Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 4,584,381 | G→T | 94.3% | I53I (ATC→ATA) | yjjL ← | L‑galactonate transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 4,584,381 | 0 | G | T | 94.3% | 747.0 / 36.1 | 246 | I53I (ATC→ATA) | yjjL | L‑galactonate transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (9/5); new base T (112/119); total (122/124) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.20e-01 |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
CGATCCAATAGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTGATTACCGCCGCAAAAAATAATAACAACATGGCGGTGGTTTGAATGCGTTTAATTCGGGTACTGCGTTGAACTAATCCATCTGGTGGCACGGGAATATCTGCCGACGAAGATGGAGTAAATGAAGAACGCGGATCGATGGTGATAT > CP009273/4584232‑4584526 | cGATCCAATAGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGACTCGTTAAATTTGCTACCGACCGCGAACTGCGGTCGAGATAATTg > 2:1826225/1‑150 (MQ=255) ccAATAGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATttatta < 2:2420207/150‑1 (MQ=255) aGTGGGCCGCAAGGAAGTTGCGCAATCCCGTAAGCGAGTGAAAACACGGAGAGCAAAGCGCCGATTTCGGTGGCACTTAATCCCAATTCTTCACGAATCGTTAAATTTGCTACCGACAGCGAACTGCGGTCGAGATAATTTATTAccgcc < 2:2210569/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |