| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP009273 | 4,522,074 | 0 | T | A | 17.3% | 839.0 / 159.5 | 313 | pseudogene (54/261 nt) | yjhY | pseudogene, zinc finger protein family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (108/151); new base A (25/29); total (133/180) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.48e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 319 total aligned reads displayed.
TTTGCACGCTTATGTGCTTCCTCCGGGCCGACTTTTTGCCAGGAATCAAGGAAGCTGGCTAAACCTGATACCGCTTCTTCCCAGGGTTTGAGATTGCCGTTGCTGTCGCTGCATTACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGCCGACATCGGCATTCCGCAAGCCTGACAGAACTGTTCATGTTGTGACATATGATGCTCCTTATGGTGACATCTTGATTAATAAACATACTGAATATGTATTGTGCAGGTGATACATCAGATCAAAGCAAAGGTAAAGCCTCGATA > CP009273/4521925‑4522223 | tttGCACGCTTATGTGCTTCCTCCGGGCCGACTTTTTGCCAGGAATCAAGGAAGCTGGCTAAACCTGATACCGCTTCTTCCCAGGGTTTGAGATTGCCGTTGCTGTCGCTGCATTACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCt < 2:596899/150‑1 (MQ=255) cACGCTTATGTGCTTCCTCCGGGCCGACTTTTTGCCAGGAATCAAGGAAGCTGGCTAAACCTGATACCGCTTCTTCCCAGGGTTTGAGATTGCCGTTGCTGTCGCTGCATTACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTg > 1:2654141/1‑150 (MQ=255) tcgattATGTGCTTCCTCCGGGCCGACTTTTTGCCAGGAATCAAGGAAGCTGGCTAAACCTGAGACCGCTTCTTCCCAGGGTTTGAGATTGCCGTTGCTGTCGCTGCATTACGCACAATATTGATCACTGGCACTGTGTGCATCTGGTGc < 2:1988542/146‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |