| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 3,797,033 | 0 | C | A | 16.1% | 822.6 / 95.7 | 258 | T155T (ACG→ACT) | waaB | UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑1, 6‑D‑galactosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (107/109); new base A (17/25); total (124/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.14e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 267 total aligned reads displayed.
CTTGTGATAAGCCATCAAGCAGGTCTTTAACTCTTTTCTGGCCTTCAAATTTCATACGCCCAACATAAATAAACGTTGCCGTTTCACCTTCCTCGGGCGCGGGAATGACTGAGTCTTTAGTTTCGACGGGATTAAAAATAACATTTATCGTCGATTCTGCTACACCTCGATTAATCATTTGCTGTTTAATGCCAGAGCTGATTGCTAAATGATAGTCGGCACAGGTGATATATTCAGCATGTTTTTTGTGATCTAAAGAAAAATGTGGCCATGAAAATACTGGCATATCAATTCCTG > CP009273/3796885‑3797181 | cTTGTGATAAGCCATCAAGCAGGTCTTTAACTCTTTTCTGGCCTTCAAATTTCATACGCCCAACATAAATAAACGTTGCCGTTTCACCTTCCTCGGGCGCGGGAATGACTGAGTCTTTAGTTTCGACGGGATTAAAAATAACATTTAtcg < 2:3239311/150‑1 (MQ=255) ttGTGATAAGCCATCAAGCATGTCTTTAACTCTTTTCTGGCCTTCAAATTTCATACGCCCAACATAAATAAACGTTGCCGTTTCACCTTCCTCGGGCGCGGGAATGACTGAGTCTTTAGTTTCGACGGGATTAAAAATAACATTTAtcgt < 1:3992978/150‑1 (MQ=255) ttGTGATAAGCCATCAAGCAGGTCTTTAACTCTTTTCTGGCCTTCAAATTTCATACGCCCAACATAAATAAACGTTGCCGTTTCACCTTCCTCGGGCGCGGGAATGACTGAGTCTTTAGTTTCGACGGGATTAAAAATAACATTTAtcgt < 2:2394988/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |