| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,153,110 | T→A | 52.7% | intergenic (+80/‑215) | ycfH → / → ptsG | putative DNase/fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,153,110 | 0 | T | A | 52.7% | 82.5 / inf | 251 | intergenic (+80/‑215) | ycfH/ptsG | putative DNase/fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/65); new base A (60/72); total (114/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
AGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGATGCCCTGTACACGGCGA > CP009273/1152963‑1153258 | aGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGatt < 1:4322792/150‑1 (MQ=255) ggTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTACAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTg < 2:129507/150‑1 (MQ=255) gTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGa < 2:2036607/150‑1 (MQ=255) tAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGaa < 1:512658/150‑1 (MQ=255) aaCCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGaaa > 2:1475185/1‑150 (MQ=255) aaCCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGaaa > 2:1475699/1‑150 (MQ=255) accaccGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAat > 1:1870969/1‑150 (MQ=255) ccGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATtg > 2:4056677/1‑150 (MQ=255) gATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATtgtg < 1:1267741/150‑1 (MQ=255) gATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATtgtg > 1:2741020/1‑150 (MQ=255) aaCTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACa > 1:1522268/1‑150 (MQ=255) aCTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACat < 2:2171131/150‑1 (MQ=255) cTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACata < 2:2350849/150‑1 (MQ=255) cTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACata < 2:838373/150‑1 (MQ=255) tCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATg > 1:1987005/1‑150 (MQ=255) cGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGt < 2:1177712/150‑1 (MQ=255) gCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGtt > 2:3779382/1‑150 (MQ=255) ccGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGtttt > 1:1213014/1‑150 (MQ=255) ccGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGtttt < 2:3067504/150‑1 (MQ=255) tCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAtg < 1:3656828/150‑1 (MQ=255) tCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAtg < 2:2471153/150‑1 (MQ=255) acaTCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAtgtg < 2:3131239/150‑1 (MQ=255) acaTCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAtgtg > 1:1679819/1‑150 (MQ=255) acaTCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAAtgtg > 1:2660823/1‑150 (MQ=255) tCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCATAATGTGCaa > 1:179222/1‑150 (MQ=255) cGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAc < 2:485141/150‑1 (MQ=255) aCGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑tt > 2:3584286/1‑150 (MQ=255) gCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑Ttct < 2:3837352/150‑1 (MQ=255) gCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑Ttct < 1:1703950/150‑1 (MQ=255) gCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑Ttct < 1:4237195/150‑1 (MQ=255) cTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑Ttctc < 1:2117058/150‑1 (MQ=255) ttCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTcc > 1:837221/1‑150 (MQ=255) cccGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCaa < 1:4147837/150‑1 (MQ=255) ccGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAAt < 1:193447/150‑1 (MQ=255) cGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATGTTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATg < 2:3870563/150‑1 (MQ=255) ccTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGAt < 1:223524/150‑1 (MQ=255) cAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGa > 2:4097332/1‑150 (MQ=255) cAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGa > 2:2993462/1‑150 (MQ=255) cAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGa > 2:3292075/1‑150 (MQ=255) aaTCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGaa < 2:1658818/150‑1 (MQ=255) aaTCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGaa > 2:1039933/1‑150 (MQ=255) atccatccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAg < 2:925135/150‑1 (MQ=255) ccatccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGtt < 1:1959438/150‑1 (MQ=255) atccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGa > 1:782615/1‑150 (MQ=255) tccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGaa < 1:246936/150‑1 (MQ=255) ccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGaaa > 2:2797444/1‑150 (MQ=255) ccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGaaa < 1:705396/150‑1 (MQ=255) ccGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATCGCTAAAACTAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAACTTGaaa < 1:38413/150‑1 (MQ=255) gTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACg > 2:1133181/1‑150 (MQ=255) tGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTg > 1:3068901/1‑150 (MQ=255) aTGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATa < 1:62497/150‑1 (MQ=255) aTGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATa < 1:2134510/150‑1 (MQ=255) gTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCg > 1:3979270/1‑150 (MQ=255) ttAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTcaaac > 2:2086868/1‑150 (MQ=255) aaaGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTcaaacaa < 1:413257/150‑1 (MQ=255) aaGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTcaaacaaa < 1:3444575/150‑1 (MQ=255) aaGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTcaaacaaa > 1:2905506/1‑150 (MQ=255) cTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTg < 1:35324/150‑1 (MQ=255) tCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTgg < 1:4489771/150‑1 (MQ=255) cGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGc > 2:2147525/1‑150 (MQ=255) gTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCa > 2:3996706/1‑150 (MQ=255) aattaatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACt < 1:4190768/150‑1 (MQ=255) attaatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAAATGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTg > 2:524736/1‑150 (MQ=255) ttaatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGa > 2:3911321/1‑150 (MQ=255) ttaatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGa < 1:3260747/150‑1 (MQ=255) ttaatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGa < 1:454701/150‑1 (MQ=255) aatGGCTAAAACGAGTAAAGTTCAACGCCGAAAATAGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATAGTTACATATGTTTTGTCAAAATGAGCAAA‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATAGTCACTGAat > 2:4532050/1‑150 (MQ=255) atGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCACCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAatt < 2:2885714/150‑1 (MQ=255) gCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAattatt > 1:253658/1‑150 (MQ=255) cTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTAttt < 1:3505702/150‑1 (MQ=255) tAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTAtttt < 1:4418050/150‑1 (MQ=255) tAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGACGTCAAACAAATTTGCACTGAATTAtttt > 2:4414767/1‑150 (MQ=255) tAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTAGCACTGAATTAtttt > 1:4093947/1‑150 (MQ=255) aaaaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTa > 1:2868240/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTAct > 1:301745/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTAct > 1:2320078/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTAct < 1:2227507/150‑1 (MQ=255) aGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTNAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACNTGATAGCCGNCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCtgt > 1:4283444/1‑150 (MQ=255) gTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCtgtg > 2:3389478/1‑150 (MQ=255) aaaGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGta > 2:4153952/1‑150 (MQ=255) aGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGtaat > 1:4248213/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTaataaata > 1:4534322/1‑150 (MQ=255) ccgAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAgg < 2:4184201/150‑1 (MQ=255) ccgAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAgg < 2:1764553/150‑1 (MQ=255) ccgAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAgg > 1:4484363/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGgcg < 2:462630/150‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGgcgc > 1:3023078/1‑150 (MQ=255) aaaTTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGgcgc > 2:2090187/1‑150 (MQ=255) aaTTGGGCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCt < 1:3287780/150‑1 (MQ=255) ttGGGCGGTGAATAACCTCGATTGAAATATTGTGACTTATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATATGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTa < 1:145018/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAg < 2:3068901/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGAt < 2:2120944/150‑1 (MQ=255) gCGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGATg < 2:2702413/150‑1 (MQ=255) cGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGATGc > 1:3093861/1‑150 (MQ=255) cGGTGAATAACCACGATTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAACTTTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGATg > 2:1977465/1‑150 (MQ=255) aaTAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGATGCCCTGt > 2:3259573/1‑150 (MQ=255) tAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGATGCCCTGTac < 2:4297669/150‑1 (MQ=255) ccACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGATGCCCTGTACACg < 2:782615/150‑1 (MQ=255) cACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCATAATGTGCTAC‑TTCTCCACTGATCTGTAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAAAAAATTGGCACTGTATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGATGCCCTGTacactg < 2:2224995/150‑3 (MQ=255) gTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGATGCCCTGTACACGGCGa > 2:1623641/1‑150 (MQ=255) | AGGTAACCACCGATAACTTCGCCCGTCTGTTTCACATCGACGCTTCCCGCCTTCAATCCATCCGTTGAATGAGTTTTTTTAAAGCTCGTAATTAATGGCTAAAACGAGTAAAGTTCACCGCCGAAAATTGGGCGGTGAATAACCACGTTTGAAATATTGTGACATATGTTTTGTCAAAATGTGCAAC‑TTCTCCAATGATCTGAAGTTGAAACGTGATAGCCGTCAAACAAATTGGCACTGAATTATTTTACTCTGTGTAATAAATAAAGGGCGCTTAGATGCCCTGTACACGGCGA > CP009273/1152963‑1153258 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |