Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 3,885,881 | G→T | 5.6% | A303S (GCC→TCC) | mdtL → | multidrug efflux system protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 3,885,881 | 0 | G | T | 5.6% | 1269.5 / 29.0 | 329 | A303S (GCC→TCC) | mdtL | multidrug efflux system protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (184/126); new base T (5/14); total (189/140) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.16e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 338 total aligned reads displayed.
CCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTTGGCTGGCAGCGGTGGTTGGTATCGGC > CP009273/3885732‑3886030 | cATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGtt < 1:340905/150‑1 (MQ=255) cATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGtt < 2:2636533/150‑1 (MQ=255) ttCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTtc > 1:1521731/1‑150 (MQ=255) tctcCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTtct > 2:2110298/1‑150 (MQ=255) ctcCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTtctc > 2:996543/1‑150 (MQ=255) ctcCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTtctc < 1:3867948/150‑1 (MQ=255) ccACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCgg > 2:3432731/1‑150 (MQ=255) ccACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCgg > 2:2664880/1‑150 (MQ=255) gCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAgg > 2:4428323/1‑150 (MQ=255) ccATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGt > 2:4149899/1‑150 (MQ=255) ccATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTACACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGt > 2:3749712/1‑150 (MQ=255) aTTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGttt > 1:4567527/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTg < 2:144918/150‑1 (MQ=255) cgcTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCACGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGTATCACTCTAGCCGTTTCACCTTCCCAAGCGGTATCTCTGTTAGGAATCACGCAGAAATGCGCCGGGGACACGGTAGGTTTGGgtg > 2:2210874/1‑150 (MQ=255) cTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGtgtg > 1:2763999/1‑150 (MQ=255) ggAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCg < 2:3378283/150‑1 (MQ=255) ggAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCg > 1:1157984/1‑150 (MQ=255) ggAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCg < 1:2608762/150‑1 (MQ=255) ggAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCg < 1:2051620/150‑1 (MQ=255) tttAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGt < 2:1765420/150‑1 (MQ=255) ttAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTc < 1:2926515/150‑1 (MQ=255) aGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAgg < 1:2209560/150‑1 (MQ=255) aGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAgg > 1:888234/1‑150 (MQ=255) ccACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCg > 2:1296647/1‑150 (MQ=255) cACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGt > 2:546596/1‑150 (MQ=255) cACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGt > 1:4059695/1‑150 (MQ=255) gatgatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGtt < 2:1686049/150‑1 (MQ=255) gatgatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGtt > 1:739318/1‑150 (MQ=255) gatgatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGtt > 1:3843888/1‑150 (MQ=255) atgatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGtgt > 1:4398988/1‑148 (MQ=255) aggatCCCCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGttt < 2:3659098/148‑1 (MQ=255) gatCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTc < 1:253621/150‑1 (MQ=255) atCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCa > 1:3030885/1‑150 (MQ=255) atCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCa > 2:3337968/1‑150 (MQ=255) tCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCCCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCAt > 1:1814233/1‑150 (MQ=255) cACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCTGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTATGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCAtt < 1:3930626/150‑1 (MQ=255) aCCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTa < 1:4049521/150‑1 (MQ=255) ccTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGTTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTAc > 1:3014603/1‑150 (MQ=255) cAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGAGGTTTCTCTGTTTGGTATCACTCTGATTTGCTACGGTTTATCGGGAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTAAGGCGTTAGGGCCGTTTTAATTAcgagcg > 2:3597423/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCgg > 2:4623401/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCgg > 1:3250059/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCgg > 1:1492080/1‑150 (MQ=255) ggTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCggg > 2:4317334/1‑150 (MQ=255) tgtTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCg < 1:1577993/150‑1 (MQ=255) tATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAg > 1:2691173/1‑150 (MQ=255) tATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAg > 2:4027160/1‑150 (MQ=255) aTTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGc > 2:3487642/1‑150 (MQ=255) aTTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGc > 2:1045117/1‑150 (MQ=255) tCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCa < 2:3927487/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCTCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCt < 2:4588101/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCAATACGCGCGGGCGTATCCAGCt > 1:369579/1‑150 (MQ=255) gcggcgGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCg < 1:4392216/150‑1 (MQ=255) gcggcgGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCg < 1:1003700/150‑1 (MQ=255) 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ggATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAg < 1:3724957/150‑1 (MQ=255) gATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAgg < 2:1981778/150‑1 (MQ=255) aTCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGt > 2:1582393/1‑150 (MQ=255) tCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTa < 1:16373/150‑1 (MQ=255) aCTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTATGGCCGTTTTAATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTAtt > 1:1320608/1‑150 (MQ=255) 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ttCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTATCCACCTCGACCTTAGGTATTTCGCAGGTTTGCGGTTc > 1:1741018/1‑150 (MQ=255) ttCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTc > 2:3271083/1‑150 (MQ=255) tCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCGTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCg > 1:1655522/1‑150 (MQ=255) tGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACt > 1:171425/1‑150 (MQ=255) tGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCGTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACt > 2:2820885/1‑150 (MQ=255) 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tttCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGa > 2:1095323/1‑150 (MQ=255) ttCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGAt < 2:3036348/150‑1 (MQ=255) ctctGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGAttt < 1:426840/150‑1 (MQ=255) gTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTtggct < 2:2977707/150‑1 (MQ=255) tGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTtggctggc > 1:4445310/1‑150 (MQ=255) aTCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTTGGCTGGCAGCg > 2:4454955/1‑150 (MQ=255) tCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTTGGCTGGCAGCgg > 1:2279121/1‑150 (MQ=255) aCGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTTGGCTGGCAGCggtg < 2:2523905/150‑1 (MQ=255) cTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTTGGCTGGCAGCGGtggtt < 1:4293139/150‑1 (MQ=255) gATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTTGGCTGGCAGCGGtggttgg < 1:4160165/150‑1 (MQ=255) tttGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTTGGCTGGCAGCGGTGGTTGGTa < 1:2110298/150‑1 (MQ=255) tGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTTGGCTGGCAGCGGTGGTTGGTATc > 2:2098494/1‑150 (MQ=255) | CCGTTTCATTCTCCACGCCATTTGCGCTGGGAATTTTTAAGCCACGTACGTTGATGATCACCTCGCAGGTGTTATTCCTGGCGGCGGGGATCACTCTTGCCGTTTCACCTTCCCATGCGGTTTCTCTGTTTGGTATCACGCTGATTTGCGCCGGTTTCTCGGTAGGTTTTGGTGTGGCGATGAGTCAGGCGTTAGGGCCGTTTTCATTACGCGCGGGCGTAGCCAGCTCGACCTTAGGTATTGCGCAGGTTTGCGGTTCGTCACTGTGGATTTGGCTGGCAGCGGTGGTTGGTATCGGC > CP009273/3885732‑3886030 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |