Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 4,336,681 | 0 | A | T | 7.1% | 909.1 / 47.1 | 281 | Y155N (TAC→AAC) | fumB | anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (151/110); new base T (10/10); total (161/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 |
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
AGTCAGCAGGGCTTTGGTTTCCTGGTAGAGATACGTTTTGTTGGCAGAGCCGCCGCCTTTCGCAACGCAAAGGAATTTGTACTCATCGCCATCTACCGCGTACAGGTCGATTTGCGCAGGCAGGTTAGTGCCGGTGTTGACCTCTTTGTACATGTCCAGCGCCGCATTCTGTGAATAGCGCAGGTTATCTTCGATATAGGTGTTATAGACGCCTTTCGACAGCGTTTCTTCATCACCGCCGCCGGTCCACACGCGCTGGCCTTTTTTACCGACGATGATCGCGGTGCCGGTATCCTGGC > CP009273/4336532‑4336830 | gTCAGCAGGGCTTTGGTTTCCTGGTAGAGATACGTTTTGTTGGCAGAGCCGCCGCCTTTCGCAACGCAAAGGAATTTGTACTCATCGCCATCTACCGCGTACAGGTCGATTTGCGCAGGCAGGTTAGTGCCGGTGTTGACCTCTTTGTAc > 2:3992002/1‑150 (MQ=255) tCAGCAGGGCTTTGGTTTCCTGGTAGAGATACGTTTTGTTGGCAGAGCCGCCGCCTTTCGCAACGCAAAGGAATTTGTACTCATCGCCATCTACCGCGTACAGGTCGATTTGCGCAGGCAGGTTAGTGCCGGTGTTGACCTCTTTGTACa < 1:3280448/150‑1 (MQ=255) agcagGGCTTTGGTTTCCTGGTAGAGATACGTTTTGTTGGCAGAGCCGCCGCCTTTCGCAACGCAAAGGAATTTGTACTCATCGCCATCTACCGCGTACAGGTCGATTTGCGCAGGCAGGTTAGTGCCGGTGTTGACCTCTTTGTACATg < 2:1278159/150‑1 (MQ=255) 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ccGGTGTTGACCTCTTTGTACATGTCCAGCGCCGCATTCTGTGAATAGCGCAGGTTATCTTCGATATAGGTGTTATAGACGCCTTTCGACAGCGTTTCTTCATCACCGCCGCCGGTCCACACGCGCTGGCCTTTTTTACCGACGATGATc > 1:3012883/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTTGACCTCTTTGTACATGTCCAGCGCCGCATTCTGTGAATAGCGCAGGTTATCTTCGATATAGGTGTTATAGACGCCTTTCGACAGCGTTTCTTCATCACCGCCGCCGGTCCACACGCGCTGGCCTTTTTTACCGACGATGATc < 1:607549/150‑1 (MQ=255) tgtTGACCTCTTTGTACATGTCCAGCGCCGCATTCTGTGAATAGCGCAGGTTATCTTCGATATAGGTGTTATAGACGCCTTTCGACAGCGTTTCTTCATCACCGCCGCCGGTCCACACGCGCTGGCCTTTTTTACCGACGATGATCGCgg > 1:3275100/1‑150 (MQ=255) ttGACCTCTTTGTACATGTACAGCGACGAATTATGTGTATAGCGCAGGTTATCTTCGATTTAGGTGTTATAGTCGCCTTTCGACTGCGTTTCTTCATCACCGCCGCCGGTCAACACGCGCTGGCCTTTTTTCCCGTCGTTGTTCGCGGTg < 1:2682200/150‑1 (MQ=255) gACCTCTTTGTACATGTCCAGCGCCGCATTCTGTGAATAGCGCAGGTTATCTTCGATATAGGTGTTATAGACGCCTTTCGACAGCGTTTCTTCATCACCGCCGCCGGTCCACACGCGCTGGCCTTTTTTACCGACGATGATCGCGGTGcc < 2:2535432/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |