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGAtt < 2:4437774/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGt > 2:57661/1‑150 (MQ=255) tGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGtt > 1:1380284/1‑150 (MQ=255) tGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGtt > 1:725941/1‑150 (MQ=255) tGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGtt > 1:3398329/1‑150 (MQ=255) gCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTa < 1:3442247/150‑1 (MQ=255) gCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTa < 2:742951/150‑1 (MQ=255) cGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTaa < 2:3688777/150‑1 (MQ=255) gTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAAc > 1:3971857/1‑150 (MQ=255) gTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAAc > 2:4127373/1‑150 (MQ=255) gTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAAc > 2:3371670/1‑150 (MQ=255) gTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAAc > 2:1797316/1‑150 (MQ=255) tgctgAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGtt < 1:1011411/150‑1 (MQ=255) tgctgAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGtt > 1:3419673/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTgg > 1:4429656/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTgg > 2:4235935/1‑150 (MQ=255) aGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGt > 1:4554461/1‑150 (MQ=255) cTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTc < 2:3487464/150‑1 (MQ=255) ggggCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTg < 2:1546644/150‑1 (MQ=255) ggCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGa < 2:168986/150‑1 (MQ=255) ggCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGa < 2:3422901/150‑1 (MQ=255) gCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGAt < 2:2926990/150‑1 (MQ=255) cATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCt < 2:1088243/150‑1 (MQ=255) cATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCt > 2:847599/1‑150 (MQ=255) tGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTgtc > 1:188597/1‑148 (MQ=255) cAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGaac < 1:4365316/150‑1 (MQ=255) cAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGaac < 1:916085/150‑1 (MQ=255) aaaaTTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGaaca > 2:2260201/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGaaca > 1:3939314/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGaaca > 1:2272763/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGaaca > 1:2567774/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTAAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGaaca > 2:1001950/1‑150 (MQ=255) aTTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAAcc > 2:1463279/1‑150 (MQ=255) aTTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAAcc < 1:1796325/150‑1 (MQ=255) ttGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCg > 1:2764303/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTg > 1:3528779/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTg < 2:549847/150‑1 (MQ=255) gCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAg > 1:3174211/1‑150 (MQ=255) gCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAg > 1:3174473/1‑150 (MQ=255) gCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAg > 2:3933684/1‑150 (MQ=255) gctgctCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACt > 2:2106327/1‑150 (MQ=255) tgctCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTaa > 2:1258765/1‑150 (MQ=255) tgctCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTaa > 2:1406402/1‑150 (MQ=255) ctCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGt > 2:1963947/1‑150 (MQ=255) tCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTc > 2:2692720/1‑150 (MQ=255) gccgccATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTctg > 1:3146387/1‑150 (MQ=255) ccgccATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTctgc > 2:4447102/1‑150 (MQ=255) tttttACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTAcc > 2:3127992/1‑150 (MQ=255) tttttACCCTCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTAcc < 2:3649437/150‑1 (MQ=255) cccTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTACCGTGAAc > 2:4306242/1‑150 (MQ=255) tCAGTTTGGAGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTACCGTGAACTgg < 1:841796/150‑1 (MQ=255) aGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTACCGTGAACTGGCa < 1:3631115/150‑1 (MQ=255) gTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTACCGTGAACTGGCAg < 2:1622534/150‑1 (MQ=255) ggCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTACCGTGAACTGGCAGatta < 2:4030324/150‑1 (MQ=255) ggCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTACCGTGAACTGGCAGatta < 2:1380284/150‑1 (MQ=255) cGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTACCGTGAACTGGCAGattatt > 1:2772041/1‑150 (MQ=255) | GACACAGCTACTACTGGCAAAAGATGTTCCCCTGCCCTTTTTGCTGACCGGATTAACGCTGGTACTTGGCGTCACTGCTGAGCTGGGGCCATTGCACGCAAAATTGCTTCCTGCATCGCTGCTCGCCGCCATTTTTACCCTCAGTTTGGCGGGATACATGCCGGTCTGGGAACCGTTGCTCATCTATGCGTTGGGCACTCTCTGGTACGGATTGTTTAACTGGTTTTGGTTCTGGATCTGGCGCGAACAACCGCTGCGCGAGTCACTAAGTCTGCTGTACCGTGAACTGGCAGATTATT > CP009273/3480389‑3480687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |