| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,933,204 | C→T | 7.8% | D257N (GAT→AAT) | hsrA ← | putative multidrug or homocysteine efflux system |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,933,204 | 0 | C | T | 7.8% | 969.0 / 46.5 | 280 | D257N (GAT→AAT) | hsrA | putative multidrug or homocysteine efflux system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (121/137); new base T (14/8); total (135/145) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 282 total aligned reads displayed.
GTGCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAACAAGGC > CP009273/3933057‑3933353 | gTGCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTa > 2:4519666/1‑150 (MQ=255) gCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAAt < 2:1089872/150‑1 (MQ=255) gCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAAt > 2:4597275/1‑150 (MQ=255) gCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAAt < 1:3056831/150‑1 (MQ=255) gCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAAt > 1:1947316/1‑150 (MQ=255) catcatACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGa < 2:3500124/150‑1 (MQ=255) catACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAAt < 1:2497264/150‑1 (MQ=255) tACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTa > 2:866279/1‑150 (MQ=255) gccagcAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATgg > 2:3548796/1‑150 (MQ=255) agcAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGtt < 1:866108/150‑1 (MQ=255) tAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGgcg < 1:1711324/150‑1 (MQ=255) tAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGgcg < 2:3681701/150‑1 (MQ=255) aaCGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGgcgtg < 1:3522828/150‑1 (MQ=255) cGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGgcgtgcg < 1:3376174/150‑1 (MQ=255) ccTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGcgtc < 1:520637/150‑1 (MQ=255) ccTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGcgtc > 1:3567339/1‑150 (MQ=255) cTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGcgtcg > 2:1466874/1‑150 (MQ=255) tGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGcgtcgt > 2:3414126/1‑150 (MQ=255) aaCCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCAt < 1:1023400/150‑1 (MQ=255) aCCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATg > 1:626394/1‑150 (MQ=255) aaaTCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGgag < 1:136600/150‑1 (MQ=255) aaaTCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGgag > 1:2149159/1‑150 (MQ=255) aaTCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGgaga > 2:390094/1‑150 (MQ=255) aTCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGaa < 1:1746713/150‑1 (MQ=255) aTCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGaa < 1:845400/150‑1 (MQ=255) tCCTACCTGTAACATCAATGGCATATGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAATGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATTGAGAat < 2:4048905/150‑1 (MQ=255) tCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAat < 2:620584/150‑1 (MQ=255) tttcTGTAACTTCAATGGGATAAGGAAGTGTACAGTGCCGGTCCCCAGAAGTGTTGCAATATTGCATACGAGACAGTTCGAGATTTTGCTGGTTTTAAATTAATTTAATTATAGTAATGGTTTTTGAGTGCGTCGTGCATGGAGAAtata < 2:2503858/147‑1 (MQ=255) cTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATagag < 1:2424240/150‑1 (MQ=255) cTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATagag > 1:2789313/1‑150 (MQ=255) tGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAgaga > 1:3879921/1‑150 (MQ=255) tAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAg < 2:3915871/150‑1 (MQ=255) aCATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCa > 1:3178412/1‑150 (MQ=255) aCATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCa > 1:4048169/1‑150 (MQ=255) aTCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGt > 2:3277184/1‑150 (MQ=255) aTCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGt < 2:3189707/150‑1 (MQ=255) tCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTa > 2:2681122/1‑150 (MQ=255) tCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTa > 1:4512543/1‑150 (MQ=255) cAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTaa < 2:3646372/150‑1 (MQ=255) cAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTaa < 2:78060/150‑1 (MQ=255) aaTGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAAc < 1:2373748/150‑1 (MQ=255) aTGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAAcc > 2:179127/1‑150 (MQ=255) aTGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAAcc < 2:2241568/150‑1 (MQ=255) aTGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAAcc > 2:179151/1‑150 (MQ=255) tGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAAccc < 1:2193643/150‑1 (MQ=255) ggCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCg < 1:3317176/150‑1 (MQ=255) ggCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCg < 1:2681315/150‑1 (MQ=255) gCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGa > 2:309278/1‑150 (MQ=255) cATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGAt > 1:1929591/1‑150 (MQ=255) aTAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATg > 1:2536132/1‑150 (MQ=255) tAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGc < 1:3767512/150‑1 (MQ=255) aaGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCt < 2:3368808/150‑1 (MQ=255) gAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGt > 2:4114261/1‑150 (MQ=255) cGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGAc < 2:730324/150‑1 (MQ=255) cGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGAc < 2:1121816/150‑1 (MQ=255) acacAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAAtt > 1:455741/1‑150 (MQ=255) acacAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAAtt > 1:231160/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCg > 1:1891616/1‑150 (MQ=255) cGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCa < 1:4104774/150‑1 (MQ=255) cGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCa > 2:2024087/1‑150 (MQ=255) ggTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCaa > 2:382797/1‑150 (MQ=255) tCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAgg > 1:4462799/1‑150 (MQ=255) tCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAgg > 2:4416903/1‑150 (MQ=255) ccccAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGc < 1:2774710/150‑1 (MQ=255) ccAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCaa > 1:4413588/1‑150 (MQ=255) aGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATc > 1:1697359/1‑150 (MQ=255) aCGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCa < 1:1728656/150‑1 (MQ=255) gggTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGc < 1:1072290/150‑1 (MQ=255) ttGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTgg < 1:2116032/150‑1 (MQ=255) atatTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACa < 1:162539/150‑1 (MQ=255) atatTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACa < 1:3824627/150‑1 (MQ=255) tatTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACaa > 1:1229712/1‑150 (MQ=255) atTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAAt > 1:4008046/1‑150 (MQ=255) tGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCt > 2:1189091/1‑150 (MQ=255) ccTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGACGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCttt < 1:78513/150‑1 (MQ=255) ccTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCttt < 1:78607/150‑1 (MQ=255) aCGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATTAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTcc < 2:3203691/150‑1 (MQ=255) aCGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTcc > 1:959805/1‑150 (MQ=255) cGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTccc > 1:3543287/1‑150 (MQ=255) ccGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTAACGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAAt < 1:289123/150‑1 (MQ=255) ccGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATACAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAAt > 1:3886410/1‑150 (MQ=255) cGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCATCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATa > 1:1338986/1‑150 (MQ=255) cGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATa > 2:3731537/1‑150 (MQ=255) cGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATa > 2:1960117/1‑150 (MQ=255) gATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCACTCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAg > 1:3497364/1‑150 (MQ=255) aTCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGc > 2:4593586/1‑150 (MQ=255) tCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGct < 2:4524299/150‑1 (MQ=255) cGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGctc > 2:4018802/1‑150 (MQ=255) gagaAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGctct < 2:2789118/150‑1 (MQ=255) agaAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTa > 2:2343352/1‑150 (MQ=255) gaAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTAt > 2:4232197/1‑150 (MQ=255) aaaGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTAtt < 1:3680754/150‑1 (MQ=255) aaGTGCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTc > 2:3781097/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTTTAAATAAATTTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCt < 1:313153/150‑1 (MQ=255) gTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTgag > 2:1047363/1‑150 (MQ=255) ttAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTgagaag > 1:475855/1‑150 (MQ=255) aaataaatCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTgagaagag > 2:2088424/1‑150 (MQ=255) atCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAACAAg > 1:2611180/1‑150 (MQ=255) tCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAACAAgg > 2:4267844/1‑150 (MQ=255) cTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAACAAGGc > 2:1601792/1‑150 (MQ=255) | GTGCCATCATACAGCCAGCAATAAACGCCTGATAACCAAATCCTACCTGTAACATCAATGGCATAAGGAACGGTACACAGCCGGTCCCCAGACGGGTTGCAATATTGCCTACGATACCGATCGAGAAAGTGCGGGTTTTAAATAAATCTAATGAAATTAATGGGTTTGGCGTGCGTCGTGCATGGAGAATATAGAGAAGCAGTAACCCGATGCTGGTGACAATTACCGTCAAGGCAATCCAGCTGGCGACAATCTTTTCCCCGAATAGCTCTATTCCGCTTGAGAAGAGAACAAGGC > CP009273/3933057‑3933353 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |