| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 1,207,379 | C→T | 33.0% | M27I (ATG→ATA) | iraM ← | RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 1,207,379 | 0 | C | T | 33.0% | 405.7 / 272.7 | 279 | M27I (ATG→ATA) | iraM | RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (84/103); new base T (47/45); total (131/148) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
CTTTTGAGTAAACTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGA > CP009273/1207230‑1207528 | cTTTTGAGTAAACTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATc < 2:1178215/150‑1 (MQ=255) tGAGTAAACTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTAttt > 2:1488760/1‑150 (MQ=255) gAGTAAACTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCAtttt < 1:2616505/150‑1 (MQ=255) aaaCTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCata > 2:1555551/1‑150 (MQ=255) aaCTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCatat < 1:4134568/150‑1 (MQ=255) aCTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATAtt > 2:664499/1‑150 (MQ=255) aCTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATAtt < 1:1328686/150‑1 (MQ=255) aCTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATAtt < 1:4563175/150‑1 (MQ=255) cTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTa < 1:491921/150‑1 (MQ=255) tCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTAc > 2:752449/1‑150 (MQ=255) aTAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTAcccc > 2:4129196/1‑150 (MQ=255) aaTCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCata < 2:1752406/150‑1 (MQ=255) aTCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGGTAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCatat < 1:3430347/150‑1 (MQ=255) tCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATg < 1:3846880/150‑1 (MQ=255) tCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATg < 2:4327613/150‑1 (MQ=255) cTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGc < 1:590134/150‑1 (MQ=255) tgttgAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTg > 2:2669861/1‑150 (MQ=255) tgttgAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTg < 1:2825398/150‑1 (MQ=255) tgttgAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTg > 2:1883697/1‑150 (MQ=255) tgAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGaaa > 2:2635025/1‑150 (MQ=255) gAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGaaaa < 1:3613899/150‑1 (MQ=255) aTGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAg < 2:362292/150‑1 (MQ=255) cGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATAc < 1:454387/150‑1 (MQ=255) gATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATAcc > 1:74638/1‑150 (MQ=255) gATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATAcc < 2:335933/150‑1 (MQ=255) gtgATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACcaca > 2:2530817/1‑150 (MQ=255) gtgATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACcaca > 2:3483655/1‑150 (MQ=255) tgATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACAt < 1:3371616/150‑1 (MQ=255) gATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATg < 2:840515/150‑1 (MQ=255) aTAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGt > 2:406846/1‑150 (MQ=255) aTAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGt < 1:1933238/150‑1 (MQ=255) tAGTAATATGATATTATTTTTCATTAATGATAATACCAGACTTTACCGGTGTAAATATTCTGCCAGGAGGGATAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGtt < 1:3070602/150‑1 (MQ=255) tAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGtt > 1:2425235/1‑150 (MQ=255) gTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGa > 1:3032387/1‑150 (MQ=255) aaTAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAAt > 1:1623369/1‑150 (MQ=255) aaTAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAAt < 1:516144/150‑1 (MQ=255) aaTAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAAt < 1:515827/150‑1 (MQ=255) tAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTa < 1:3660495/150‑1 (MQ=255) atatTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAGTATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCgt > 1:3440822/1‑150 (MQ=255) tatTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCgtg < 1:1035327/150‑1 (MQ=255) atTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCgtgt > 1:1464717/1‑150 (MQ=255) ttCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTc > 1:3562233/1‑150 (MQ=255) tCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCa > 1:1753719/1‑150 (MQ=255) tATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTa < 1:2087403/150‑1 (MQ=255) tATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTa < 2:2483486/150‑1 (MQ=255) tCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACt < 2:981068/150‑1 (MQ=255) cTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTAt < 1:1366578/150‑1 (MQ=255) aGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAGAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCAc > 2:3686029/1‑150 (MQ=255) aGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCAc > 1:4344099/1‑150 (MQ=255) aGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCAc < 1:2208325/150‑1 (MQ=255) ggATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACt < 2:551251/150‑1 (MQ=255) gATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACtt < 2:1804172/150‑1 (MQ=255) ataataCCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTc < 1:3986469/150‑1 (MQ=255) ataataCCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTc > 1:3001932/1‑150 (MQ=255) ataataCCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTc < 2:2760462/150‑1 (MQ=255) aataCCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt > 1:620685/1‑150 (MQ=255) aataCCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAt > 2:1367865/1‑150 (MQ=255) ataCCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCAtt > 1:4632426/1‑150 (MQ=255) ccAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGt > 1:3861559/1‑150 (MQ=255) aGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTa > 1:3884274/1‑150 (MQ=255) cTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGt > 2:2170626/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTAt < 1:2124453/150‑1 (MQ=255) ccGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTAt < 1:1555762/150‑1 (MQ=255) ggTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATcc < 2:437971/150‑1 (MQ=255) tgtAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCa < 2:1040083/150‑1 (MQ=255) aaaTATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACgg > 2:2086561/1‑150 (MQ=255) taCTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTAttt < 1:1427408/150‑1 (MQ=255) tGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACAGGGAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAat > 2:4428334/1‑150 (MQ=255) gCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAata > 2:4194140/1‑150 (MQ=255) aggaggGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATgg < 1:752449/150‑1 (MQ=255) aggaggGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATTTTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATgg < 1:1276003/150‑1 (MQ=255) agggagAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTc < 2:925782/150‑1 (MQ=255) gagaAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCAtt < 2:4527937/150‑1 (MQ=255) gagaAATATAGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCAtt < 1:4198674/150‑1 (MQ=255) gagaAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCAtt < 1:4201819/150‑1 (MQ=255) aaaTATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAgg < 1:3354304/150‑1 (MQ=255) ataGTAGATTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGt > 2:293026/1‑150 (MQ=255) ataGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGt > 1:674031/1‑150 (MQ=255) agtagATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGttt > 1:2166161/1‑150 (MQ=255) tagATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTAt < 2:1681755/150‑1 (MQ=255) tagATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTAt > 2:2561112/1‑150 (MQ=255) agATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTAtt > 1:2647909/1‑150 (MQ=255) agtGATACCTGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGATAAAGATCTACCTCATGTAGGTTTAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTGTTATCCCACGGTATTTAATTTGGTTCATTAGGATGTTTATTTc < 1:1689351/148‑1 (MQ=255) aTTGATACCAGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTc < 2:3617290/150‑1 (MQ=255) aCCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGAtt > 2:3937091/1‑150 (MQ=255) ccAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGAttt > 2:3030085/1‑150 (MQ=255) ccAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGAttt > 2:316117/1‑150 (MQ=255) aGATGATTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTg > 1:3765336/1‑150 (MQ=255) gatgatCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGc > 1:2301397/1‑150 (MQ=255) gatgatCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGc > 1:972252/1‑150 (MQ=255) atgatCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCa < 1:3236949/150‑1 (MQ=255) atgatCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCa < 1:914357/150‑1 (MQ=255) atgatCATGTTCATATTACCCCATATGGCAGAAAAAGATATACCACATGTAGGATGAATTACCGTGTCAATAAATATCCCCTTCATGTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATAGGGTTCATTAGGATGTTTAATTCATGAtatagcc > 1:106876/1‑144 (MQ=255) gatTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCata < 1:1471233/150‑1 (MQ=255) gatTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCata < 1:1324055/150‑1 (MQ=255) gatTATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCata > 1:402418/1‑150 (MQ=255) gatCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCata > 2:1858039/1‑150 (MQ=255) atCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCatat < 2:3562233/150‑1 (MQ=255) atCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCatat < 1:3806086/150‑1 (MQ=255) cATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGa < 2:4280449/150‑1 (MQ=255) | CTTTTGAGTAAACTCCATAAATCCTTGTTGAATGGTGCGATGTGATAAATAGTAATAGGATATTCTTTATCCTTAAGGATAATACCAGACTTAACCGGTGTAAATATACTGCCAGGAGGGAGAAATATAGTAGATTGATACCAGATGATCATTTTCATATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGA > CP009273/1207230‑1207528 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |