Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | CP009273 | 103,467 | G→T | 100% | D142Y (GAT→TAT) | lpxC → | UDP‑3‑O‑acyl N‑acetylglucosamine deacetylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009273 | 103,467 | 0 | G | T | 98.8% | 847.7 / 1.4 | 249 | D142Y (GAT→TAT) | lpxC | UDP‑3‑O‑acyl N‑acetylglucosamine deacetylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (111/135); total (112/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GTTATCGAAGTTAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCGATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGATTCCAGCAACCAGCGCTATGCGATGAACTTCTCCGCTGATGCGTTTATGCGCCAGATCAGCCGTGCGC > CP009273/103320‑103611 | gTTATCGAAGTTAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTAt > 2:2219452/1‑150 (MQ=255) ttATCGAAGTTAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCtata < 2:4416775/150‑1 (MQ=255) tATCGAAGTTAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATaa > 2:1721307/1‑150 (MQ=255) aTCGAAGTTAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAg < 2:3514031/150‑1 (MQ=255) cGAAGTTAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTg < 2:796032/150‑1 (MQ=255) gAAGTTAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTgg < 2:2119556/150‑1 (MQ=255) gAAGTTAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTgg > 2:2330556/1‑150 (MQ=255) gAAGTTAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTgg > 2:4196883/1‑150 (MQ=255) aaGTTAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTggg < 1:2341087/150‑1 (MQ=255) tAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGa > 2:3324059/1‑150 (MQ=255) tAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGa < 1:4582054/150‑1 (MQ=255) tAACGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGa < 1:252834/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGaa > 1:2201800/1‑150 (MQ=255) cgcgCCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAAtt > 1:637458/1‑150 (MQ=255) cgcCGGAAATCGCGATCATGGTCGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATTCCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTa < 1:4292418/150‑1 (MQ=255) cgcCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTa < 1:3095873/150‑1 (MQ=255) gcCGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTaa > 2:3139427/1‑150 (MQ=255) ccGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAg < 1:2690926/150‑1 (MQ=255) cGGAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGc > 1:3391129/1‑150 (MQ=255) ggAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGcc > 1:900633/1‑150 (MQ=255) ggAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGcc > 1:381134/1‑150 (MQ=255) ggAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGcc > 1:3498234/1‑150 (MQ=255) gAAATCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCg > 1:3772749/1‑150 (MQ=255) aaTCCCGATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTa < 1:2255908/150‑1 (MQ=255) gATCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCGTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATgg > 1:96862/1‑150 (MQ=255) aTCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGt < 2:2263000/150‑1 (MQ=255) tCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAGGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGtt < 1:3556343/150‑1 (MQ=255) tCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGtt < 2:627291/150‑1 (MQ=255) tCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGtt < 1:1568023/150‑1 (MQ=255) tCATGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGtt > 2:221726/1‑150 (MQ=255) aTGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGtttt < 2:477034/150‑1 (MQ=255) tGGACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGttttt < 1:1189791/150‑1 (MQ=255) ggACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTc < 1:3300552/150‑1 (MQ=255) gACGGCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCg > 1:3622469/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTg > 1:2977392/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTg > 2:2580094/1‑150 (MQ=255) aGCGCCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGAt > 1:3350376/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGAtt < 2:2295353/150‑1 (MQ=255) gccgcTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTc < 2:1131354/150‑1 (MQ=255) cgcTCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCAc > 1:1282482/1‑150 (MQ=255) tCCGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCAt > 2:3447631/1‑150 (MQ=255) cGTTTGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCg > 1:1454881/1‑150 (MQ=255) ttGTATACCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGAtt < 1:1509155/150‑1 (MQ=255) taCCTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAAc > 2:1485744/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCa < 1:1425684/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCa > 1:2052688/1‑150 (MQ=255) tgctgcTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATc < 2:779954/150‑1 (MQ=255) tgctgcTTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATc < 2:2463941/150‑1 (MQ=255) gctgctTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATATCACCATCGATTTTAACCATcc < 1:3379539/150‑1 (MQ=255) ctgctTGACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCg > 2:3851817/1‑150 (MQ=255) gtcGCCGGTATCGACGAGTTGCACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGTCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGATGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTAtt < 1:1157957/148‑1 (MQ=255) gACGCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTAtt < 1:3860470/150‑1 (MQ=255) gCCGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGAt < 1:558870/150‑1 (MQ=255) ccGGTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGAtt > 2:3835881/1‑150 (MQ=255) gTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGATTCCa > 1:852124/1‑150 (MQ=255) gTATCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGATTCCa < 2:537948/150‑1 (MQ=255) aTCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGCTTTCACCATCGATTTTAACAATCCGGCTATTGATTCCAga > 2:1987380/1‑149 (MQ=255) aTCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGATTCCAGc < 1:3987260/150‑1 (MQ=255) tCGACGAGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGATTCCAGCa < 1:4376425/150‑1 (MQ=255) gacgaGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGATTCCAGCAAc > 2:1857295/1‑150 (MQ=255) acgaGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGATTCCAGCAAcc < 1:263891/150‑1 (MQ=255) gaGTTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGATTCCAGCAACCAg > 1:3553745/1‑150 (MQ=255) gaGCTGAACTGCGCCAAAAAATTTGTTCGCATCAAAGAGACTGTTCGTGTCGAAGATGGCTATAAGTGGGCTGAATTTAAGCCGTACAATGGTTTTTCGCTGGATTTCACCATCGATTTTAACCATCCGGCTATTGATTCCAGCAACCAg < 1:1442101/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |