Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 380,236 | C→A | 55.7% | intergenic (‑164/‑452) | yaiS ← / → tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine transporter subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 380,236 | 0 | C | A | 55.7% | 0.6 / inf | 269 | intergenic (‑164/‑452) | yaiS/tauA | putative PIG‑L family deacetylase/taurine transporter subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (65/54); new base A (74/76); total (139/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
TTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGT > CP009273/380088‑380383 | tatttattATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAAt > 1:2649291/1‑150 (MQ=255) atttattATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAAtt < 2:4367226/150‑1 (MQ=255) atttattATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAAtt > 2:429614/1‑150 (MQ=255) atttattATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAAtt < 1:2774216/150‑1 (MQ=255) tttattATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTc < 1:66730/150‑1 (MQ=255) attatACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCata > 2:3988823/1‑150 (MQ=255) antatACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCata > 2:2336816/1‑150 (MQ=255) tataCTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATg > 2:542612/1‑150 (MQ=255) tataCTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATg < 2:1460127/150‑1 (MQ=255) tataCTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATg < 1:2586955/150‑1 (MQ=255) ataCTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGt < 2:2578951/150‑1 (MQ=255) tactacAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGtt > 1:3679164/1‑150 (MQ=255) cAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAgtg < 2:3260867/150‑1 (MQ=255) gCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGttt < 1:2142362/150‑1 (MQ=255) cacaACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTg > 2:3446663/1‑150 (MQ=255) aaCGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTAt < 2:3228200/150‑1 (MQ=255) aaCGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTAt < 2:2685601/150‑1 (MQ=255) aaCGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTAt < 1:1338227/150‑1 (MQ=255) aCGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATg > 1:3493190/1‑150 (MQ=255) gATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGtt > 2:764459/1‑150 (MQ=255) aTGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGttt < 1:3139583/150‑1 (MQ=255) gCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTgg < 2:1286240/150‑1 (MQ=255) cTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTTgtat < 2:30437/150‑1 (MQ=255) cAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatgt < 1:3757700/150‑1 (MQ=255) agagACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatgta > 2:4276076/1‑150 (MQ=255) agagACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGgtatgta < 2:4088978/150‑1 (MQ=255) agaCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGtata > 1:4134599/1‑150 (MQ=255) gaCGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAg < 2:4097655/150‑1 (MQ=255) cGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGCCTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGtt < 1:1984298/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGtttt > 2:3301183/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGtttt > 1:4547717/1‑150 (MQ=255) cgcAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTtat < 2:3250320/150‑1 (MQ=255) cgcAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTtat < 1:73475/150‑1 (MQ=255) aGCCAGATGTAAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGAAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGATTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACa > 2:3206960/1‑150 (MQ=255) ccAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACAtt < 1:1140275/150‑1 (MQ=255) cAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTg > 2:716574/1‑150 (MQ=255) cAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTg < 1:3614110/150‑1 (MQ=255) cAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTg < 1:561491/150‑1 (MQ=255) aGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGt > 2:1311635/1‑150 (MQ=255) tGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTAtt < 1:1878692/150‑1 (MQ=255) gTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTAttt > 1:1068159/1‑150 (MQ=255) gTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTAttt < 1:1419932/150‑1 (MQ=255) gTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTAttt < 1:1200782/150‑1 (MQ=255) aTTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGAt < 1:1932633/150‑1 (MQ=255) ataAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGa < 1:4487297/150‑1 (MQ=255) aaatgttaaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGAtt > 2:311401/1‑150 (MQ=255) aatgttaaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGAttt < 2:3638277/150‑1 (MQ=255) atgttaaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTa < 1:2307895/150‑1 (MQ=255) taaatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGttt > 1:3259063/1‑150 (MQ=255) aatgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGt > 1:4153132/1‑150 (MQ=255) atgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTc > 2:1684730/1‑150 (MQ=255) atgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGGTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTc > 2:2369658/1‑150 (MQ=255) tgttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCa < 1:894682/150‑1 (MQ=255) gttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaa < 2:2959826/150‑1 (MQ=255) ttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaat < 1:63684/150‑1 (MQ=255) ttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaat > 2:2058966/1‑150 (MQ=255) ttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaat < 1:4625953/150‑1 (MQ=255) ttGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaat > 2:2528165/1‑150 (MQ=255) tGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaatt < 2:1622369/150‑1 (MQ=255) tGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaatt > 2:660639/1‑150 (MQ=255) gCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaatta > 1:3523929/1‑150 (MQ=255) gCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTGTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaatta > 1:3215178/1‑150 (MQ=255) aataaCTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaattaatt > 2:3925115/1‑150 (MQ=255) aataaCTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCaattaatt < 1:387617/150‑1 (MQ=255) ataaCTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTg > 2:3524647/1‑150 (MQ=255) ataaCTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTg < 2:3773068/150‑1 (MQ=255) aCTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCAt < 2:4615990/150‑1 (MQ=255) cTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCAtt < 2:1810726/150‑1 (MQ=255) gAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTa > 2:1936783/1‑150 (MQ=255) aaaGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaa < 2:3518629/150‑1 (MQ=255) aGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaaaa > 2:2437157/1‑150 (MQ=255) aGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaaaa > 1:1247995/1‑150 (MQ=255) aGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaaaa > 2:4184967/1‑150 (MQ=255) gCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTaaaaaa > 1:1459225/1‑150 (MQ=255) aaGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAata > 1:4364925/1‑150 (MQ=255) gggCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATg < 1:3521714/150‑1 (MQ=255) tttCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCt < 1:2465768/150‑1 (MQ=255) tttCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCt < 1:3380104/150‑1 (MQ=255) tCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCtgt > 2:477256/1‑150 (MQ=255) tCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCtgt > 2:2897126/1‑150 (MQ=255) tCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCtgt < 2:1782551/150‑1 (MQ=255) aGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGa > 2:1096422/1‑150 (MQ=255) gACCCGCGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGaa > 2:4465949/1‑150 (MQ=255) cGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAg < 1:1657437/150‑1 (MQ=255) gTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACaatc > 2:3417585/1‑148 (MQ=255) tGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCa < 2:1420660/150‑1 (MQ=255) tGGGTTCGACTGGGTAATGTTTATATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCa < 2:4202592/150‑1 (MQ=255) ggTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCAtt < 1:2232595/150‑1 (MQ=255) gTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTg > 2:1632622/1‑150 (MQ=255) gTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTg > 2:848156/1‑150 (MQ=255) cTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTtata > 2:2184969/1‑150 (MQ=255) cTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTtata > 1:516123/1‑150 (MQ=255) tGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTtatat < 1:598558/150‑1 (MQ=255) aaTGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACAtt < 1:1723805/150‑1 (MQ=255) aaTGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACAtt < 1:3973498/150‑1 (MQ=255) aTGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTa > 1:1261886/1‑150 (MQ=255) aTGTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTa > 1:2858036/1‑150 (MQ=255) gTTTCTATGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTAtg > 1:3079537/1‑150 (MQ=255) tATGAAATTCATATGTTAAGTGGTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATATAGAGGTTATTTATTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTATATATACATAATGTGAAt > 1:4068993/1‑150 (MQ=255) aTGAAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATg > 1:1380003/1‑150 (MQ=255) | TTTATTTATTATACTACAAGCACAACGATGCACTCAGAGACGTAATCTCTGGCGCAGCCAGATGTTAATTTATAAATGTTAAATGTTGCTAATAACTGAAAAGCAAGGGCTTTCAGACCCGTGGGTTCGACTGGGTAATGTTTCTATGCAATTCATATGTTAAGTGTTTGTATGTTTGGTATGTATAGTTATTTTGTTTTATACATTGTATTTAGATGTGATTTAGTTTGTCAATTAATTGCATTTAAAAAATATGTTCTGTGAACAAGCATTGTTTATATACATTATGTGAATGT > CP009273/380088‑380383 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |