| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 566,710 | G→T | 17.2% | G121V (GGC→GTC) | ybcL → | inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; secreted protein, UPF0098 family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 566,710 | 0 | G | T | 17.2% | 736.6 / 93.2 | 236 | G121V (GGC→GTC) | ybcL | inactive polymorphonuclear leukocyte migration suppressor; DLP12 prophage; secreted protein, UPF0098 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (87/108); new base T (15/26); total (102/134) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
ATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAA > CP009273/566561‑566859 | tatGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGc < 1:2624710/150‑1 (MQ=255) tGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTa > 1:354374/1‑150 (MQ=255) aTCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATg > 1:2362671/1‑150 (MQ=255) aTCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATg < 1:2089807/150‑1 (MQ=255) aGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTgg < 2:3801219/150‑1 (MQ=255) aTGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGt < 2:1428833/150‑1 (MQ=255) tGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGtt < 2:73681/150‑1 (MQ=255) tGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGtt > 1:2931012/1‑150 (MQ=255) gCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGttt < 2:4335958/150‑1 (MQ=255) gCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGttt < 1:791808/150‑1 (MQ=255) gCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGttt < 2:1369353/150‑1 (MQ=255) gCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGttt < 2:1369323/150‑1 (MQ=255) cACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTtg < 1:706850/150‑1 (MQ=255) cAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGgcg > 1:4505011/1‑150 (MQ=255) aGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGt > 1:2763951/1‑150 (MQ=255) aGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGt > 1:3939930/1‑150 (MQ=255) ttggtGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtcctcc < 1:3721297/150‑1 (MQ=255) ttggtGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGtcctcc > 1:1789707/1‑150 (MQ=255) tggtggCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTcctcct < 1:4588470/150‑1 (MQ=255) gCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAgg < 2:4233959/150‑1 (MQ=255) ggACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATa < 1:4349065/150‑1 (MQ=255) aCTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATaaa > 1:2253053/1‑150 (MQ=255) gttgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACca < 2:3896670/150‑1 (MQ=255) gttgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACca < 2:1179619/150‑1 (MQ=255) gttgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACca < 2:354551/150‑1 (MQ=255) tgttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACcaca > 1:193736/1‑150 (MQ=255) gttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcat < 1:1285003/150‑1 (MQ=255) gttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcat > 2:1251220/1‑150 (MQ=255) ttAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCAGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCAcatc > 2:3509875/1‑150 (MQ=255) atatTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCAtt > 1:3840607/1‑150 (MQ=255) tatTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTa < 1:1526213/150‑1 (MQ=255) tatTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTa < 2:674288/150‑1 (MQ=255) atTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAc > 2:1600657/1‑150 (MQ=255) atTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTAc < 1:1437087/150‑1 (MQ=255) tCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCa > 2:1850779/1‑150 (MQ=255) tCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCa < 1:1188740/150‑1 (MQ=255) ccAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAg < 1:3389584/150‑1 (MQ=255) cAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGt < 2:2993768/150‑1 (MQ=255) gCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGttt > 2:1599817/1‑150 (MQ=255) gCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGttt < 2:3926438/150‑1 (MQ=255) gTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTa > 1:4293261/1‑150 (MQ=255) tAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTAt > 1:2568851/1‑150 (MQ=255) aCATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATgg < 2:312476/150‑1 (MQ=255) aCATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATgg < 1:178776/150‑1 (MQ=255) atatTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGc > 2:3219031/1‑150 (MQ=255) atTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGctc < 2:3364078/150‑1 (MQ=255) atTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGctc > 1:3118348/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTa < 1:1448780/150‑1 (MQ=255) cccGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTaaaa > 1:1880110/1‑150 (MQ=255) cccGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTaaaa > 1:85855/1‑150 (MQ=255) cGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAAc > 2:2355007/1‑150 (MQ=255) tGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGa > 2:2089740/1‑150 (MQ=255) gATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGaa < 1:1554084/150‑1 (MQ=255) gATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGaa > 2:199784/1‑150 (MQ=255) gATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGaa < 1:698182/150‑1 (MQ=255) gATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGaa < 1:3378808/150‑1 (MQ=255) gATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGaa > 2:4613300/1‑150 (MQ=255) aGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAt > 2:505168/1‑150 (MQ=255) aGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAt > 1:2134731/1‑150 (MQ=255) ggAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTc < 2:165798/150‑1 (MQ=255) gagaCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATGTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTcc > 2:856963/1‑150 (MQ=255) aCGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGt < 1:1158894/150‑1 (MQ=255) tGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGa < 1:3962072/150‑1 (MQ=255) ggAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCt < 2:4313583/150‑1 (MQ=255) gAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCCAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTa < 2:3431768/150‑1 (MQ=255) gAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTa < 1:2179322/150‑1 (MQ=255) gAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTa < 2:1523601/150‑1 (MQ=255) cAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACt < 2:2171985/150‑1 (MQ=255) cAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACt > 1:1950981/1‑150 (MQ=255) aaaCTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTcc > 1:3752121/1‑150 (MQ=255) aaCTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCa < 2:439305/150‑1 (MQ=255) aaCTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCa > 1:2966308/1‑150 (MQ=255) cTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGc < 2:1787151/150‑1 (MQ=255) cTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGc > 2:1376158/1‑150 (MQ=255) cGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAg > 1:3024366/1‑150 (MQ=255) cGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAg > 1:3604693/1‑150 (MQ=255) tGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCggt > 2:4160091/1‑148 (MQ=255) tGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGt > 2:1417921/1‑150 (MQ=255) tGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGt > 2:603784/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGtt > 2:3627046/1‑150 (MQ=255) tGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAACAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTTGTTgg < 2:1109901/150‑1 (MQ=255) ttCAAGGCCGAAATGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGtt < 1:2418512/150‑1 (MQ=255) tCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTta > 1:404441/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTta < 2:2433858/150‑1 (MQ=255) cAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTtat < 2:2253053/150‑1 (MQ=255) cAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTtat > 1:946740/1‑150 (MQ=255) ccGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCt > 2:4033337/1‑150 (MQ=255) cGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCtt < 1:1413991/150‑1 (MQ=255) cGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCtt < 1:4115783/150‑1 (MQ=255) cGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCtt > 2:1073813/1‑150 (MQ=255) gAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTa < 1:3509768/150‑1 (MQ=255) aaaTGATTTTGTCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTaa > 1:249198/1‑150 (MQ=255) aaaTGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTaa > 1:1306384/1‑150 (MQ=255) aaTGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAAt > 2:3802184/1‑150 (MQ=255) tGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGc > 1:4387134/1‑150 (MQ=255) gATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCt > 2:2800715/1‑150 (MQ=255) gATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCt < 2:778889/150‑1 (MQ=255) aTTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCta > 1:1115366/1‑150 (MQ=255) tttGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCtaat < 2:1126482/150‑1 (MQ=255) gCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATaaaa > 1:2507623/1‑150 (MQ=255) | ATATGATCCAGATGCACCTACAGGCAGTGGTTGGTGGCATTGGACTGTTGTTAATATTCCAGCAACAGTAACATATTTGCCCGTTGATGCAGGGAGACGTGATGGAACAAAACTGCCGACTGGTGCTGTTCAAGGCCGAAATGATTTTGGCTATGCTGGGTTTGGTGGCGCATGTCCTCCTAAAGGAGATAAACCACATCATTACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAA > CP009273/566561‑566859 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |