Predicted mutation | |||||||
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RA | CP009273 | 569,775 | G→A | 43.1% | V122I (GTT→ATT) | quuD → | DLP12 prophage; putative antitermination protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP009273 | 569,775 | 0 | G | A | 43.1% | 205.3 / inf | 313 | V122I (GTT→ATT) | quuD | DLP12 prophage; putative antitermination protein |
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Only 100 of 322 total aligned reads displayed.
GATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAG > CP009273/569628‑569924 | attattATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCgttg > 1:3634379/1‑150 (MQ=255) attatGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCATTGTta < 2:33264/150‑1 (MQ=255) tatGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTtaat > 2:2265160/1‑150 (MQ=255) 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atCATTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCtt < 1:3402951/150‑1 (MQ=255) gttgttAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAg > 1:4126225/1‑150 (MQ=255) | GATTATTATGTAGTCGGTATGACATTCATGTCACTGGCAGGTAAGCATTGCTGCTCTGATGGTTATATCGGGAAAAGGTTACAGAAGGCTGAGGGCATAATTGAAGGGATGTTAATGGCATTAGATATCCGGTTAGAGATGGATATCGTTGTTAATAACTCTAATTAATATGCCAATTGTTTACTAAAAATTATTAAAAATGGGGCGTTGAGACGCCCCCAAAAATAAAGGGTAATATATAACAGAAGGTTTATATAGTTAGAAGCAAGGTTGTGCTTCTAAAGGAAGTGGCTTGAG > CP009273/569628‑569924 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |