Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 769,421 | C→A | 19.5% | I308I (ATC→ATA) | cydB → | cytochrome d terminal oxidase, subunit II |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 769,421 | 0 | C | A | 19.5% | 737.8 / 116.8 | 255 | I308I (ATC→ATA) | cydB | cytochrome d terminal oxidase, subunit II |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (104/101); new base A (25/25); total (129/126) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
AACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGCCTGGT > CP009273/769275‑769569 | aacaacACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCa > 1:3548401/1‑150 (MQ=255) acaacaCGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCaa > 2:1562474/1‑150 (MQ=255) cacGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATAGCAATGtt < 2:2224147/150‑1 (MQ=255) gCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTccc > 1:224834/1‑150 (MQ=255) ccAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATAGCAATGTTCCCg > 1:2649762/1‑150 (MQ=255) cAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGt > 2:3496578/1‑150 (MQ=255) cAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATAGCAATGTTCCCGt > 2:4058990/1‑150 (MQ=255) aaTTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGtt > 1:1206648/1‑150 (MQ=255) aTTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGttt < 2:2736266/150‑1 (MQ=255) aTTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGttt < 2:4300516/150‑1 (MQ=255) aTTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGCTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGttt < 1:1881727/150‑1 (MQ=255) gtgGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGAt < 1:3673066/150‑1 (MQ=255) gtgGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATAGCAATGTTCCCGTTTGTGAt < 2:15274/150‑1 (MQ=255) gCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCg < 2:1038037/150‑1 (MQ=255) tATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTc > 2:3744086/1‑150 (MQ=255) tATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTc < 2:615752/150‑1 (MQ=255) ttCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCa > 1:4099821/1‑150 (MQ=255) ccGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGc > 2:427064/1‑150 (MQ=255) aCTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCat > 2:790369/1‑150 (MQ=255) aCTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCat < 1:4513800/150‑1 (MQ=255) tGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCatga > 1:2516471/1‑150 (MQ=255) tGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCatga < 2:4638576/150‑1 (MQ=255) gggTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGGTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCatgat < 1:2848120/150‑1 (MQ=255) tgtgGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGaa < 1:4197893/150‑1 (MQ=255) gtgGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAAc < 2:266701/150‑1 (MQ=255) gtgGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAAc < 2:3496422/150‑1 (MQ=255) tgGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACg < 2:1840118/150‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCACGTc > 2:4002233/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTc > 2:311189/1‑150 (MQ=255) cGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGa > 1:3779556/1‑150 (MQ=255) tgctgACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATAGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACaa > 2:2922516/1‑150 (MQ=255) tgACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAAtgt < 2:1137165/150‑1 (MQ=255) gACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATAGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAAtgtg < 2:1813292/150‑1 (MQ=255) 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aTCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGAt < 1:3064784/150‑1 (MQ=255) tCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATg < 1:1677997/150‑1 (MQ=255) tGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCaa > 1:3553429/1‑150 (MQ=255) tGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCaa > 1:3630928/1‑150 (MQ=255) gACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAAc < 1:2639109/150‑1 (MQ=255) 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aTGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTccagccag > 1:225224/1‑150 (MQ=255) tAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGAc < 2:3360125/150‑1 (MQ=255) tAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGAc < 1:3452701/150‑1 (MQ=255) aaaGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCGATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACg < 2:2922676/150‑1 (MQ=255) aaGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGc > 1:606899/1‑150 (MQ=255) 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ttCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGtt < 2:3374476/150‑1 (MQ=255) ttCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGtt > 1:232490/1‑150 (MQ=255) ttCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATAGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGtt < 1:4435715/150‑1 (MQ=255) tctcCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCACGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTg > 2:1995629/1‑150 (MQ=255) cTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATAGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGtt < 2:1359690/150‑1 (MQ=255) 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ggCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTAcc > 1:3851297/1‑150 (MQ=255) ccTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGa < 2:2411551/150‑1 (MQ=255) cTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGAt < 1:104885/150‑1 (MQ=255) cTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGAt > 2:4375506/1‑150 (MQ=255) gCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCa > 1:4043098/1‑150 (MQ=255) 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tGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGctct < 2:3779729/150‑1 (MQ=255) tGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGctct < 2:3779556/150‑1 (MQ=255) tGACAGCCGGTATAGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGctct < 2:2577868/150‑1 (MQ=255) gACAGCCGGTATAGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTa > 1:505080/1‑150 (MQ=255) gACAGCCGGTATAGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTACTCTa > 1:505299/1‑150 (MQ=255) ccGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCg < 2:2516471/150‑1 (MQ=255) ggTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGcc > 1:2128617/1‑150 (MQ=255) ggTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGcc > 1:2921218/1‑150 (MQ=255) ggTATAGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGcc > 2:4608327/1‑150 (MQ=255) tATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGCCTg < 1:3496578/150‑1 (MQ=255) aTCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGCCTgg > 2:2875702/1‑150 (MQ=255) tCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGCCTGgt < 1:1740733/150‑1 (MQ=255) | AACAACACGCCAATTCTGTGGGCTATTCCGGCACTGGGTGTGGTTCTGCCGCTGCTGACCATCCTGACTGCACGTATGGATAAAGCCGCGTGGGCGTTTGTGTTCTCCTCCCTGACGCTGGCCTGCATCATCCTGACAGCCGGTATCGCAATGTTCCCGTTTGTGATGCCGTCCAGCACCATGATGAACGCAAGTCTGACAATGTGGGATGCAACTTCCAGCCAGCTGACGCTTAACGTCATGACCTGGGTTGCGGTGGTTCTGGTACCGATCATTCTGCTCTACACCGCCTGGT > CP009273/769275‑769569 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |