Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 4,333,400 | G→T | 18.5% | R72L (CGA→CTA) | melB → | melibiose:sodium symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 4,333,400 | 0 | G | T | 18.5% | 752.6 / 109.7 | 254 | R72L (CGA→CTA) | melB | melibiose:sodium symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (85/122); new base T (18/29); total (103/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.38e-01 |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
CGGCATTGTGTATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCA > CP009273/4333251‑4333549 | cGGCATTGTGTATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTAcgcgatcgcg < 2:1315965/150‑1 (MQ=255) ggCATTGTGTATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTAcgcgatcgcga > 2:327169/1‑150 (MQ=255) aTTGTGTATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATgg < 2:1925712/150‑1 (MQ=255) ttGTGTATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATggg < 2:4066247/150‑1 (MQ=255) tgtgTATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACTCGATCGCGATgggg > 1:902950/1‑150 (MQ=255) tgtATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTa < 1:1661943/150‑1 (MQ=255) tgtATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTa > 2:23847/1‑150 (MQ=255) tgtATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTa < 1:3074147/150‑1 (MQ=255) gtATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTaa < 2:397977/150‑1 (MQ=255) gtATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTaa < 2:1412854/150‑1 (MQ=255) gTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCTAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCaa > 1:1749123/1‑150 (MQ=255) gTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTACATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCaa > 2:3162508/1‑150 (MQ=255) tACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCaaa > 1:1291820/1‑150 (MQ=255) aCCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAAc < 2:1209385/150‑1 (MQ=255) ccTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAAcc > 1:1941756/1‑150 (MQ=255) cTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAAccc < 2:3064686/150‑1 (MQ=255) cTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAAccc > 1:1772927/1‑150 (MQ=255) gTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGAt > 2:3131228/1‑150 (MQ=255) gTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGAt > 1:2394594/1‑150 (MQ=255) ttACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCt < 2:2636665/150‑1 (MQ=255) tactacACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTg > 2:637007/1‑150 (MQ=255) ctacACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGAt < 1:4421560/150‑1 (MQ=255) tacACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATc > 1:2959488/1‑150 (MQ=255) acCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGt < 1:2166150/150‑1 (MQ=255) ccGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTa < 1:2246030/150‑1 (MQ=255) ccGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATAATGGGAAGGATTGTAAATGCTACGCGATCTCGATGGGGTAAGTACAAACCCTGGATCCTGATCGGtc > 2:517951/1‑149 (MQ=255) cGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTAc > 1:676596/1‑150 (MQ=255) cGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTAc < 1:1993233/150‑1 (MQ=255) gATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACg > 2:3807909/1‑150 (MQ=255) gATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACg < 2:156963/150‑1 (MQ=255) tGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGtt < 2:4225928/150‑1 (MQ=255) gtcgtcGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTg > 2:2117583/1‑150 (MQ=255) gtcgtcGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTg < 1:1005592/150‑1 (MQ=255) gggCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAAc > 2:3510208/1‑150 (MQ=255) ctgtctgtGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAActct < 1:4539602/150‑1 (MQ=255) tctgtGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTa < 2:4386827/150‑1 (MQ=255) gtgGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATc > 1:4153758/1‑150 (MQ=255) tgGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCt > 2:3991714/1‑150 (MQ=255) tgGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACTTTGGCAAACTCTGTaagat > 2:2212278/1‑147 (MQ=255) gggTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCtt < 2:2911170/150‑1 (MQ=255) ggTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTa < 2:2791427/150‑1 (MQ=255) tttGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTAtt < 1:1038978/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTtc < 1:2060258/150‑1 (MQ=255) ggTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTctcctc > 2:1071199/1‑150 (MQ=255) ggTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTctcctc < 1:3048953/150‑1 (MQ=255) ggTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTctcctc < 1:4082822/150‑1 (MQ=255) gTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCctct < 1:2277935/150‑1 (MQ=255) tACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCtt < 2:1107624/150‑1 (MQ=255) cTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTa > 1:1842502/1‑150 (MQ=255) ttGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGt > 2:4564602/1‑150 (MQ=255) gTTTCTGGTGGCGTTGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGAGCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTgc < 2:1709287/150‑1 (MQ=255) ttCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTgcgc < 2:1758485/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCAt < 2:4484818/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCAt > 2:3600821/1‑150 (MQ=255) tggtggCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATc > 1:1092069/1‑150 (MQ=255) gtggCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTg < 2:2666124/150‑1 (MQ=255) gtggCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTg < 2:1457811/150‑1 (MQ=255) gCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGttt < 2:2560706/150‑1 (MQ=255) gCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGttt > 2:1195072/1‑150 (MQ=255) cGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTg < 2:3022811/150‑1 (MQ=255) gAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGa > 2:3690567/1‑150 (MQ=255) tGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCACACGCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGtact > 1:961961/1‑150 (MQ=255) tGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGtact > 2:659824/1‑150 (MQ=255) tGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGtact < 1:235207/150‑1 (MQ=255) gggATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGtacta > 1:2395185/1‑150 (MQ=255) gATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTactact < 2:2068236/150‑1 (MQ=255) aTGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTc > 1:3901397/1‑150 (MQ=255) tGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCa < 1:2194943/150‑1 (MQ=255) gCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAg > 1:2550738/1‑150 (MQ=255) cTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGa < 1:484410/150‑1 (MQ=255) cTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGa < 1:2594342/150‑1 (MQ=255) tATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGAt > 2:1794387/1‑150 (MQ=255) aaCGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTc < 2:902950/150‑1 (MQ=255) aCGATCCGATTTTGGGTTGGATTGTAAATGCTACGGGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAAACCTGTATCCTGATCGGTTCGTTGGCAAACTCTGTAATCTTTTTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGTAGGTACTACTCAGATTGTCt < 1:2782937/150‑1 (MQ=255) gATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACTCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCttt > 1:2814894/1‑150 (MQ=255) aTCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCtttg > 2:2661709/1‑150 (MQ=255) aTCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCtttg > 1:2853914/1‑150 (MQ=255) ccGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCtttgtt < 1:39887/150‑1 (MQ=255) cGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCtttgttt > 1:1192798/1‑150 (MQ=255) gATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCtttgtttg > 2:4186126/1‑150 (MQ=255) gATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCTATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCtttgtttg > 1:3753764/1‑150 (MQ=255) ttATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCg < 1:3937150/150‑1 (MQ=255) ttATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCg < 2:1035191/150‑1 (MQ=255) ttGGGTTGGATTGTTAATGATTCGCGTTCGCGCTGGGGTTAGTTCAACACCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTATGTAATCTTTTTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTg < 1:2274617/149‑1 (MQ=255) gggATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGAc > 2:2827165/1‑150 (MQ=255) ggatggatTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGAcc < 2:3440354/150‑1 (MQ=255) gatggatTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCt < 1:92262/150‑1 (MQ=255) atggatTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTa > 2:1128713/1‑150 (MQ=255) atggatTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTa < 1:430847/150‑1 (MQ=255) tggatTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCGGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTAc < 1:774527/150‑1 (MQ=255) aaTGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTgg > 1:3483198/1‑150 (MQ=255) aaTGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTgg > 2:74798/1‑150 (MQ=255) tGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTgggg < 2:2947519/150‑1 (MQ=255) tACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCAt < 1:4029101/150‑1 (MQ=255) cgcgatcgcgatGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATAGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGa < 1:3363594/150‑1 (MQ=255) cgatcgcgatGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACt > 1:1597414/1‑150 (MQ=255) cgatcgcgatGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACt > 2:93723/1‑150 (MQ=255) gatcgcgatGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAATCTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACtt > 1:3942802/1‑150 (MQ=255) gatGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCa > 2:3180423/1‑150 (MQ=255) gatGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCa > 1:3192023/1‑150 (MQ=255) | CGGCATTGTGTATATGTACCTCATGTATTACTACACCGATGTCGTCGGGCTGTCTGTGGGTTTGGTCGGTACTTTGTTTCTGGTGGCGAGGATCTGGGATGCTATTAACGATCCGATTATGGGATGGATTGTAAATGCTACGCGATCGCGATGGGGTAAGTTCAAACCCTGGATCCTGATCGGTACGTTGGCAAACTCTGTAATCTTATTTCTCCTCTTTAGTGCGCATCTGTTTGAAGGTACTACTCAGATTGTCTTTGTTTGCGTGACCTACATCCTCTGGGGCATGACTTACACCA > CP009273/4333251‑4333549 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |