| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 3,996,070 | G→T | 14.7% | F30L (TTC→TTA) | yigF ← | putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 3,996,070 | 0 | G | T | 14.7% | 936.3 / 91.1 | 283 | F30L (TTC→TTA) | yigF | putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (132/109); new base T (26/16); total (158/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.06e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
AATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTAGCATACTGAAAG > CP009273/3995921‑3996219 | aaTAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAg < 2:880698/150‑1 (MQ=255) aTAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGa > 2:3979170/1‑150 (MQ=255) gAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATc < 1:1764945/150‑1 (MQ=255) gAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATc < 1:171106/150‑1 (MQ=255) aaCTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATcc < 2:4304934/150‑1 (MQ=255) aCTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCa > 1:4190674/1‑150 (MQ=255) cTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAg > 2:2666110/1‑150 (MQ=255) cTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAg > 2:1975057/1‑150 (MQ=255) tataATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAgg < 2:3162842/150‑1 (MQ=255) aaTTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGaaa > 1:968227/1‑150 (MQ=255) aaTTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGaaa > 2:525829/1‑150 (MQ=255) aTTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGaaaa > 1:2369605/1‑150 (MQ=255) tGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAAcc < 1:349818/150‑1 (MQ=255) tGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGaaaaac < 1:4478077/150‑3 (MQ=255) gCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCa > 1:3957480/1‑150 (MQ=255) cTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCAt > 2:234540/1‑150 (MQ=255) tttttCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGt > 1:3723775/1‑150 (MQ=255) ttttCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGtt < 1:3810995/150‑1 (MQ=255) tttCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTg > 2:1166871/1‑150 (MQ=255) ttCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGa < 2:3761909/150‑1 (MQ=255) cATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCa > 1:1244472/1‑150 (MQ=255) aTAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCAt > 1:1323555/1‑150 (MQ=255) aaCCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATaa > 2:3255763/1‑150 (MQ=255) aaCCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATaa < 2:118498/150‑1 (MQ=255) ccccAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATaaaa < 1:3190615/150‑1 (MQ=255) aGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTCAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTa > 1:1579255/1‑150 (MQ=255) aCAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAAt < 2:1760340/150‑1 (MQ=255) cAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTCTATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATc < 1:1970332/150‑1 (MQ=255) cAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATc > 2:4129326/1‑150 (MQ=255) aaataaatATATCCAGGAAAAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGTAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCg < 1:4154442/150‑1 (MQ=255) aataaataTATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCgg > 1:3623356/1‑150 (MQ=255) taaataTATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTa > 2:3550123/1‑150 (MQ=255) aaataTATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTAt < 1:2194838/150‑1 (MQ=255) atatCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTcc > 1:2827559/1‑150 (MQ=255) atCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCAt < 1:596787/150‑1 (MQ=255) aGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCAttttt > 2:1506601/1‑150 (MQ=255) aaCAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCAc > 2:323848/1‑150 (MQ=255) aaCAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCAc < 2:802172/150‑1 (MQ=255) aCAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACt > 1:1652305/1‑150 (MQ=255) aCAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACt < 1:2041650/150‑1 (MQ=255) cAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACtt < 2:2786370/150‑1 (MQ=255) gaaAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGa > 1:731342/1‑150 (MQ=255) aaaGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGaa < 2:2806793/150‑1 (MQ=255) aGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAAcc < 1:1004512/150‑1 (MQ=255) gCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAGTCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCa > 2:2925928/1‑150 (MQ=255) aaTGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATc < 1:2479821/150‑1 (MQ=255) aTGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCg > 1:542688/1‑150 (MQ=255) aTGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCg > 2:700034/1‑150 (MQ=255) tGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGt < 2:3666269/150‑1 (MQ=255) aaaTTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTc > 2:3184875/1‑150 (MQ=255) aaaTTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTc > 1:2762282/1‑150 (MQ=255) aaTTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCAATTAATGAACCATAGTTCa > 2:4465634/1‑150 (MQ=255) aTTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCat < 2:4295030/150‑1 (MQ=255) tCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCatat < 1:229587/150‑1 (MQ=255) tttGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATAtt > 1:2405284/1‑150 (MQ=255) tttGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATAtt > 1:3141902/1‑150 (MQ=255) tttGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATAtt > 1:3142051/1‑150 (MQ=255) ttGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTc > 2:2543738/1‑150 (MQ=255) ttGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTc > 1:1135522/1‑150 (MQ=255) tAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCAt < 1:2101484/150‑1 (MQ=255) tAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCAt > 2:3417785/1‑150 (MQ=255) cGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAAt < 2:4514466/150‑1 (MQ=255) gTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTc > 2:3062638/1‑150 (MQ=255) tCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTcc < 2:2023169/150‑1 (MQ=255) ttACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCAt > 1:2154141/1‑150 (MQ=255) cTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAAc < 2:2028635/150‑1 (MQ=255) ttttAATTCTTTAAATGATGCTTTATATTCTGGTGTTGCGCCACAGAATACATGTTAACCATGTTGATGATAAATTTTTAATTTGTATTTCGATTTTTAACTTATTGATCGATCGTTCATTTATTCCTTACTCTTAATTTATCAATAACt < 2:3825050/150‑1 (MQ=255) tAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTAtt > 2:3435543/1‑150 (MQ=255) aaTGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTg < 2:1806710/150‑1 (MQ=255) tGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGtt < 1:2115055/150‑1 (MQ=255) gCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGttt < 2:2113058/150‑1 (MQ=255) gCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGttt < 2:1456949/150‑1 (MQ=255) gCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGttt > 1:3811263/1‑150 (MQ=255) tAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTtgat > 1:854568/1‑150 (MQ=255) tAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTtgat < 1:2468205/150‑1 (MQ=255) aaaTGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTtgatg > 1:4619151/1‑150 (MQ=255) aaaTGCTGATTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATAGATTCCTAACTCATAAATAATCCATAACTATTGTTTttatg > 1:4352305/1‑150 (MQ=255) tgctgcTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAAt < 1:2260807/150‑1 (MQ=255) tgctgcTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAAt < 1:2570777/150‑1 (MQ=255) ctgctTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCa < 1:898505/150‑1 (MQ=255) ctgctTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCa < 1:165629/150‑1 (MQ=255) ctTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTa > 2:3910084/1‑150 (MQ=255) tttATATTCTGGTGTTGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAg > 1:1033730/1‑150 (MQ=255) tttATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAg < 2:3191165/150‑1 (MQ=255) tataTTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGt > 2:2734093/1‑150 (MQ=255) tataTTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGt < 1:2681380/150‑1 (MQ=255) tataTTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGt > 2:3764041/1‑150 (MQ=255) atatTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTg > 1:3074990/1‑150 (MQ=255) tatTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGc > 2:2647327/1‑150 (MQ=255) atTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCa > 2:2618391/1‑150 (MQ=255) tGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCa < 1:1506601/150‑1 (MQ=255) tgtTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTa < 2:2373799/150‑1 (MQ=255) tgtTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTa > 2:1675538/1‑150 (MQ=255) ttGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTAGc > 2:3364495/1‑150 (MQ=255) tGCCCCCCATAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTAGCa > 2:1104178/1‑150 (MQ=255) cccccAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTAGCATAc > 2:2267662/1‑150 (MQ=255) cccccAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTAGCATAc > 2:629690/1‑150 (MQ=255) cAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTAGCATACTGaa > 1:770850/1‑150 (MQ=255) gAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTAGCATACTGAAAg > 1:46435/1‑150 (MQ=255) gAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTAGCATACTGAAAg > 1:3357744/1‑150 (MQ=255) | AATAGAACTATAATTGCTTTTTTCCATAACCCCAGGACAAATAAATATATCCAGGAACAGAAGAAAGCAATGAAATTCATTTGAATAGTTAAGCGTTGTCTTACTTTTAATGCTTTAAATGCTGCTTTATATTCTGGTGTTGCCCCCCAGAATCCAGGAAAACCATGTTGATCATAAAAATTAAATCGGTATTTCCATTTTTCACTTAATGAACCATCGTTCATATATTCCTTACTCATAAATACTCCATAACTATTGTTTTGATGAATCAGTAGGTGCAAGCATTAGCATACTGAAAG > CP009273/3995921‑3996219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |