| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP009273 | 4,481,249 | A→T | 7.7% | V365E (GTG→GAG) | idnT ← | L‑idonate and D‑gluconate transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 4,481,249 | 0 | A | T | 7.7% | 778.8 / 41.0 | 243 | V365E (GTG→GAG) | idnT | L‑idonate and D‑gluconate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (123/101); new base T (9/10); total (132/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
TACGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACACCCGCGGTGGTAATGGCCGCGACGGTGGCAGAGCCCAGAGCGATACGCAACAGCGCCGCAACAGTCCAGCACATCAATAACGGCGAAAGTGTAGTTCCGGTCATTAAGTGTGAAATATAGTGCCCGACACCGCTATCTACTAAT > CP009273/4481100‑4481398 | cGCAACGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAacacc < 1:1631521/150‑1 (MQ=255) aaCGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAacaccaca < 1:4607030/150‑1 (MQ=255) cGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAACTAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAacaccacacc < 1:4181216/150‑1 (MQ=255) cGTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCAGCCCGCAACGGTTGCCAGAACCAATAAAGCGGGATAGGCATGGGTAACGTTGATAAACGGCAacaccacaca > 1:2577634/1‑149 (MQ=255) gTTTCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACAccc < 2:4507521/150‑1 (MQ=255) ttCACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACACCcgc > 1:1824965/1‑150 (MQ=255) cACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCCCCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGCTCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACACCCCCgg > 1:817136/1‑150 (MQ=255) cACCAACCGTCAGATTAAAATACCCTTTAAATAGCCAGAAGCCAGGGTCGTTTACGTGTGACGCGATCACGCTGCCCGCACCGGTTGCCAGTACCATTAAAGCGGGATCGGCATGGGTAACGTTGATAATCGGCAACACCACACCCGCgg > 2:2296595/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |