| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 466,184 | G→T | 16.5% | M31I (ATG→ATT) | mdlB → | putative multidrug transporter subunit of ABC superfamily, ATP‑binding component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 466,184 | 0 | G | T | 16.5% | 848.8 / 100.8 | 267 | M31I (ATG→ATT) | mdlB | putative multidrug transporter subunit of ABC superfamily, ATP‑binding component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (101/122); new base T (18/26); total (119/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
TCAACAACTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTGCCGCCGGGCT > CP009273/466036‑466333 | tCAACAACTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCtgatga > 2:3961353/1‑150 (MQ=255) caacaaCTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTgatgat > 1:1872547/1‑150 (MQ=255) caacTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTAtgtg < 1:2929833/150‑1 (MQ=255) aacTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGAGGTgg > 2:3700345/1‑150 (MQ=255) cTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCACCTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGt < 1:3550157/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAATTCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTTTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTg < 2:839630/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTg < 1:2691141/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTg < 2:1413430/150‑1 (MQ=255) gAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTgc < 2:1258513/150‑1 (MQ=255) ggcggcGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTgcgg > 1:4102322/1‑150 (MQ=255) cggcgCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTgcggcg < 1:584716/150‑1 (MQ=255) ggcgCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTgcggcgg > 1:983956/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTgcggcggc < 1:3323982/150‑1 (MQ=255) cgcTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTgcggcggcg > 1:3446894/1‑150 (MQ=255) cTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCggcggcggc < 1:3680588/150‑1 (MQ=255) tCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCa > 1:837281/1‑150 (MQ=255) gacgacGCACCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGATTTAGCCAACAGTGGCAGACTCTCAAGCGCATGTTAGCGTACGTTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGa > 1:820718/1‑150 (MQ=255) cgacgCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAg < 2:1775921/150‑1 (MQ=255) gacgCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGt > 1:2954349/1‑150 (MQ=255) gacgCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGt > 1:1125496/1‑150 (MQ=255) cTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGt > 2:3211995/1‑150 (MQ=255) tcGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTgg > 2:440028/2‑150 (MQ=255) ccGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTgg < 2:4275127/150‑1 (MQ=255) cGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTggg < 1:4584851/150‑1 (MQ=255) aaaaTCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCg < 2:3949888/150‑1 (MQ=255) aaaTCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCgc < 1:3631314/150‑1 (MQ=255) aaTCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCgct < 1:3120817/150‑1 (MQ=255) aTCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCgctg < 2:1877089/150‑1 (MQ=255) gcgAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCtt < 1:3700651/150‑1 (MQ=255) gcgAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCtt > 1:1926979/1‑150 (MQ=255) cgAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTa < 1:2005038/150‑1 (MQ=255) cgAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTa < 2:149117/150‑1 (MQ=255) gaggagGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTAt < 2:4529205/150‑1 (MQ=255) gaggCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAg < 2:3138224/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGATGCTTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTa < 2:2757741/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTa < 2:960843/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTa < 1:3738460/150‑1 (MQ=255) cGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTAtt > 1:1813308/1‑150 (MQ=255) cGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTAtt > 2:413287/1‑150 (MQ=255) gTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTAttt < 2:3014683/150‑1 (MQ=255) gTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTAttt > 2:1993674/1‑150 (MQ=255) tCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTAtttt < 1:651848/150‑1 (MQ=255) gATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTAt < 2:563995/150‑1 (MQ=255) aTGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATc > 1:4415027/1‑150 (MQ=255) aGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAat > 1:1095174/1‑150 (MQ=255) gTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAata > 2:3485231/1‑150 (MQ=255) ttttAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAatat > 2:2954300/1‑150 (MQ=255) ttttAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCGGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTAACAGCTATTTTATCGACAagat > 2:4638600/1‑150 (MQ=255) tttAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATg < 1:1757275/150‑1 (MQ=255) aGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACCATATGGTa > 2:689894/1‑150 (MQ=255) gCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAg < 1:1405978/150‑1 (MQ=255) gCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAg < 1:76365/150‑1 (MQ=255) ccAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGc < 2:848896/150‑1 (MQ=255) cAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCg < 2:2590599/150‑1 (MQ=255) aaCTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGa < 1:2069662/150‑1 (MQ=255) aaCTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGa > 2:2512935/1‑150 (MQ=255) aaCTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGa < 2:398538/150‑1 (MQ=255) aaCTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGa > 1:2241867/1‑150 (MQ=255) 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cGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAAcc > 2:3782671/1‑150 (MQ=255) gACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCt < 1:3383431/150‑1 (MQ=255) gACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCt < 2:2857042/150‑1 (MQ=255) cAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGtt > 1:2844563/1‑150 (MQ=255) cAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGtt < 2:4369791/150‑1 (MQ=255) aaGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTg > 2:4442666/1‑150 (MQ=255) gcCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAg < 2:164692/150‑1 (MQ=255) gcCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGGTGAAAg > 2:175479/1‑150 (MQ=255) ccTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGt > 1:1345885/1‑150 (MQ=255) tGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTgg > 2:3460174/1‑150 (MQ=255) ttAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGtt < 1:101429/150‑1 (MQ=255) tAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTg < 2:2289428/150‑1 (MQ=255) aGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGc < 1:1585811/150‑1 (MQ=255) gTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAgg > 1:3585964/1‑150 (MQ=255) tACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAggg < 2:2292142/150‑1 (MQ=255) caCGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTCTCGACCATATGGTTGCGAAAAATATACTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAggg < 2:1963248/149‑1 (MQ=255) tCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGggctggct < 2:4102322/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTgc < 1:524172/150‑1 (MQ=255) gTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTgcggc > 1:103043/1‑150 (MQ=255) gTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTgcggc > 1:1440642/1‑150 (MQ=255) tGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTgcggcg > 2:802509/1‑150 (MQ=255) gCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTa < 2:2934817/150‑1 (MQ=255) tAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCCGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTGGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGt > 1:1224757/1‑150 (MQ=255) aaCCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTg > 1:3302907/1‑150 (MQ=255) aaCCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTg > 1:3303156/1‑150 (MQ=255) gCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCt > 2:4056883/1‑150 (MQ=255) ggggATTGCGGTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCa > 1:4259938/1‑150 (MQ=255) ggggATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGATATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCa > 2:1106960/1‑150 (MQ=255) ggATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAAc > 1:2505270/1‑150 (MQ=255) gATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACt > 1:90978/1‑150 (MQ=255) ggTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTgc > 2:4304955/1‑150 (MQ=255) ggTCCTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTgc > 2:3173468/1‑150 (MQ=255) ccTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTgccgc > 1:1216089/1‑150 (MQ=255) cTGATTATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTgccgcc > 1:3185772/1‑150 (MQ=255) cTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTgccgcc < 1:422720/150‑1 (MQ=255) cTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTgccgcc < 2:2393994/150‑1 (MQ=255) tgatgaTGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTGccgccg < 1:306875/150‑1 (MQ=255) | TCAACAACTGGAGGCGGCGCTCGACGACGCTCCGGAAAATCGCGAGGAGGCCGTCGATGCGTAGTTTTAGCCAACTGTGGCCGACTCTCAAGCGCCTGTTAGCGTACGGTTCGCCGTGGCGTAAACCGCTGGGGATTGCGGTCCTGATGATGTGGGTTGCGGCGGCGGCAGAAGTCAGTGGGCCGCTGCTTATCAGCTATTTTATCGACAATATGGTAGCGAAAAATAACCTGCCGTTGAAAGTGGTTGCAGGGCTGGCTGCGGCGTATGTTGGGCTGCAACTGTTTGCCGCCGGGCT > CP009273/466036‑466333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |